Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm27671-201ENSMUST00000183739 66 ntBASIC-3,06□□□□□ -2,9
Chmp3Q9CQ10 Mir467e-201ENSMUST00000103760 87 ntBASIC-3,11□□□□□ -2,91
Chmp3Q9CQ10 Mir154-201ENSMUST00000083514 66 ntBASIC-3,19□□□□□ -2,92
Chmp3Q9CQ10 Gm22402-201ENSMUST00000174920 110 ntBASIC-3,23□□□□□ -2,93
Chmp3Q9CQ10 Gm26125-201ENSMUST00000083357 107 ntBASIC-3,24□□□□□ -2,93
Chmp3Q9CQ10 Gm23335-201ENSMUST00000117021 90 ntBASIC-3,25□□□□□ -2,93
Chmp3Q9CQ10 Gm44351-201ENSMUST00000200090 95 ntBASIC-3,25□□□□□ -2,93
Chmp3Q9CQ10 Gm26307-201ENSMUST00000157767 126 ntBASIC-3,29□□□□□ -2,94
Chmp3Q9CQ10 Gm23751-201ENSMUST00000157583 136 ntBASIC-3,35□□□□□ -2,95
Chmp3Q9CQ10 Gm44377-201ENSMUST00000199039 87 ntBASIC-3,35□□□□□ -2,95
Chmp3Q9CQ10 Gm22183-201ENSMUST00000175420 73 ntBASIC-3,36□□□□□ -2,95
Chmp3Q9CQ10 Mir7218-201ENSMUST00000200050 59 ntBASIC-3,38□□□□□ -2,95
Chmp3Q9CQ10 Gm22385-201ENSMUST00000158189 101 ntBASIC-3,39□□□□□ -2,95
Chmp3Q9CQ10 Gm23421-201ENSMUST00000158934 104 ntBASIC-3,42□□□□□ -2,96
Chmp3Q9CQ10 Gm27995-201ENSMUST00000184402 100 ntBASIC-3,45□□□□□ -2,96
Chmp3Q9CQ10 Gm23566-201ENSMUST00000174907 108 ntBASIC-3,48□□□□□ -2,97
Chmp3Q9CQ10 Traj29-201ENSMUST00000103712 60 ntAPPRIS P1 BASIC-3,6□□□□□ -2,99
Chmp3Q9CQ10 Gm23637-201ENSMUST00000175075 94 ntBASIC-3,76□□□□□ -3,01
Chmp3Q9CQ10 Gm23248-201ENSMUST00000083367 108 ntBASIC-3,82□□□□□ -3,02
Chmp3Q9CQ10 Gm22566-201ENSMUST00000175541 85 ntBASIC-3,85□□□□□ -3,03
Chmp3Q9CQ10 Gm23210-201ENSMUST00000158668 98 ntBASIC-3,91□□□□□ -3,04
Chmp3Q9CQ10 Mir2136-201ENSMUST00000158781 75 ntBASIC-3,95□□□□□ -3,04
Chmp3Q9CQ10 Gm24538-201ENSMUST00000082612 107 ntBASIC-4,03□□□□□ -3,05
Chmp3Q9CQ10 Gm25039-201ENSMUST00000082933 107 ntBASIC-4,04□□□□□ -3,06
Chmp3Q9CQ10 Gm23676-201ENSMUST00000157314 105 ntBASIC-4,13□□□□□ -3,07
Chmp3Q9CQ10 Gm25905-201ENSMUST00000158490 101 ntBASIC-4,3□□□□□ -3,1
Chmp3Q9CQ10 Mir335-201ENSMUST00000083567 98 ntBASIC-4,33□□□□□ -3,1
Chmp3Q9CQ10 Gm25297-201ENSMUST00000175490 67 ntBASIC-4,41□□□□□ -3,12
Chmp3Q9CQ10 n-R5s218-201ENSMUST00000122583 109 ntBASIC-4,44□□□□□ -3,12
Chmp3Q9CQ10 Mir351-201ENSMUST00000083569 99 ntBASIC-4,7□□□□□ -3,16
Chmp3Q9CQ10 n-R5s214-201ENSMUST00000122494 121 ntBASIC-4,94□□□□□ -3,2
Chmp3Q9CQ10 n-R5s155-201ENSMUST00000122531 113 ntBASIC-5,58□□□□□ -3,3
Retrieved 32 of 76,532 protein–RNA pairs in 5,9 ms