Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms