Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Odf2A3KGV1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms