Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm22232-201ENSMUST00000104654 94 ntBASIC-1,21□□□□□ -2,6
Chmp3Q9CQ10 Gm23831-201ENSMUST00000158895 85 ntBASIC-1,21□□□□□ -2,6
Chmp3Q9CQ10 Gm25886-201ENSMUST00000157780 114 ntBASIC-1,22□□□□□ -2,6
Chmp3Q9CQ10 Mir669m-1-201ENSMUST00000158945 98 ntBASIC-1,22□□□□□ -2,6
Chmp3Q9CQ10 Snord58b-201ENSMUST00000082937 66 ntBASIC-1,23□□□□□ -2,61
Chmp3Q9CQ10 Gm23974-201ENSMUST00000083321 131 ntBASIC-1,23□□□□□ -2,61
Chmp3Q9CQ10 Gm24502-201ENSMUST00000158453 105 ntBASIC-1,24□□□□□ -2,61
Chmp3Q9CQ10 Gm24194-201ENSMUST00000116805 90 ntBASIC-1,25□□□□□ -2,61
Chmp3Q9CQ10 Gm25143-201ENSMUST00000082696 109 ntBASIC-1,26□□□□□ -2,61
Chmp3Q9CQ10 Gm26124-201ENSMUST00000083359 108 ntBASIC-1,28□□□□□ -2,61
Chmp3Q9CQ10 Gm23199-201ENSMUST00000158812 107 ntBASIC-1,3□□□□□ -2,62
Chmp3Q9CQ10 Mir3101-201ENSMUST00000175607 88 ntBASIC-1,3□□□□□ -2,62
Chmp3Q9CQ10 Mir539-201ENSMUST00000102109 74 ntBASIC-1,31□□□□□ -2,62
Chmp3Q9CQ10 AC154832.1-201ENSMUST00000228928 141 ntBASIC-1,31□□□□□ -2,62
Chmp3Q9CQ10 Gm22938-201ENSMUST00000103956 120 ntBASIC-1,35□□□□□ -2,63
Chmp3Q9CQ10 Mir574-201ENSMUST00000103854 78 ntBASIC-1,38□□□□□ -2,63
Chmp3Q9CQ10 Gm22925-201ENSMUST00000174956 102 ntBASIC-1,38□□□□□ -2,63
Chmp3Q9CQ10 Gm27610-201ENSMUST00000184026 74 ntBASIC-1,38□□□□□ -2,63
Chmp3Q9CQ10 Gm22234-201ENSMUST00000174906 65 ntBASIC-1,4□□□□□ -2,63
Chmp3Q9CQ10 Gm23216-201ENSMUST00000179545 107 ntBASIC-1,4□□□□□ -2,63
Chmp3Q9CQ10 Gm22313-201ENSMUST00000158008 129 ntBASIC-1,43□□□□□ -2,64
Chmp3Q9CQ10 Mir669m-2-201ENSMUST00000158355 98 ntBASIC-1,43□□□□□ -2,64
Chmp3Q9CQ10 Gm17522-202ENSMUST00000186631 174 ntTSL 1 (best) BASIC-1,44□□□□□ -2,64
Chmp3Q9CQ10 Gm17412-202ENSMUST00000189566 174 ntTSL 1 (best) BASIC-1,44□□□□□ -2,64
Chmp3Q9CQ10 Mir543-201ENSMUST00000102286 76 ntBASIC-1,45□□□□□ -2,64
Chmp3Q9CQ10 Gm20473-201ENSMUST00000173064 112 ntBASIC-1,47□□□□□ -2,64
Chmp3Q9CQ10 Gm27366-201ENSMUST00000184967 108 ntBASIC-1,49□□□□□ -2,65
Chmp3Q9CQ10 Gm23543-201ENSMUST00000158207 106 ntBASIC-1,5□□□□□ -2,65
Chmp3Q9CQ10 Mir7055-201ENSMUST00000197423 59 ntBASIC-1,54□□□□□ -2,66
Chmp3Q9CQ10 Gm22593-201ENSMUST00000104245 109 ntBASIC-1,56□□□□□ -2,66
Chmp3Q9CQ10 Mir145b-201ENSMUST00000184434 75 ntBASIC-1,56□□□□□ -2,66
Chmp3Q9CQ10 Gm23556-201ENSMUST00000157821 92 ntBASIC-1,59□□□□□ -2,66
Chmp3Q9CQ10 Gm22783-201ENSMUST00000104089 107 ntBASIC-1,61□□□□□ -2,67
Chmp3Q9CQ10 Gm44303-201ENSMUST00000196348 83 ntBASIC-1,62□□□□□ -2,67
Chmp3Q9CQ10 Gm24387-201ENSMUST00000104625 90 ntBASIC-1,64□□□□□ -2,67
Chmp3Q9CQ10 Gm22464-201ENSMUST00000175273 64 ntBASIC-1,65□□□□□ -2,67
Chmp3Q9CQ10 Gm25248-201ENSMUST00000175473 98 ntBASIC-1,7□□□□□ -2,68
Chmp3Q9CQ10 Mir7681-201ENSMUST00000184834 72 ntBASIC-1,71□□□□□ -2,68
Chmp3Q9CQ10 Gm22573-201ENSMUST00000082982 102 ntBASIC-1,71□□□□□ -2,68
Chmp3Q9CQ10 Mir7043-201ENSMUST00000184219 70 ntBASIC-1,72□□□□□ -2,68
Chmp3Q9CQ10 Mir664-201ENSMUST00000196796 69 ntBASIC-1,79□□□□□ -2,7
Chmp3Q9CQ10 Gm23613-201ENSMUST00000082596 87 ntBASIC-1,8□□□□□ -2,7
Chmp3Q9CQ10 Gm25626-201ENSMUST00000177631 107 ntBASIC-1,85□□□□□ -2,71
Chmp3Q9CQ10 Gm21830-201ENSMUST00000178898 135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1,86□□□□□ -2,71
Chmp3Q9CQ10 Mir6339-201ENSMUST00000185120 117 ntBASIC-1,86□□□□□ -2,71
Chmp3Q9CQ10 Gm24091-201ENSMUST00000082550 83 ntBASIC-1,86□□□□□ -2,71
Chmp3Q9CQ10 Gm23711-201ENSMUST00000083856 83 ntBASIC-1,86□□□□□ -2,71
Chmp3Q9CQ10 Gm26043-201ENSMUST00000116912 91 ntBASIC-1,89□□□□□ -2,71
Chmp3Q9CQ10 Gm25049-201ENSMUST00000158597 73 ntBASIC-1,89□□□□□ -2,71
Chmp3Q9CQ10 Gm23316-201ENSMUST00000157997 114 ntBASIC-1,9□□□□□ -2,71
Chmp3Q9CQ10 Mir466m-201ENSMUST00000175052 84 ntBASIC-1,9□□□□□ -2,71
Chmp3Q9CQ10 Mir379-201ENSMUST00000083564 66 ntBASIC-1,9□□□□□ -2,71
Chmp3Q9CQ10 Mir6964-201ENSMUST00000200252 59 ntBASIC-1,99□□□□□ -2,73
Chmp3Q9CQ10 Mirlet7b-201ENSMUST00000083630 85 ntBASIC-2,04□□□□□ -2,74
Chmp3Q9CQ10 Gm24047-201ENSMUST00000102405 104 ntBASIC-2,08□□□□□ -2,74
Chmp3Q9CQ10 n-R5s153-201ENSMUST00000083451 116 ntBASIC-2,08□□□□□ -2,74
Chmp3Q9CQ10 Mir122-201ENSMUST00000083468 66 ntBASIC-2,1□□□□□ -2,75
Chmp3Q9CQ10 Gm22430-201ENSMUST00000158546 107 ntBASIC-2,12□□□□□ -2,75
Chmp3Q9CQ10 Gm24197-201ENSMUST00000175085 109 ntBASIC-2,15□□□□□ -2,75
Chmp3Q9CQ10 Gm23812-201ENSMUST00000175156 84 ntBASIC-2,15□□□□□ -2,75
Chmp3Q9CQ10 Gm23374-201ENSMUST00000175408 84 ntBASIC-2,15□□□□□ -2,75
Chmp3Q9CQ10 Gm23428-201ENSMUST00000122488 102 ntBASIC-2,18□□□□□ -2,76
Chmp3Q9CQ10 Mir451b-201ENSMUST00000196157 72 ntBASIC-2,18□□□□□ -2,76
Chmp3Q9CQ10 Gm22296-201ENSMUST00000083310 103 ntBASIC-2,18□□□□□ -2,76
Chmp3Q9CQ10 Mir466b-2-201ENSMUST00000103778 82 ntBASIC-2,22□□□□□ -2,76
Chmp3Q9CQ10 Mir1912-201ENSMUST00000175298 87 ntBASIC-2,22□□□□□ -2,76
Chmp3Q9CQ10 Gm25601-201ENSMUST00000158356 105 ntBASIC-2,23□□□□□ -2,77
Chmp3Q9CQ10 Gm26122-201ENSMUST00000083362 82 ntBASIC-2,23□□□□□ -2,77
Chmp3Q9CQ10 Snord8-201ENSMUST00000175303 110 ntBASIC-2,25□□□□□ -2,77
Chmp3Q9CQ10 Gm24554-201ENSMUST00000158654 73 ntBASIC-2,26□□□□□ -2,77
Chmp3Q9CQ10 Mir297a-3-201ENSMUST00000103768 102 ntBASIC-2,29□□□□□ -2,78
Chmp3Q9CQ10 Mir7015-201ENSMUST00000199525 64 ntBASIC-2,3□□□□□ -2,78
Chmp3Q9CQ10 Mir493-201ENSMUST00000103837 83 ntBASIC-2,32□□□□□ -2,78
Chmp3Q9CQ10 Gm24016-201ENSMUST00000157726 68 ntBASIC-2,34□□□□□ -2,78
Chmp3Q9CQ10 Gm27944-201ENSMUST00000185155 103 ntBASIC-2,34□□□□□ -2,78
Chmp3Q9CQ10 Mirlet7a-2-201ENSMUST00000175029 96 ntBASIC-2,39□□□□□ -2,79
Chmp3Q9CQ10 Gm24806-201ENSMUST00000117036 90 ntBASIC-2,44□□□□□ -2,8
Chmp3Q9CQ10 Gm23707-201ENSMUST00000104366 125 ntBASIC-2,45□□□□□ -2,8
Chmp3Q9CQ10 Gm25867-201ENSMUST00000158254 103 ntBASIC-2,48□□□□□ -2,81
Chmp3Q9CQ10 Gm25521-201ENSMUST00000158393 108 ntBASIC-2,52□□□□□ -2,81
Chmp3Q9CQ10 Gm24631-201ENSMUST00000122765 81 ntBASIC-2,53□□□□□ -2,81
Chmp3Q9CQ10 Gm24185-201ENSMUST00000122578 105 ntBASIC-2,55□□□□□ -2,82
Chmp3Q9CQ10 Traj33-201ENSMUST00000103708 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2,58□□□□□ -2,82
Chmp3Q9CQ10 Mir466o-201ENSMUST00000104832 84 ntBASIC-2,62□□□□□ -2,83
Chmp3Q9CQ10 Mir470-201ENSMUST00000093565 75 ntBASIC-2,63□□□□□ -2,83
Chmp3Q9CQ10 Gm27882-201ENSMUST00000184904 74 ntBASIC-2,67□□□□□ -2,84
Chmp3Q9CQ10 Mir7670-201ENSMUST00000183689 69 ntBASIC-2,68□□□□□ -2,84
Chmp3Q9CQ10 Gm26008-201ENSMUST00000158797 99 ntBASIC-2,69□□□□□ -2,84
Chmp3Q9CQ10 Gm23066-201ENSMUST00000158237 71 ntBASIC-2,71□□□□□ -2,84
Chmp3Q9CQ10 Mir124a-1-201ENSMUST00000083663 85 ntBASIC-2,71□□□□□ -2,84
Chmp3Q9CQ10 Gm23125-201ENSMUST00000157651 106 ntBASIC-2,72□□□□□ -2,84
Chmp3Q9CQ10 Gm25254-201ENSMUST00000157239 104 ntBASIC-2,79□□□□□ -2,86
Chmp3Q9CQ10 Gm22446-201ENSMUST00000180108 104 ntBASIC-2,79□□□□□ -2,86
Chmp3Q9CQ10 Mir7086-201ENSMUST00000183683 65 ntBASIC-2,84□□□□□ -2,86
Chmp3Q9CQ10 Gm27935-201ENSMUST00000183894 79 ntBASIC-2,94□□□□□ -2,88
Chmp3Q9CQ10 Mir485-201ENSMUST00000093620 73 ntBASIC-2,96□□□□□ -2,88
Chmp3Q9CQ10 Mir1906-1-201ENSMUST00000122586 80 ntBASIC-2,98□□□□□ -2,89
Chmp3Q9CQ10 Mir1906-2-201ENSMUST00000122610 80 ntBASIC-2,98□□□□□ -2,89
Chmp3Q9CQ10 Gm26231-201ENSMUST00000175218 67 ntBASIC-2,98□□□□□ -2,89
Chmp3Q9CQ10 Mir6395-201ENSMUST00000183885 91 ntBASIC-2,99□□□□□ -2,89
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