Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm26259-201ENSMUST00000104778 97 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
Hoxd10P28359 Mir351-201ENSMUST00000083569 99 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
Hoxd10P28359 Mir2136-201ENSMUST00000158781 75 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
Hoxd10P28359 Mir466b-2-201ENSMUST00000103778 82 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
Hoxd10P28359 Mir1906-1-201ENSMUST00000122586 80 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
Hoxd10P28359 Mir1906-2-201ENSMUST00000122610 80 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
Hoxd10P28359 Gm25867-201ENSMUST00000158254 103 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
Hoxd10P28359 Mir1912-201ENSMUST00000175298 87 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
Hoxd10P28359 Gm26008-201ENSMUST00000158797 99 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
Hoxd10P28359 Gm26306-201ENSMUST00000157773 119 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
Hoxd10P28359 Gm23676-201ENSMUST00000157314 105 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
Hoxd10P28359 Mir7681-201ENSMUST00000184834 72 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
Hoxd10P28359 Gm25132-201ENSMUST00000082652 107 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
Hoxd10P28359 Gm24194-201ENSMUST00000116805 90 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
Hoxd10P28359 Mir669m-2-201ENSMUST00000158355 98 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
Hoxd10P28359 Gm44303-201ENSMUST00000196348 83 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
Hoxd10P28359 Gm27671-201ENSMUST00000183739 66 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
Hoxd10P28359 n-R5s218-201ENSMUST00000122583 109 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
Hoxd10P28359 Gm25521-201ENSMUST00000158393 108 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
Hoxd10P28359 Gm23210-201ENSMUST00000158668 98 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
Hoxd10P28359 Gm25254-201ENSMUST00000157239 104 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
Hoxd10P28359 Gm20473-201ENSMUST00000173064 112 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
Hoxd10P28359 Gm24531-201ENSMUST00000157945 100 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
Hoxd10P28359 n-R5s155-201ENSMUST00000122531 113 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
Hoxd10P28359 Gm25049-201ENSMUST00000158597 73 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
Hoxd10P28359 Gm25039-201ENSMUST00000082933 107 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
Hoxd10P28359 n-R5s214-201ENSMUST00000122494 121 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
Hoxd10P28359 Gm22593-201ENSMUST00000104245 109 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
Hoxd10P28359 AC160976.1-201ENSMUST00000215092 148 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
Hoxd10P28359 Gm23248-201ENSMUST00000083367 108 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
Hoxd10P28359 Gm25886-201ENSMUST00000157780 114 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
Hoxd10P28359 Gm23125-201ENSMUST00000157651 106 ntBASIC-4.61□□□□□ -3.15
Retrieved 32 of 76,532 protein–RNA pairs in 165.4 ms