Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms