Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms