Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gm44303-201ENSMUST00000196348 83 ntBASIC-3,88□□□□□ -3,03
Snx8Q8CFD4 Mir669m-2-201ENSMUST00000158355 98 ntBASIC-3,94□□□□□ -3,04
Snx8Q8CFD4 Gm25521-201ENSMUST00000158393 108 ntBASIC-3,95□□□□□ -3,04
Snx8Q8CFD4 Mir34c-201ENSMUST00000083653 77 ntBASIC-3,95□□□□□ -3,04
Snx8Q8CFD4 Mir466l-201ENSMUST00000104866 121 ntBASIC-3,96□□□□□ -3,04
Snx8Q8CFD4 Gm25254-201ENSMUST00000157239 104 ntBASIC-3,97□□□□□ -3,04
Snx8Q8CFD4 Gm24194-201ENSMUST00000116805 90 ntBASIC-4,01□□□□□ -3,05
Snx8Q8CFD4 Gm25524-201ENSMUST00000101821 107 ntBASIC-4,02□□□□□ -3,05
Snx8Q8CFD4 Gm25132-201ENSMUST00000082652 107 ntBASIC-4,04□□□□□ -3,06
Snx8Q8CFD4 Gm24396-201ENSMUST00000116905 93 ntBASIC-4,05□□□□□ -3,06
Snx8Q8CFD4 Gm25354-201ENSMUST00000179110 105 ntBASIC-4,05□□□□□ -3,06
Snx8Q8CFD4 Gm26259-201ENSMUST00000104778 97 ntBASIC-4,11□□□□□ -3,07
Snx8Q8CFD4 Gm23826-201ENSMUST00000157394 119 ntBASIC-4,14□□□□□ -3,07
Snx8Q8CFD4 Gm22067-201ENSMUST00000122790 107 ntBASIC-4,28□□□□□ -3,09
Snx8Q8CFD4 Gm23237-201ENSMUST00000104639 92 ntBASIC-4,33□□□□□ -3,1
Snx8Q8CFD4 Gm25049-201ENSMUST00000158597 73 ntBASIC-4,35□□□□□ -3,11
Snx8Q8CFD4 n-R5s214-201ENSMUST00000122494 121 ntBASIC-4,36□□□□□ -3,11
Snx8Q8CFD4 Gm25039-201ENSMUST00000082933 107 ntBASIC-4,38□□□□□ -3,11
Snx8Q8CFD4 Gm20473-201ENSMUST00000173064 112 ntBASIC-4,48□□□□□ -3,13
Snx8Q8CFD4 Gm22033-201ENSMUST00000116947 90 ntBASIC-4,62□□□□□ -3,15
Snx8Q8CFD4 Gm23248-201ENSMUST00000083367 108 ntBASIC-4,8□□□□□ -3,18
Snx8Q8CFD4 Gm25950-201ENSMUST00000175331 100 ntBASIC-4,81□□□□□ -3,18
Snx8Q8CFD4 Gm22540-201ENSMUST00000158168 117 ntBASIC-4,85□□□□□ -3,19
Snx8Q8CFD4 Gm25045-201ENSMUST00000122670 99 ntBASIC-4,9□□□□□ -3,19
Snx8Q8CFD4 Gm24531-201ENSMUST00000157945 100 ntBASIC-4,99□□□□□ -3,21
Snx8Q8CFD4 Gm22593-201ENSMUST00000104245 109 ntBASIC-5,26□□□□□ -3,25
Snx8Q8CFD4 Gm22069-201ENSMUST00000179911 107 ntBASIC-5,33□□□□□ -3,26
Snx8Q8CFD4 Gm22943-201ENSMUST00000158564 76 ntBASIC-5,48□□□□□ -3,29
Snx8Q8CFD4 Gm23125-201ENSMUST00000157651 106 ntBASIC-5,84□□□□□ -3,34
Snx8Q8CFD4 AC160976.1-201ENSMUST00000215092 148 ntBASIC-5,99□□□□□ -3,37
Snx8Q8CFD4 Gm27645-201ENSMUST00000183348 77 ntBASIC-6,02□□□□□ -3,37
Snx8Q8CFD4 Gm25886-201ENSMUST00000157780 114 ntBASIC-6,24□□□□□ -3,41
Retrieved 32 of 76,532 protein–RNA pairs in 114 ms