Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramel3A2AHA7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms