Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms