Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Gm22540-201ENSMUST00000158168 117 ntBASIC-5,98□□□□□ -3,37
ApobE9Q414 Mir6481-201ENSMUST00000184617 110 ntBASIC-6,01□□□□□ -3,37
ApobE9Q414 Gm24835-201ENSMUST00000116777 111 ntBASIC-6,03□□□□□ -3,38
ApobE9Q414 Gm26092-201ENSMUST00000179798 97 ntBASIC-6,04□□□□□ -3,38
ApobE9Q414 Mir669a-1-201ENSMUST00000180238 97 ntBASIC-6,04□□□□□ -3,38
ApobE9Q414 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC-6,07□□□□□ -3,38
ApobE9Q414 AC160976.1-201ENSMUST00000215092 148 ntBASIC-6,11□□□□□ -3,39
ApobE9Q414 Gm23852-201ENSMUST00000158376 77 ntBASIC-6,14□□□□□ -3,39
ApobE9Q414 Gm22381-201ENSMUST00000158186 107 ntBASIC-6,16□□□□□ -3,4
ApobE9Q414 Gm22033-201ENSMUST00000116947 90 ntBASIC-6,17□□□□□ -3,4
ApobE9Q414 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC-6,34□□□□□ -3,42
ApobE9Q414 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC-6,35□□□□□ -3,43
ApobE9Q414 Mir467g-201ENSMUST00000116906 120 ntBASIC-6,48□□□□□ -3,45
ApobE9Q414 Mir297a-2-201ENSMUST00000103795 90 ntBASIC-6,5□□□□□ -3,45
ApobE9Q414 Gm25045-201ENSMUST00000122670 99 ntBASIC-6,59□□□□□ -3,46
ApobE9Q414 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC-6,6□□□□□ -3,47
ApobE9Q414 Gm24586-201ENSMUST00000116695 89 ntBASIC-6,6□□□□□ -3,47
ApobE9Q414 Gm25886-201ENSMUST00000157780 114 ntBASIC-6,69□□□□□ -3,48
ApobE9Q414 Gm22069-201ENSMUST00000179911 107 ntBASIC-6,73□□□□□ -3,49
ApobE9Q414 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC-6,79□□□□□ -3,5
ApobE9Q414 Gm23653-201ENSMUST00000116751 97 ntBASIC-6,81□□□□□ -3,5
ApobE9Q414 Gm25315-201ENSMUST00000116823 121 ntBASIC-6,83□□□□□ -3,5
ApobE9Q414 Mir669l-201ENSMUST00000103771 98 ntBASIC-6,91□□□□□ -3,52
ApobE9Q414 Gm22195-201ENSMUST00000116861 108 ntBASIC-7,02□□□□□ -3,53
ApobE9Q414 Mir7116-201ENSMUST00000195956 70 ntBASIC-7,04□□□□□ -3,54
ApobE9Q414 Gm25428-201ENSMUST00000157608 114 ntBASIC-7,05□□□□□ -3,54
ApobE9Q414 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC-7,1□□□□□ -3,55
ApobE9Q414 Gm22943-201ENSMUST00000158564 76 ntBASIC-7,32□□□□□ -3,58
ApobE9Q414 AL929417.1-201ENSMUST00000214901 124 ntBASIC-7,46□□□□□ -3,6
ApobE9Q414 Gm44385-201ENSMUST00000198781 81 ntBASIC-7,52□□□□□ -3,61
ApobE9Q414 Gm44353-201ENSMUST00000200618 138 ntBASIC-8,24□□□□□ -3,73
ApobE9Q414 Gm27645-201ENSMUST00000183348 77 ntBASIC-8,56□□□□□ -3,78
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