Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Frmpd1A2AKB4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms