Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Mir124a-1-201ENSMUST00000083663 85 ntBASIC-4,55□□□□□ -3,14
Snx5Q9D8U8 Mir1912-201ENSMUST00000175298 87 ntBASIC-4,57□□□□□ -3,14
Snx5Q9D8U8 Gm24387-201ENSMUST00000104625 90 ntBASIC-4,58□□□□□ -3,14
Snx5Q9D8U8 Gm22540-201ENSMUST00000158168 117 ntBASIC-4,59□□□□□ -3,14
Snx5Q9D8U8 Mir466b-2-201ENSMUST00000103778 82 ntBASIC-4,6□□□□□ -3,15
Snx5Q9D8U8 Gm26306-201ENSMUST00000157773 119 ntBASIC-4,66□□□□□ -3,16
Snx5Q9D8U8 Gm26008-201ENSMUST00000158797 99 ntBASIC-4,68□□□□□ -3,16
Snx5Q9D8U8 Gm26259-201ENSMUST00000104778 97 ntBASIC-4,7□□□□□ -3,16
Snx5Q9D8U8 Mir7681-201ENSMUST00000184834 72 ntBASIC-4,72□□□□□ -3,17
Snx5Q9D8U8 Gm24194-201ENSMUST00000116805 90 ntBASIC-4,76□□□□□ -3,17
Snx5Q9D8U8 Gm25132-201ENSMUST00000082652 107 ntBASIC-4,76□□□□□ -3,17
Snx5Q9D8U8 Gm25950-201ENSMUST00000175331 100 ntBASIC-4,82□□□□□ -3,18
Snx5Q9D8U8 Mir669m-2-201ENSMUST00000158355 98 ntBASIC-4,86□□□□□ -3,19
Snx5Q9D8U8 Gm44303-201ENSMUST00000196348 83 ntBASIC-4,91□□□□□ -3,2
Snx5Q9D8U8 Gm22069-201ENSMUST00000179911 107 ntBASIC-4,94□□□□□ -3,2
Snx5Q9D8U8 n-R5s218-201ENSMUST00000122583 109 ntBASIC-5,08□□□□□ -3,22
Snx5Q9D8U8 Gm25521-201ENSMUST00000158393 108 ntBASIC-5,12□□□□□ -3,23
Snx5Q9D8U8 Gm27671-201ENSMUST00000183739 66 ntBASIC-5,17□□□□□ -3,24
Snx5Q9D8U8 Gm22943-201ENSMUST00000158564 76 ntBASIC-5,21□□□□□ -3,24
Snx5Q9D8U8 Gm27645-201ENSMUST00000183348 77 ntBASIC-5,28□□□□□ -3,25
Snx5Q9D8U8 Gm20473-201ENSMUST00000173064 112 ntBASIC-5,38□□□□□ -3,27
Snx5Q9D8U8 Gm25254-201ENSMUST00000157239 104 ntBASIC-5,45□□□□□ -3,28
Snx5Q9D8U8 Gm25049-201ENSMUST00000158597 73 ntBASIC-5,51□□□□□ -3,29
Snx5Q9D8U8 Gm23210-201ENSMUST00000158668 98 ntBASIC-5,69□□□□□ -3,32
Snx5Q9D8U8 Gm24531-201ENSMUST00000157945 100 ntBASIC-5,88□□□□□ -3,35
Snx5Q9D8U8 Gm25039-201ENSMUST00000082933 107 ntBASIC-6,24□□□□□ -3,41
Snx5Q9D8U8 Gm22593-201ENSMUST00000104245 109 ntBASIC-6,28□□□□□ -3,41
Snx5Q9D8U8 n-R5s214-201ENSMUST00000122494 121 ntBASIC-6,46□□□□□ -3,44
Snx5Q9D8U8 Gm23248-201ENSMUST00000083367 108 ntBASIC-6,6□□□□□ -3,47
Snx5Q9D8U8 AC160976.1-201ENSMUST00000215092 148 ntBASIC-6,72□□□□□ -3,49
Snx5Q9D8U8 Gm25886-201ENSMUST00000157780 114 ntBASIC-7,32□□□□□ -3,58
Snx5Q9D8U8 Gm23125-201ENSMUST00000157651 106 ntBASIC-7,43□□□□□ -3,6
Retrieved 32 of 76,532 protein–RNA pairs in 104,7 ms