Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm22232-201ENSMUST00000104654 94 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
Chmp3Q9CQ10 Gm23831-201ENSMUST00000158895 85 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
Chmp3Q9CQ10 Gm25886-201ENSMUST00000157780 114 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
Chmp3Q9CQ10 Mir669m-1-201ENSMUST00000158945 98 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
Chmp3Q9CQ10 Snord58b-201ENSMUST00000082937 66 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
Chmp3Q9CQ10 Gm23974-201ENSMUST00000083321 131 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
Chmp3Q9CQ10 Gm24502-201ENSMUST00000158453 105 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
Chmp3Q9CQ10 Gm24194-201ENSMUST00000116805 90 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
Chmp3Q9CQ10 Gm25143-201ENSMUST00000082696 109 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
Chmp3Q9CQ10 Gm26124-201ENSMUST00000083359 108 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
Chmp3Q9CQ10 Gm23199-201ENSMUST00000158812 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
Chmp3Q9CQ10 Mir3101-201ENSMUST00000175607 88 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
Chmp3Q9CQ10 Mir539-201ENSMUST00000102109 74 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
Chmp3Q9CQ10 AC154832.1-201ENSMUST00000228928 141 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
Chmp3Q9CQ10 Gm22938-201ENSMUST00000103956 120 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
Chmp3Q9CQ10 Mir574-201ENSMUST00000103854 78 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
Chmp3Q9CQ10 Gm22925-201ENSMUST00000174956 102 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
Chmp3Q9CQ10 Gm27610-201ENSMUST00000184026 74 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
Chmp3Q9CQ10 Gm22234-201ENSMUST00000174906 65 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
Chmp3Q9CQ10 Gm23216-201ENSMUST00000179545 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
Chmp3Q9CQ10 Gm22313-201ENSMUST00000158008 129 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
Chmp3Q9CQ10 Mir669m-2-201ENSMUST00000158355 98 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
Chmp3Q9CQ10 Gm17522-202ENSMUST00000186631 174 ntTSL 1 (best) BASIC-1.44□□□□□ -2.64
Chmp3Q9CQ10 Gm17412-202ENSMUST00000189566 174 ntTSL 1 (best) BASIC-1.44□□□□□ -2.64
Chmp3Q9CQ10 Mir543-201ENSMUST00000102286 76 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
Chmp3Q9CQ10 Gm20473-201ENSMUST00000173064 112 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
Chmp3Q9CQ10 Gm27366-201ENSMUST00000184967 108 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
Chmp3Q9CQ10 Gm23543-201ENSMUST00000158207 106 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
Chmp3Q9CQ10 Mir7055-201ENSMUST00000197423 59 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
Chmp3Q9CQ10 Gm22593-201ENSMUST00000104245 109 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
Chmp3Q9CQ10 Mir145b-201ENSMUST00000184434 75 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
Chmp3Q9CQ10 Gm23556-201ENSMUST00000157821 92 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
Chmp3Q9CQ10 Gm22783-201ENSMUST00000104089 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
Chmp3Q9CQ10 Gm44303-201ENSMUST00000196348 83 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
Chmp3Q9CQ10 Gm24387-201ENSMUST00000104625 90 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
Chmp3Q9CQ10 Gm22464-201ENSMUST00000175273 64 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
Chmp3Q9CQ10 Gm25248-201ENSMUST00000175473 98 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
Chmp3Q9CQ10 Mir7681-201ENSMUST00000184834 72 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
Chmp3Q9CQ10 Gm22573-201ENSMUST00000082982 102 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
Chmp3Q9CQ10 Mir7043-201ENSMUST00000184219 70 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
Chmp3Q9CQ10 Mir664-201ENSMUST00000196796 69 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
Chmp3Q9CQ10 Gm23613-201ENSMUST00000082596 87 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
Chmp3Q9CQ10 Gm25626-201ENSMUST00000177631 107 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
Chmp3Q9CQ10 Gm21830-201ENSMUST00000178898 135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1.86□□□□□ -2.71
Chmp3Q9CQ10 Mir6339-201ENSMUST00000185120 117 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
Chmp3Q9CQ10 Gm24091-201ENSMUST00000082550 83 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
Chmp3Q9CQ10 Gm23711-201ENSMUST00000083856 83 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
Chmp3Q9CQ10 Gm26043-201ENSMUST00000116912 91 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
Chmp3Q9CQ10 Gm25049-201ENSMUST00000158597 73 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
Chmp3Q9CQ10 Gm23316-201ENSMUST00000157997 114 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
Chmp3Q9CQ10 Mir466m-201ENSMUST00000175052 84 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
Chmp3Q9CQ10 Mir379-201ENSMUST00000083564 66 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
Chmp3Q9CQ10 Mir6964-201ENSMUST00000200252 59 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Chmp3Q9CQ10 Mirlet7b-201ENSMUST00000083630 85 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
Chmp3Q9CQ10 Gm24047-201ENSMUST00000102405 104 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
Chmp3Q9CQ10 n-R5s153-201ENSMUST00000083451 116 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
Chmp3Q9CQ10 Mir122-201ENSMUST00000083468 66 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
Chmp3Q9CQ10 Gm22430-201ENSMUST00000158546 107 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
Chmp3Q9CQ10 Gm24197-201ENSMUST00000175085 109 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
Chmp3Q9CQ10 Gm23812-201ENSMUST00000175156 84 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
Chmp3Q9CQ10 Gm23374-201ENSMUST00000175408 84 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
Chmp3Q9CQ10 Gm23428-201ENSMUST00000122488 102 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
Chmp3Q9CQ10 Mir451b-201ENSMUST00000196157 72 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
Chmp3Q9CQ10 Gm22296-201ENSMUST00000083310 103 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
Chmp3Q9CQ10 Mir466b-2-201ENSMUST00000103778 82 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
Chmp3Q9CQ10 Mir1912-201ENSMUST00000175298 87 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
Chmp3Q9CQ10 Gm25601-201ENSMUST00000158356 105 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
Chmp3Q9CQ10 Gm26122-201ENSMUST00000083362 82 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
Chmp3Q9CQ10 Snord8-201ENSMUST00000175303 110 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
Chmp3Q9CQ10 Gm24554-201ENSMUST00000158654 73 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
Chmp3Q9CQ10 Mir297a-3-201ENSMUST00000103768 102 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
Chmp3Q9CQ10 Mir7015-201ENSMUST00000199525 64 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
Chmp3Q9CQ10 Mir493-201ENSMUST00000103837 83 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
Chmp3Q9CQ10 Gm24016-201ENSMUST00000157726 68 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
Chmp3Q9CQ10 Gm27944-201ENSMUST00000185155 103 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
Chmp3Q9CQ10 Mirlet7a-2-201ENSMUST00000175029 96 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
Chmp3Q9CQ10 Gm24806-201ENSMUST00000117036 90 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
Chmp3Q9CQ10 Gm23707-201ENSMUST00000104366 125 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
Chmp3Q9CQ10 Gm25867-201ENSMUST00000158254 103 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
Chmp3Q9CQ10 Gm25521-201ENSMUST00000158393 108 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
Chmp3Q9CQ10 Gm24631-201ENSMUST00000122765 81 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
Chmp3Q9CQ10 Gm24185-201ENSMUST00000122578 105 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
Chmp3Q9CQ10 Traj33-201ENSMUST00000103708 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.58□□□□□ -2.82
Chmp3Q9CQ10 Mir466o-201ENSMUST00000104832 84 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
Chmp3Q9CQ10 Mir470-201ENSMUST00000093565 75 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
Chmp3Q9CQ10 Gm27882-201ENSMUST00000184904 74 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
Chmp3Q9CQ10 Mir7670-201ENSMUST00000183689 69 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
Chmp3Q9CQ10 Gm26008-201ENSMUST00000158797 99 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
Chmp3Q9CQ10 Gm23066-201ENSMUST00000158237 71 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
Chmp3Q9CQ10 Mir124a-1-201ENSMUST00000083663 85 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
Chmp3Q9CQ10 Gm23125-201ENSMUST00000157651 106 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
Chmp3Q9CQ10 Gm25254-201ENSMUST00000157239 104 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
Chmp3Q9CQ10 Gm22446-201ENSMUST00000180108 104 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
Chmp3Q9CQ10 Mir7086-201ENSMUST00000183683 65 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
Chmp3Q9CQ10 Gm27935-201ENSMUST00000183894 79 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
Chmp3Q9CQ10 Mir485-201ENSMUST00000093620 73 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
Chmp3Q9CQ10 Mir1906-1-201ENSMUST00000122586 80 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
Chmp3Q9CQ10 Mir1906-2-201ENSMUST00000122610 80 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
Chmp3Q9CQ10 Gm26231-201ENSMUST00000175218 67 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
Chmp3Q9CQ10 Mir6395-201ENSMUST00000183885 91 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
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