Protein–RNA interactions for Protein: A2ACP1

Ttc39a, Tetratricopeptide repeat protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39aA2ACP1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc39aA2ACP1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc39aA2ACP1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc39aA2ACP1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc39aA2ACP1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc39aA2ACP1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc39aA2ACP1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc39aA2ACP1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc39aA2ACP1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc39aA2ACP1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc39aA2ACP1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc39aA2ACP1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc39aA2ACP1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc39aA2ACP1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc39aA2ACP1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc39aA2ACP1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc39aA2ACP1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc39aA2ACP1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc39aA2ACP1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc39aA2ACP1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc39aA2ACP1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc39aA2ACP1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc39aA2ACP1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc39aA2ACP1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc39aA2ACP1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc39aA2ACP1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc39aA2ACP1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc39aA2ACP1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc39aA2ACP1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc39aA2ACP1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc39aA2ACP1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc39aA2ACP1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc39aA2ACP1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc39aA2ACP1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc39aA2ACP1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc39aA2ACP1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc39aA2ACP1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc39aA2ACP1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc39aA2ACP1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc39aA2ACP1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc39aA2ACP1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc39aA2ACP1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc39aA2ACP1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc39aA2ACP1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms