Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Gm24396-201ENSMUST00000116905 93 ntBASIC-5.03□□□□□ -3.22
Ccdc171E9Q1U1 Mir7116-201ENSMUST00000195956 70 ntBASIC-5.05□□□□□ -3.22
Ccdc171E9Q1U1 Mir466l-201ENSMUST00000104866 121 ntBASIC-5.06□□□□□ -3.22
Ccdc171E9Q1U1 Mir34c-201ENSMUST00000083653 77 ntBASIC-5.06□□□□□ -3.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm25354-201ENSMUST00000179110 105 ntBASIC-5.07□□□□□ -3.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm23248-201ENSMUST00000083367 108 ntBASIC-5.13□□□□□ -3.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm20473-201ENSMUST00000173064 112 ntBASIC-5.17□□□□□ -3.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm23826-201ENSMUST00000157394 119 ntBASIC-5.2□□□□□ -3.24
Ccdc171E9Q1U1 Mir297a-2-201ENSMUST00000103795 90 ntBASIC-5.23□□□□□ -3.25
Ccdc171E9Q1U1 Gm22067-201ENSMUST00000122790 107 ntBASIC-5.35□□□□□ -3.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm44353-201ENSMUST00000200618 138 ntBASIC-5.4□□□□□ -3.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm24482-201ENSMUST00000117005 93 ntBASIC-5.41□□□□□ -3.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC-5.42□□□□□ -3.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm22381-201ENSMUST00000158186 107 ntBASIC-5.42□□□□□ -3.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm23237-201ENSMUST00000104639 92 ntBASIC-5.45□□□□□ -3.28
Ccdc171E9Q1U1 AL929417.1-201ENSMUST00000214901 124 ntBASIC-5.6□□□□□ -3.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm24586-201ENSMUST00000116695 89 ntBASIC-5.64□□□□□ -3.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm24531-201ENSMUST00000157945 100 ntBASIC-5.82□□□□□ -3.34
Ccdc171E9Q1U1 Gm22033-201ENSMUST00000116947 90 ntBASIC-5.97□□□□□ -3.36
Ccdc171E9Q1U1 Gm25950-201ENSMUST00000175331 100 ntBASIC-5.97□□□□□ -3.36
Ccdc171E9Q1U1 Gm25428-201ENSMUST00000157608 114 ntBASIC-5.99□□□□□ -3.37
Ccdc171E9Q1U1 Gm22593-201ENSMUST00000104245 109 ntBASIC-6.06□□□□□ -3.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm22540-201ENSMUST00000158168 117 ntBASIC-6.13□□□□□ -3.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm23653-201ENSMUST00000116751 97 ntBASIC-6.21□□□□□ -3.4
Ccdc171E9Q1U1 Gm25045-201ENSMUST00000122670 99 ntBASIC-6.23□□□□□ -3.41
Ccdc171E9Q1U1 Gm44385-201ENSMUST00000198781 81 ntBASIC-6.41□□□□□ -3.44
Ccdc171E9Q1U1 Gm23125-201ENSMUST00000157651 106 ntBASIC-6.52□□□□□ -3.45
Ccdc171E9Q1U1 Gm22069-201ENSMUST00000179911 107 ntBASIC-6.74□□□□□ -3.49
Ccdc171E9Q1U1 AC160976.1-201ENSMUST00000215092 148 ntBASIC-6.76□□□□□ -3.49
Ccdc171E9Q1U1 Gm22943-201ENSMUST00000158564 76 ntBASIC-6.96□□□□□ -3.52
Ccdc171E9Q1U1 Gm25886-201ENSMUST00000157780 114 ntBASIC-7.25□□□□□ -3.57
Ccdc171E9Q1U1 Gm27645-201ENSMUST00000183348 77 ntBASIC-7.89□□□□□ -3.67
Retrieved 32 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms