Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm25382-201ENSMUST00000157811 97 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
Col5a3Q9JLI2 Gm44347-201ENSMUST00000199602 108 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
Col5a3Q9JLI2 Mir192-201ENSMUST00000083589 89 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
Col5a3Q9JLI2 Gm24226-201ENSMUST00000158826 97 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
Col5a3Q9JLI2 Gm22950-201ENSMUST00000082776 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
Col5a3Q9JLI2 Gm26472-201ENSMUST00000116760 83 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
Col5a3Q9JLI2 Gm24806-201ENSMUST00000117036 90 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
Col5a3Q9JLI2 Gm44481-201ENSMUST00000197288 84 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
Col5a3Q9JLI2 Gm44339-201ENSMUST00000200598 84 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
Col5a3Q9JLI2 AC157278.1-201ENSMUST00000221621 148 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
Col5a3Q9JLI2 Gm44377-201ENSMUST00000199039 87 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
Col5a3Q9JLI2 Gm23293-201ENSMUST00000082552 104 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
Col5a3Q9JLI2 Gm26122-201ENSMUST00000083362 82 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
Col5a3Q9JLI2 Gm25779-201ENSMUST00000116710 95 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
Col5a3Q9JLI2 Mir297a-3-201ENSMUST00000103768 102 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
Col5a3Q9JLI2 Gm22679-201ENSMUST00000116975 100 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
Col5a3Q9JLI2 Gm24502-201ENSMUST00000158453 105 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
Col5a3Q9JLI2 Gm23785-201ENSMUST00000116741 96 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
Col5a3Q9JLI2 Gm22573-201ENSMUST00000082982 102 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
Col5a3Q9JLI2 Gm23787-201ENSMUST00000122538 73 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.62
Col5a3Q9JLI2 Gm22039-201ENSMUST00000157278 132 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
Col5a3Q9JLI2 Gm44351-201ENSMUST00000200090 95 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
Col5a3Q9JLI2 Gm22078-201ENSMUST00000157593 103 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
Col5a3Q9JLI2 Gm23637-201ENSMUST00000175075 94 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
Col5a3Q9JLI2 Mir467e-201ENSMUST00000103760 87 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
Col5a3Q9JLI2 Gm25465-201ENSMUST00000157716 105 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
Col5a3Q9JLI2 Gm26139-201ENSMUST00000180098 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
Col5a3Q9JLI2 Gm24646-201ENSMUST00000157109 99 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
Col5a3Q9JLI2 Mir466o-201ENSMUST00000104832 84 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
Col5a3Q9JLI2 Gm23556-201ENSMUST00000157821 92 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
Col5a3Q9JLI2 Gm22313-201ENSMUST00000158008 129 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
Col5a3Q9JLI2 Gm22183-201ENSMUST00000175420 73 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
Col5a3Q9JLI2 Gm26052-201ENSMUST00000104646 84 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
Col5a3Q9JLI2 Mir466l-201ENSMUST00000104866 121 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
Col5a3Q9JLI2 Mir470-201ENSMUST00000093565 75 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
Col5a3Q9JLI2 Gm23315-201ENSMUST00000158003 109 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
Col5a3Q9JLI2 Gm25143-201ENSMUST00000082696 109 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
Col5a3Q9JLI2 Gm22232-201ENSMUST00000104654 94 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
Col5a3Q9JLI2 Mir485-201ENSMUST00000093620 73 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
Col5a3Q9JLI2 Gm22879-201ENSMUST00000082895 74 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
Col5a3Q9JLI2 Mir335-201ENSMUST00000083567 98 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
Col5a3Q9JLI2 Mir34c-201ENSMUST00000083653 77 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
Col5a3Q9JLI2 Gm24185-201ENSMUST00000122578 105 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
Col5a3Q9JLI2 Gm23543-201ENSMUST00000158207 106 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
Col5a3Q9JLI2 Gm23566-201ENSMUST00000174907 108 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
Col5a3Q9JLI2 Gm22402-201ENSMUST00000174920 110 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
Col5a3Q9JLI2 Mir125b-1-201ENSMUST00000175613 77 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
Col5a3Q9JLI2 mt-Tl2-201ENSMUST00000082417 71 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
Col5a3Q9JLI2 Mir7670-201ENSMUST00000183689 69 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
Col5a3Q9JLI2 Gm22474-201ENSMUST00000179407 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
Col5a3Q9JLI2 Gm23707-201ENSMUST00000104366 125 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
Col5a3Q9JLI2 Gm24016-201ENSMUST00000157726 68 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
Col5a3Q9JLI2 Gm22260-201ENSMUST00000178643 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
Col5a3Q9JLI2 Mir351-201ENSMUST00000083569 99 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
Col5a3Q9JLI2 Traj42-201ENSMUST00000103700 64 ntAPPRIS P1 BASIC-1.51□□□□□ -2.65
Col5a3Q9JLI2 Gm26231-201ENSMUST00000175218 67 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
Col5a3Q9JLI2 Gm24631-201ENSMUST00000122765 81 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
Col5a3Q9JLI2 Gm24710-201ENSMUST00000175235 101 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
Col5a3Q9JLI2 Gm24135-201ENSMUST00000179085 101 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
Col5a3Q9JLI2 Gm22296-201ENSMUST00000083310 103 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
Col5a3Q9JLI2 Mir1955-201ENSMUST00000158014 98 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
Col5a3Q9JLI2 Gm22056-201ENSMUST00000083386 81 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
Col5a3Q9JLI2 Mir669a-3-201ENSMUST00000102074 109 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
Col5a3Q9JLI2 Gm23428-201ENSMUST00000122488 102 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
Col5a3Q9JLI2 Gm23826-201ENSMUST00000157394 119 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
Col5a3Q9JLI2 Gm25222-201ENSMUST00000158199 126 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
Col5a3Q9JLI2 Gm25705-201ENSMUST00000083119 104 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
Col5a3Q9JLI2 Gm25297-201ENSMUST00000175490 67 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
Col5a3Q9JLI2 Mir6395-201ENSMUST00000183885 91 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
Col5a3Q9JLI2 Gm24651-201ENSMUST00000157107 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
Col5a3Q9JLI2 Gm24538-201ENSMUST00000082612 107 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
Col5a3Q9JLI2 Mir493-201ENSMUST00000103837 83 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
Col5a3Q9JLI2 Gm23066-201ENSMUST00000158237 71 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
Col5a3Q9JLI2 Gm27995-201ENSMUST00000184402 100 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
Col5a3Q9JLI2 Gm22925-201ENSMUST00000174956 102 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
Col5a3Q9JLI2 Gm22401-201ENSMUST00000174927 117 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
Col5a3Q9JLI2 Mir2136-201ENSMUST00000158781 75 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
Col5a3Q9JLI2 Gm26307-201ENSMUST00000157767 126 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
Col5a3Q9JLI2 Mir664-201ENSMUST00000196796 69 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
Col5a3Q9JLI2 Mir124a-1-201ENSMUST00000083663 85 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
Col5a3Q9JLI2 Gm22033-201ENSMUST00000116947 90 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
Col5a3Q9JLI2 Gm22067-201ENSMUST00000122790 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
Col5a3Q9JLI2 Gm25354-201ENSMUST00000179110 105 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
Col5a3Q9JLI2 Gm25524-201ENSMUST00000101821 107 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
Col5a3Q9JLI2 Gm22127-201ENSMUST00000083239 106 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
Col5a3Q9JLI2 Mir154-201ENSMUST00000083514 66 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
Col5a3Q9JLI2 Gm22540-201ENSMUST00000158168 117 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
Col5a3Q9JLI2 Snord58b-201ENSMUST00000082937 66 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
Col5a3Q9JLI2 Gm26227-201ENSMUST00000082510 101 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
Col5a3Q9JLI2 Gm24396-201ENSMUST00000116905 93 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
Col5a3Q9JLI2 Gm22301-201ENSMUST00000082656 107 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
Col5a3Q9JLI2 Gm23237-201ENSMUST00000104639 92 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
Col5a3Q9JLI2 Gm22071-201ENSMUST00000116857 83 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
Col5a3Q9JLI2 Mir466b-2-201ENSMUST00000103778 82 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
Col5a3Q9JLI2 Gm23961-201ENSMUST00000104685 97 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
Col5a3Q9JLI2 Mir1906-1-201ENSMUST00000122586 80 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
Col5a3Q9JLI2 Mir1906-2-201ENSMUST00000122610 80 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
Col5a3Q9JLI2 Gm25867-201ENSMUST00000158254 103 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
Col5a3Q9JLI2 Gm27882-201ENSMUST00000184904 74 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
Col5a3Q9JLI2 Gm24387-201ENSMUST00000104625 90 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 244.9 ms