Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm24194-201ENSMUST00000116805 90 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
Sh3bp1P55194 Mir6395-201ENSMUST00000183885 91 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
Sh3bp1P55194 Gm26307-201ENSMUST00000157767 126 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
Sh3bp1P55194 Gm24387-201ENSMUST00000104625 90 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
Sh3bp1P55194 Gm27882-201ENSMUST00000184904 74 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
Sh3bp1P55194 Mir124a-1-201ENSMUST00000083663 85 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
Sh3bp1P55194 Mir466b-2-201ENSMUST00000103778 82 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
Sh3bp1P55194 Mir669m-2-201ENSMUST00000158355 98 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
Sh3bp1P55194 Mir7681-201ENSMUST00000184834 72 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
Sh3bp1P55194 Gm44303-201ENSMUST00000196348 83 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
Sh3bp1P55194 Mir2136-201ENSMUST00000158781 75 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
Sh3bp1P55194 Mir154-201ENSMUST00000083514 66 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
Sh3bp1P55194 Gm25867-201ENSMUST00000158254 103 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
Sh3bp1P55194 n-R5s218-201ENSMUST00000122583 109 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
Sh3bp1P55194 Mir1912-201ENSMUST00000175298 87 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
Sh3bp1P55194 Mir1906-1-201ENSMUST00000122586 80 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
Sh3bp1P55194 Mir1906-2-201ENSMUST00000122610 80 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
Sh3bp1P55194 Gm24531-201ENSMUST00000157945 100 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
Sh3bp1P55194 Gm26008-201ENSMUST00000158797 99 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
Sh3bp1P55194 Gm20473-201ENSMUST00000173064 112 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
Sh3bp1P55194 Gm25049-201ENSMUST00000158597 73 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
Sh3bp1P55194 AC160976.1-201ENSMUST00000215092 148 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
Sh3bp1P55194 Gm23210-201ENSMUST00000158668 98 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
Sh3bp1P55194 Gm25521-201ENSMUST00000158393 108 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
Sh3bp1P55194 Gm27671-201ENSMUST00000183739 66 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
Sh3bp1P55194 Gm25254-201ENSMUST00000157239 104 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
Sh3bp1P55194 Gm22593-201ENSMUST00000104245 109 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
Sh3bp1P55194 Gm25886-201ENSMUST00000157780 114 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
Sh3bp1P55194 n-R5s214-201ENSMUST00000122494 121 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
Sh3bp1P55194 Gm25039-201ENSMUST00000082933 107 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
Sh3bp1P55194 Gm23248-201ENSMUST00000083367 108 ntBASIC-4.33□□□□□ -3.1
Sh3bp1P55194 Gm23125-201ENSMUST00000157651 106 ntBASIC-4.51□□□□□ -3.13
Retrieved 32 of 76,532 protein–RNA pairs in 6.7 ms