Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25524-201ENSMUST00000101821 107 ntBASIC-2,74□□□□□ -2,85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24482-201ENSMUST00000117005 93 ntBASIC-2,74□□□□□ -2,85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir34c-201ENSMUST00000083653 77 ntBASIC-2,76□□□□□ -2,85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir466l-201ENSMUST00000104866 121 ntBASIC-2,77□□□□□ -2,85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25132-201ENSMUST00000082652 107 ntBASIC-2,78□□□□□ -2,85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24396-201ENSMUST00000116905 93 ntBASIC-2,81□□□□□ -2,86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24586-201ENSMUST00000116695 89 ntBASIC-2,84□□□□□ -2,86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s214-201ENSMUST00000122494 121 ntBASIC-2,84□□□□□ -2,86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26259-201ENSMUST00000104778 97 ntBASIC-2,86□□□□□ -2,87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25428-201ENSMUST00000157608 114 ntBASIC-2,86□□□□□ -2,87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25354-201ENSMUST00000179110 105 ntBASIC-2,86□□□□□ -2,87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25039-201ENSMUST00000082933 107 ntBASIC-2,88□□□□□ -2,87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23826-201ENSMUST00000157394 119 ntBASIC-2,89□□□□□ -2,87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23653-201ENSMUST00000116751 97 ntBASIC-2,98□□□□□ -2,89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22067-201ENSMUST00000122790 107 ntBASIC-2,98□□□□□ -2,89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25049-201ENSMUST00000158597 73 ntBASIC-3□□□□□ -2,89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23237-201ENSMUST00000104639 92 ntBASIC-3,04□□□□□ -2,9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20473-201ENSMUST00000173064 112 ntBASIC-3,04□□□□□ -2,9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23248-201ENSMUST00000083367 108 ntBASIC-3,16□□□□□ -2,92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44385-201ENSMUST00000198781 81 ntBASIC-3,21□□□□□ -2,92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22033-201ENSMUST00000116947 90 ntBASIC-3,27□□□□□ -2,93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25950-201ENSMUST00000175331 100 ntBASIC-3,35□□□□□ -2,95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22540-201ENSMUST00000158168 117 ntBASIC-3,39□□□□□ -2,95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25045-201ENSMUST00000122670 99 ntBASIC-3,42□□□□□ -2,96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24531-201ENSMUST00000157945 100 ntBASIC-3,44□□□□□ -2,96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22593-201ENSMUST00000104245 109 ntBASIC-3,56□□□□□ -2,98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22069-201ENSMUST00000179911 107 ntBASIC-3,72□□□□□ -3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22943-201ENSMUST00000158564 76 ntBASIC-3,87□□□□□ -3,03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23125-201ENSMUST00000157651 106 ntBASIC-3,93□□□□□ -3,04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC160976.1-201ENSMUST00000215092 148 ntBASIC-4,05□□□□□ -3,06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25886-201ENSMUST00000157780 114 ntBASIC-4,26□□□□□ -3,09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27645-201ENSMUST00000183348 77 ntBASIC-4,31□□□□□ -3,1
Retrieved 32 of 76,532 protein–RNA pairs in 114,1 ms