Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CatsperbA2RTF1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms