Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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