Protein–RNA interactions for Protein: A2ALV5

AI481877, Expressed sequence AI481877, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AI481877A2ALV5 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AI481877A2ALV5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AI481877A2ALV5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AI481877A2ALV5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
AI481877A2ALV5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AI481877A2ALV5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AI481877A2ALV5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AI481877A2ALV5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AI481877A2ALV5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AI481877A2ALV5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AI481877A2ALV5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AI481877A2ALV5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
AI481877A2ALV5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AI481877A2ALV5 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
AI481877A2ALV5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
AI481877A2ALV5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AI481877A2ALV5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AI481877A2ALV5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AI481877A2ALV5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AI481877A2ALV5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AI481877A2ALV5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AI481877A2ALV5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AI481877A2ALV5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
AI481877A2ALV5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AI481877A2ALV5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AI481877A2ALV5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AI481877A2ALV5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AI481877A2ALV5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AI481877A2ALV5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AI481877A2ALV5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AI481877A2ALV5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AI481877A2ALV5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms