Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Mir6395-201ENSMUST00000183885 91 ntBASIC-1,72□□□□□ -2,68
RpainQ9CWY9 Gm26231-201ENSMUST00000175218 67 ntBASIC-1,75□□□□□ -2,69
RpainQ9CWY9 Mir485-201ENSMUST00000093620 73 ntBASIC-1,76□□□□□ -2,69
RpainQ9CWY9 Traj29-201ENSMUST00000103712 60 ntAPPRIS P1 BASIC-1,77□□□□□ -2,69
RpainQ9CWY9 Mir7218-201ENSMUST00000200050 59 ntBASIC-1,77□□□□□ -2,69
RpainQ9CWY9 Gm26125-201ENSMUST00000083357 107 ntBASIC-1,83□□□□□ -2,7
RpainQ9CWY9 Mir154-201ENSMUST00000083514 66 ntBASIC-1,84□□□□□ -2,7
RpainQ9CWY9 Mir467e-201ENSMUST00000103760 87 ntBASIC-1,88□□□□□ -2,71
RpainQ9CWY9 Gm22385-201ENSMUST00000158189 101 ntBASIC-1,89□□□□□ -2,71
RpainQ9CWY9 Gm26307-201ENSMUST00000157767 126 ntBASIC-1,97□□□□□ -2,72
RpainQ9CWY9 Gm22402-201ENSMUST00000174920 110 ntBASIC-1,97□□□□□ -2,72
RpainQ9CWY9 Gm22566-201ENSMUST00000175541 85 ntBASIC-2□□□□□ -2,73
RpainQ9CWY9 Gm44351-201ENSMUST00000200090 95 ntBASIC-2,02□□□□□ -2,73
RpainQ9CWY9 Gm44377-201ENSMUST00000199039 87 ntBASIC-2,07□□□□□ -2,74
RpainQ9CWY9 Gm22183-201ENSMUST00000175420 73 ntBASIC-2,08□□□□□ -2,74
RpainQ9CWY9 Gm25905-201ENSMUST00000158490 101 ntBASIC-2,09□□□□□ -2,74
RpainQ9CWY9 Gm23248-201ENSMUST00000083367 108 ntBASIC-2,09□□□□□ -2,74
RpainQ9CWY9 Gm23751-201ENSMUST00000157583 136 ntBASIC-2,11□□□□□ -2,75
RpainQ9CWY9 Gm27995-201ENSMUST00000184402 100 ntBASIC-2,12□□□□□ -2,75
RpainQ9CWY9 Gm23566-201ENSMUST00000174907 108 ntBASIC-2,16□□□□□ -2,76
RpainQ9CWY9 Gm23210-201ENSMUST00000158668 98 ntBASIC-2,28□□□□□ -2,77
RpainQ9CWY9 Gm25039-201ENSMUST00000082933 107 ntBASIC-2,29□□□□□ -2,78
RpainQ9CWY9 Gm23637-201ENSMUST00000175075 94 ntBASIC-2,35□□□□□ -2,79
RpainQ9CWY9 Mir2136-201ENSMUST00000158781 75 ntBASIC-2,38□□□□□ -2,79
RpainQ9CWY9 Gm23676-201ENSMUST00000157314 105 ntBASIC-2,45□□□□□ -2,8
RpainQ9CWY9 Gm24538-201ENSMUST00000082612 107 ntBASIC-2,53□□□□□ -2,81
RpainQ9CWY9 n-R5s218-201ENSMUST00000122583 109 ntBASIC-2,7□□□□□ -2,84
RpainQ9CWY9 Mir335-201ENSMUST00000083567 98 ntBASIC-2,71□□□□□ -2,84
RpainQ9CWY9 Gm25297-201ENSMUST00000175490 67 ntBASIC-2,74□□□□□ -2,85
RpainQ9CWY9 n-R5s155-201ENSMUST00000122531 113 ntBASIC-2,8□□□□□ -2,86
RpainQ9CWY9 n-R5s214-201ENSMUST00000122494 121 ntBASIC-2,93□□□□□ -2,88
RpainQ9CWY9 Mir351-201ENSMUST00000083569 99 ntBASIC-2,95□□□□□ -2,88
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