Protein–RNA interactions for Protein: A2AJN7

Slc4a11, Sodium bicarbonate transporter-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a11A2AJN7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc4a11A2AJN7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc4a11A2AJN7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms