Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXJ7

Larp1b, La ribonucleoprotein domain family, member 1B (Fragment), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms