Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Mir1906-2-201ENSMUST00000122610 80 ntBASIC-3,02□□□□□ -2,89
Ccl20O89093 Gm22943-201ENSMUST00000158564 76 ntBASIC-3,03□□□□□ -2,89
Ccl20O89093 Gm25132-201ENSMUST00000082652 107 ntBASIC-3,03□□□□□ -2,89
Ccl20O89093 Gm25705-201ENSMUST00000083119 104 ntBASIC-3,04□□□□□ -2,9
Ccl20O89093 Gm24194-201ENSMUST00000116805 90 ntBASIC-3,05□□□□□ -2,9
Ccl20O89093 Gm26008-201ENSMUST00000158797 99 ntBASIC-3,05□□□□□ -2,9
Ccl20O89093 Mir335-201ENSMUST00000083567 98 ntBASIC-3,06□□□□□ -2,9
Ccl20O89093 Mir669m-2-201ENSMUST00000158355 98 ntBASIC-3,07□□□□□ -2,9
Ccl20O89093 Gm44303-201ENSMUST00000196348 83 ntBASIC-3,08□□□□□ -2,9
Ccl20O89093 Mir1912-201ENSMUST00000175298 87 ntBASIC-3,14□□□□□ -2,91
Ccl20O89093 Mir2136-201ENSMUST00000158781 75 ntBASIC-3,17□□□□□ -2,92
Ccl20O89093 Gm25297-201ENSMUST00000175490 67 ntBASIC-3,22□□□□□ -2,92
Ccl20O89093 Mir351-201ENSMUST00000083569 99 ntBASIC-3,31□□□□□ -2,94
Ccl20O89093 Gm25521-201ENSMUST00000158393 108 ntBASIC-3,36□□□□□ -2,95
Ccl20O89093 Gm27671-201ENSMUST00000183739 66 ntBASIC-3,36□□□□□ -2,95
Ccl20O89093 Gm23335-201ENSMUST00000117021 90 ntBASIC-3,42□□□□□ -2,96
Ccl20O89093 Gm25905-201ENSMUST00000158490 101 ntBASIC-3,42□□□□□ -2,96
Ccl20O89093 Gm20473-201ENSMUST00000173064 112 ntBASIC-3,43□□□□□ -2,96
Ccl20O89093 Gm25254-201ENSMUST00000157239 104 ntBASIC-3,47□□□□□ -2,96
Ccl20O89093 Gm23676-201ENSMUST00000157314 105 ntBASIC-3,5□□□□□ -2,97
Ccl20O89093 Gm25049-201ENSMUST00000158597 73 ntBASIC-3,54□□□□□ -2,98
Ccl20O89093 Gm24531-201ENSMUST00000157945 100 ntBASIC-3,6□□□□□ -2,99
Ccl20O89093 n-R5s218-201ENSMUST00000122583 109 ntBASIC-3,65□□□□□ -2,99
Ccl20O89093 Gm23210-201ENSMUST00000158668 98 ntBASIC-3,67□□□□□ -3
Ccl20O89093 Gm22593-201ENSMUST00000104245 109 ntBASIC-3,98□□□□□ -3,05
Ccl20O89093 n-R5s155-201ENSMUST00000122531 113 ntBASIC-4,1□□□□□ -3,07
Ccl20O89093 Gm25039-201ENSMUST00000082933 107 ntBASIC-4,1□□□□□ -3,07
Ccl20O89093 AC160976.1-201ENSMUST00000215092 148 ntBASIC-4,13□□□□□ -3,07
Ccl20O89093 Gm23248-201ENSMUST00000083367 108 ntBASIC-4,3□□□□□ -3,1
Ccl20O89093 n-R5s214-201ENSMUST00000122494 121 ntBASIC-4,32□□□□□ -3,1
Ccl20O89093 Gm25886-201ENSMUST00000157780 114 ntBASIC-4,54□□□□□ -3,14
Ccl20O89093 Gm23125-201ENSMUST00000157651 106 ntBASIC-4,69□□□□□ -3,16
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