Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Gm25354-201ENSMUST00000179110 105 ntBASIC-4,8□□□□□ -3,18
SvipQ3UZP4 Mir7681-201ENSMUST00000184834 72 ntBASIC-4,82□□□□□ -3,18
SvipQ3UZP4 Mir6905-201ENSMUST00000184228 70 ntBASIC-4,85□□□□□ -3,19
SvipQ3UZP4 Gm22033-201ENSMUST00000116947 90 ntBASIC-4,93□□□□□ -3,2
SvipQ3UZP4 Gm23237-201ENSMUST00000104639 92 ntBASIC-4,96□□□□□ -3,2
SvipQ3UZP4 Gm24194-201ENSMUST00000116805 90 ntBASIC-4,96□□□□□ -3,2
SvipQ3UZP4 Gm25132-201ENSMUST00000082652 107 ntBASIC-4,99□□□□□ -3,21
SvipQ3UZP4 Mir669m-2-201ENSMUST00000158355 98 ntBASIC-5,03□□□□□ -3,21
SvipQ3UZP4 Gm27671-201ENSMUST00000183739 66 ntBASIC-5,04□□□□□ -3,22
SvipQ3UZP4 Gm44303-201ENSMUST00000196348 83 ntBASIC-5,04□□□□□ -3,22
SvipQ3UZP4 Gm25521-201ENSMUST00000158393 108 ntBASIC-5,05□□□□□ -3,22
SvipQ3UZP4 Gm26259-201ENSMUST00000104778 97 ntBASIC-5,13□□□□□ -3,23
SvipQ3UZP4 Gm25045-201ENSMUST00000122670 99 ntBASIC-5,25□□□□□ -3,25
SvipQ3UZP4 n-R5s218-201ENSMUST00000122583 109 ntBASIC-5,33□□□□□ -3,26
SvipQ3UZP4 Gm25254-201ENSMUST00000157239 104 ntBASIC-5,38□□□□□ -3,27
SvipQ3UZP4 Gm22540-201ENSMUST00000158168 117 ntBASIC-5,38□□□□□ -3,27
SvipQ3UZP4 Gm23210-201ENSMUST00000158668 98 ntBASIC-5,41□□□□□ -3,28
SvipQ3UZP4 n-R5s155-201ENSMUST00000122531 113 ntBASIC-5,46□□□□□ -3,28
SvipQ3UZP4 Gm25049-201ENSMUST00000158597 73 ntBASIC-5,54□□□□□ -3,3
SvipQ3UZP4 Gm20473-201ENSMUST00000173064 112 ntBASIC-5,61□□□□□ -3,31
SvipQ3UZP4 Gm25950-201ENSMUST00000175331 100 ntBASIC-5,66□□□□□ -3,32
SvipQ3UZP4 Gm22069-201ENSMUST00000179911 107 ntBASIC-5,78□□□□□ -3,33
SvipQ3UZP4 Gm25039-201ENSMUST00000082933 107 ntBASIC-5,94□□□□□ -3,36
SvipQ3UZP4 n-R5s214-201ENSMUST00000122494 121 ntBASIC-6,19□□□□□ -3,4
SvipQ3UZP4 Gm22943-201ENSMUST00000158564 76 ntBASIC-6,21□□□□□ -3,4
SvipQ3UZP4 Gm27645-201ENSMUST00000183348 77 ntBASIC-6,31□□□□□ -3,42
SvipQ3UZP4 Gm24531-201ENSMUST00000157945 100 ntBASIC-6,34□□□□□ -3,42
SvipQ3UZP4 Gm23248-201ENSMUST00000083367 108 ntBASIC-6,42□□□□□ -3,44
SvipQ3UZP4 Gm22593-201ENSMUST00000104245 109 ntBASIC-6,61□□□□□ -3,47
SvipQ3UZP4 AC160976.1-201ENSMUST00000215092 148 ntBASIC-7,43□□□□□ -3,6
SvipQ3UZP4 Gm23125-201ENSMUST00000157651 106 ntBASIC-7,62□□□□□ -3,63
SvipQ3UZP4 Gm25886-201ENSMUST00000157780 114 ntBASIC-7,83□□□□□ -3,66
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