Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms