Protein–RNA interactions for Protein: A2CFD5

Btbd35f28, BTB domain-containing 35, family member 28, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd35f28A2CFD5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Btbd35f28A2CFD5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Btbd35f28A2CFD5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Btbd35f28A2CFD5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Btbd35f28A2CFD5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Btbd35f28A2CFD5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Btbd35f28A2CFD5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Btbd35f28A2CFD5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Btbd35f28A2CFD5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Btbd35f28A2CFD5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Btbd35f28A2CFD5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Btbd35f28A2CFD5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Btbd35f28A2CFD5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Btbd35f28A2CFD5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Btbd35f28A2CFD5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Btbd35f28A2CFD5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Btbd35f28A2CFD5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Btbd35f28A2CFD5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Btbd35f28A2CFD5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Btbd35f28A2CFD5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Btbd35f28A2CFD5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Btbd35f28A2CFD5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Btbd35f28A2CFD5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Btbd35f28A2CFD5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Btbd35f28A2CFD5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Btbd35f28A2CFD5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Btbd35f28A2CFD5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Btbd35f28A2CFD5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Btbd35f28A2CFD5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Btbd35f28A2CFD5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Btbd35f28A2CFD5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Btbd35f28A2CFD5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Btbd35f28A2CFD5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Btbd35f28A2CFD5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Btbd35f28A2CFD5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Btbd35f28A2CFD5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Btbd35f28A2CFD5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Btbd35f28A2CFD5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Btbd35f28A2CFD5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Btbd35f28A2CFD5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Btbd35f28A2CFD5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Btbd35f28A2CFD5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Btbd35f28A2CFD5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Btbd35f28A2CFD5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Btbd35f28A2CFD5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Btbd35f28A2CFD5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Btbd35f28A2CFD5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Btbd35f28A2CFD5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Btbd35f28A2CFD5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Btbd35f28A2CFD5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms