Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Gm24396-201ENSMUST00000116905 93 ntBASIC-5,03□□□□□ -3,22
Ccdc171E9Q1U1 Mir7116-201ENSMUST00000195956 70 ntBASIC-5,05□□□□□ -3,22
Ccdc171E9Q1U1 Mir466l-201ENSMUST00000104866 121 ntBASIC-5,06□□□□□ -3,22
Ccdc171E9Q1U1 Mir34c-201ENSMUST00000083653 77 ntBASIC-5,06□□□□□ -3,22
Ccdc171E9Q1U1 Gm25354-201ENSMUST00000179110 105 ntBASIC-5,07□□□□□ -3,22
Ccdc171E9Q1U1 Gm23248-201ENSMUST00000083367 108 ntBASIC-5,13□□□□□ -3,23
Ccdc171E9Q1U1 Gm20473-201ENSMUST00000173064 112 ntBASIC-5,17□□□□□ -3,24
Ccdc171E9Q1U1 Gm23826-201ENSMUST00000157394 119 ntBASIC-5,2□□□□□ -3,24
Ccdc171E9Q1U1 Mir297a-2-201ENSMUST00000103795 90 ntBASIC-5,23□□□□□ -3,25
Ccdc171E9Q1U1 Gm22067-201ENSMUST00000122790 107 ntBASIC-5,35□□□□□ -3,27
Ccdc171E9Q1U1 Gm44353-201ENSMUST00000200618 138 ntBASIC-5,4□□□□□ -3,27
Ccdc171E9Q1U1 Gm24482-201ENSMUST00000117005 93 ntBASIC-5,41□□□□□ -3,28
Ccdc171E9Q1U1 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC-5,42□□□□□ -3,28
Ccdc171E9Q1U1 Gm22381-201ENSMUST00000158186 107 ntBASIC-5,42□□□□□ -3,28
Ccdc171E9Q1U1 Gm23237-201ENSMUST00000104639 92 ntBASIC-5,45□□□□□ -3,28
Ccdc171E9Q1U1 AL929417.1-201ENSMUST00000214901 124 ntBASIC-5,6□□□□□ -3,31
Ccdc171E9Q1U1 Gm24586-201ENSMUST00000116695 89 ntBASIC-5,64□□□□□ -3,31
Ccdc171E9Q1U1 Gm24531-201ENSMUST00000157945 100 ntBASIC-5,82□□□□□ -3,34
Ccdc171E9Q1U1 Gm22033-201ENSMUST00000116947 90 ntBASIC-5,97□□□□□ -3,36
Ccdc171E9Q1U1 Gm25950-201ENSMUST00000175331 100 ntBASIC-5,97□□□□□ -3,36
Ccdc171E9Q1U1 Gm25428-201ENSMUST00000157608 114 ntBASIC-5,99□□□□□ -3,37
Ccdc171E9Q1U1 Gm22593-201ENSMUST00000104245 109 ntBASIC-6,06□□□□□ -3,38
Ccdc171E9Q1U1 Gm22540-201ENSMUST00000158168 117 ntBASIC-6,13□□□□□ -3,39
Ccdc171E9Q1U1 Gm23653-201ENSMUST00000116751 97 ntBASIC-6,21□□□□□ -3,4
Ccdc171E9Q1U1 Gm25045-201ENSMUST00000122670 99 ntBASIC-6,23□□□□□ -3,41
Ccdc171E9Q1U1 Gm44385-201ENSMUST00000198781 81 ntBASIC-6,41□□□□□ -3,44
Ccdc171E9Q1U1 Gm23125-201ENSMUST00000157651 106 ntBASIC-6,52□□□□□ -3,45
Ccdc171E9Q1U1 Gm22069-201ENSMUST00000179911 107 ntBASIC-6,74□□□□□ -3,49
Ccdc171E9Q1U1 AC160976.1-201ENSMUST00000215092 148 ntBASIC-6,76□□□□□ -3,49
Ccdc171E9Q1U1 Gm22943-201ENSMUST00000158564 76 ntBASIC-6,96□□□□□ -3,52
Ccdc171E9Q1U1 Gm25886-201ENSMUST00000157780 114 ntBASIC-7,25□□□□□ -3,57
Ccdc171E9Q1U1 Gm27645-201ENSMUST00000183348 77 ntBASIC-7,89□□□□□ -3,67
Retrieved 32 of 76,532 protein–RNA pairs in 5,8 ms