Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms