Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
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