Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms