Protein–RNA interactions for Protein: A1L0T3

Ssc4d, Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing group B protein, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc4dA1L0T3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssc4dA1L0T3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ssc4dA1L0T3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ssc4dA1L0T3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssc4dA1L0T3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssc4dA1L0T3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssc4dA1L0T3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssc4dA1L0T3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssc4dA1L0T3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssc4dA1L0T3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssc4dA1L0T3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssc4dA1L0T3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssc4dA1L0T3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssc4dA1L0T3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssc4dA1L0T3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssc4dA1L0T3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssc4dA1L0T3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssc4dA1L0T3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssc4dA1L0T3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssc4dA1L0T3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssc4dA1L0T3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssc4dA1L0T3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms