Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXJ9

Ighv1-12, Immunoglobulin heavy variable V1-12 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm24387-201ENSMUST00000104625 90 ntBASIC-4,54□□□□□ -3,14
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm23826-201ENSMUST00000157394 119 ntBASIC-4,54□□□□□ -3,14
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm25354-201ENSMUST00000179110 105 ntBASIC-4,59□□□□□ -3,14
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm22550-201ENSMUST00000179774 107 ntBASIC-4,62□□□□□ -3,15
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm22060-201ENSMUST00000082558 107 ntBASIC-4,62□□□□□ -3,15
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Mir7681-201ENSMUST00000184834 72 ntBASIC-4,64□□□□□ -3,15
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm22067-201ENSMUST00000122790 107 ntBASIC-4,67□□□□□ -3,16
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm23237-201ENSMUST00000104639 92 ntBASIC-4,77□□□□□ -3,17
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm24194-201ENSMUST00000116805 90 ntBASIC-4,8□□□□□ -3,18
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Mir669m-2-201ENSMUST00000158355 98 ntBASIC-4,86□□□□□ -3,19
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm44303-201ENSMUST00000196348 83 ntBASIC-4,88□□□□□ -3,19
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm25132-201ENSMUST00000082652 107 ntBASIC-4,88□□□□□ -3,19
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm25521-201ENSMUST00000158393 108 ntBASIC-4,89□□□□□ -3,19
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm22033-201ENSMUST00000116947 90 ntBASIC-4,92□□□□□ -3,2
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm26259-201ENSMUST00000104778 97 ntBASIC-4,94□□□□□ -3,2
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 n-R5s214-201ENSMUST00000122494 121 ntBASIC-4,94□□□□□ -3,2
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm25254-201ENSMUST00000157239 104 ntBASIC-5□□□□□ -3,21
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm25045-201ENSMUST00000122670 99 ntBASIC-5,2□□□□□ -3,24
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm25039-201ENSMUST00000082933 107 ntBASIC-5,21□□□□□ -3,24
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm22540-201ENSMUST00000158168 117 ntBASIC-5,24□□□□□ -3,25
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm25950-201ENSMUST00000175331 100 ntBASIC-5,36□□□□□ -3,27
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm20473-201ENSMUST00000173064 112 ntBASIC-5,4□□□□□ -3,27
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm25049-201ENSMUST00000158597 73 ntBASIC-5,52□□□□□ -3,29
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm22069-201ENSMUST00000179911 107 ntBASIC-5,69□□□□□ -3,32
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm23248-201ENSMUST00000083367 108 ntBASIC-5,84□□□□□ -3,34
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm22943-201ENSMUST00000158564 76 ntBASIC-6,02□□□□□ -3,37
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm24531-201ENSMUST00000157945 100 ntBASIC-6,09□□□□□ -3,38
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm22593-201ENSMUST00000104245 109 ntBASIC-6,32□□□□□ -3,42
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm27645-201ENSMUST00000183348 77 ntBASIC-6,39□□□□□ -3,43
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 AC160976.1-201ENSMUST00000215092 148 ntBASIC-7,06□□□□□ -3,54
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm23125-201ENSMUST00000157651 106 ntBASIC-7,28□□□□□ -3,57
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm25886-201ENSMUST00000157780 114 ntBASIC-7,49□□□□□ -3,61
Retrieved 32 of 76,532 protein–RNA pairs in 98 ms