Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prdm12A2AJ77 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prdm12A2AJ77 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prdm12A2AJ77 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prdm12A2AJ77 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prdm12A2AJ77 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prdm12A2AJ77 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prdm12A2AJ77 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prdm12A2AJ77 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prdm12A2AJ77 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prdm12A2AJ77 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prdm12A2AJ77 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prdm12A2AJ77 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prdm12A2AJ77 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms