Protein–RNA interactions for Protein: A2BI40

Xlr4a, X-linked lymphocyte-regulated 4A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr4aA2BI40 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xlr4aA2BI40 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xlr4aA2BI40 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xlr4aA2BI40 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Xlr4aA2BI40 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xlr4aA2BI40 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xlr4aA2BI40 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xlr4aA2BI40 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xlr4aA2BI40 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xlr4aA2BI40 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xlr4aA2BI40 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xlr4aA2BI40 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xlr4aA2BI40 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xlr4aA2BI40 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xlr4aA2BI40 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xlr4aA2BI40 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xlr4aA2BI40 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xlr4aA2BI40 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xlr4aA2BI40 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xlr4aA2BI40 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xlr4aA2BI40 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xlr4aA2BI40 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Xlr4aA2BI40 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xlr4aA2BI40 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xlr4aA2BI40 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Xlr4aA2BI40 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xlr4aA2BI40 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xlr4aA2BI40 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xlr4aA2BI40 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xlr4aA2BI40 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xlr4aA2BI40 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xlr4aA2BI40 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xlr4aA2BI40 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Xlr4aA2BI40 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xlr4aA2BI40 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xlr4aA2BI40 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xlr4aA2BI40 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xlr4aA2BI40 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xlr4aA2BI40 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xlr4aA2BI40 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xlr4aA2BI40 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xlr4aA2BI40 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xlr4aA2BI40 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms