Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms