Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Gm25484-201ENSMUST00000178217 107 ntBASIC-4,71□□□□□ -3,16
Sdc2P43407 Gm26138-201ENSMUST00000179236 107 ntBASIC-4,71□□□□□ -3,16
Sdc2P43407 Gm22821-201ENSMUST00000179288 107 ntBASIC-4,71□□□□□ -3,16
Sdc2P43407 Gm23298-201ENSMUST00000083181 107 ntBASIC-4,71□□□□□ -3,16
Sdc2P43407 Gm25516-201ENSMUST00000083857 107 ntBASIC-4,71□□□□□ -3,16
Sdc2P43407 Gm24651-201ENSMUST00000157107 107 ntBASIC-4,72□□□□□ -3,17
Sdc2P43407 Mir124a-1-201ENSMUST00000083663 85 ntBASIC-4,72□□□□□ -3,17
Sdc2P43407 Gm25315-201ENSMUST00000116823 121 ntBASIC-4,73□□□□□ -3,17
Sdc2P43407 Gm26485-201ENSMUST00000158019 64 ntBASIC-4,73□□□□□ -3,17
Sdc2P43407 Gm24226-201ENSMUST00000158826 97 ntBASIC-4,75□□□□□ -3,17
Sdc2P43407 Gm22071-201ENSMUST00000116857 83 ntBASIC-4,76□□□□□ -3,17
Sdc2P43407 Gm24676-201ENSMUST00000158758 75 ntBASIC-4,77□□□□□ -3,17
Sdc2P43407 Gm25812-201ENSMUST00000082751 103 ntBASIC-4,77□□□□□ -3,17
Sdc2P43407 Gm23644-201ENSMUST00000157856 77 ntBASIC-4,79□□□□□ -3,18
Sdc2P43407 Gm22925-201ENSMUST00000174956 102 ntBASIC-4,79□□□□□ -3,18
Sdc2P43407 Gm22260-201ENSMUST00000178643 107 ntBASIC-4,79□□□□□ -3,18
Sdc2P43407 Gm24234-201ENSMUST00000104316 107 ntBASIC-4,8□□□□□ -3,18
Sdc2P43407 Rnu6-ps2-201ENSMUST00000178059 107 ntBASIC-4,8□□□□□ -3,18
Sdc2P43407 Mir669l-201ENSMUST00000103771 98 ntBASIC-4,81□□□□□ -3,18
Sdc2P43407 Mir1187-201ENSMUST00000116936 122 ntBASIC-4,81□□□□□ -3,18
Sdc2P43407 Gm11966-201ENSMUST00000119907 87 ntBASIC-4,82□□□□□ -3,18
Sdc2P43407 Gm22213-201ENSMUST00000157564 119 ntBASIC-4,82□□□□□ -3,18
Sdc2P43407 Gm25867-201ENSMUST00000158254 103 ntBASIC-4,86□□□□□ -3,19
Sdc2P43407 Gm22039-201ENSMUST00000157278 132 ntBASIC-4,87□□□□□ -3,19
Sdc2P43407 Gm25465-201ENSMUST00000157716 105 ntBASIC-4,87□□□□□ -3,19
Sdc2P43407 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC-4,87□□□□□ -3,19
Sdc2P43407 Gm24710-201ENSMUST00000175235 101 ntBASIC-4,91□□□□□ -3,2
Sdc2P43407 Gm22911-201ENSMUST00000177920 107 ntBASIC-4,91□□□□□ -3,2
Sdc2P43407 Gm24135-201ENSMUST00000179085 101 ntBASIC-4,91□□□□□ -3,2
Sdc2P43407 Gm25222-201ENSMUST00000158199 126 ntBASIC-4,96□□□□□ -3,2
Sdc2P43407 Gm26008-201ENSMUST00000158797 99 ntBASIC-4,98□□□□□ -3,21
Sdc2P43407 Gm23678-201ENSMUST00000083157 107 ntBASIC-4,98□□□□□ -3,21
Sdc2P43407 Gm23785-201ENSMUST00000116741 96 ntBASIC-5,01□□□□□ -3,21
Sdc2P43407 Gm23966-201ENSMUST00000179823 107 ntBASIC-5,02□□□□□ -3,21
Sdc2P43407 Mir466b-2-201ENSMUST00000103778 82 ntBASIC-5,03□□□□□ -3,21
Sdc2P43407 Gm24167-201ENSMUST00000177733 124 ntBASIC-5,03□□□□□ -3,21
Sdc2P43407 Gm24028-201ENSMUST00000178991 124 ntBASIC-5,03□□□□□ -3,21
Sdc2P43407 Mir450b-201ENSMUST00000102095 82 ntBASIC-5,06□□□□□ -3,22
Sdc2P43407 Snord58b-201ENSMUST00000082937 66 ntBASIC-5,06□□□□□ -3,22
Sdc2P43407 Mir6481-201ENSMUST00000184617 110 ntBASIC-5,08□□□□□ -3,22
Sdc2P43407 Mir467g-201ENSMUST00000116906 120 ntBASIC-5,1□□□□□ -3,23
Sdc2P43407 Gm22845-201ENSMUST00000157712 104 ntBASIC-5,11□□□□□ -3,23
Sdc2P43407 Gm23350-201ENSMUST00000158429 103 ntBASIC-5,11□□□□□ -3,23
Sdc2P43407 Mir669a-3-201ENSMUST00000102074 109 ntBASIC-5,12□□□□□ -3,23
Sdc2P43407 Gm23652-201ENSMUST00000116752 107 ntBASIC-5,12□□□□□ -3,23
Sdc2P43407 Gm23293-201ENSMUST00000082552 104 ntBASIC-5,16□□□□□ -3,24
Sdc2P43407 Gm23578-201ENSMUST00000103943 104 ntBASIC-5,19□□□□□ -3,24
Sdc2P43407 Snord50a-201ENSMUST00000178154 72 ntBASIC-5,19□□□□□ -3,24
Sdc2P43407 Gm24463-201ENSMUST00000178417 72 ntBASIC-5,19□□□□□ -3,24
Sdc2P43407 Gm22251-201ENSMUST00000083216 107 ntBASIC-5,2□□□□□ -3,24
Sdc2P43407 Gm25987-201ENSMUST00000083234 107 ntBASIC-5,24□□□□□ -3,25
Sdc2P43407 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC-5,25□□□□□ -3,25
Sdc2P43407 Gm22474-201ENSMUST00000179407 107 ntBASIC-5,25□□□□□ -3,25
Sdc2P43407 Gm24605-201ENSMUST00000104772 96 ntBASIC-5,26□□□□□ -3,25
Sdc2P43407 Gm22078-201ENSMUST00000157593 103 ntBASIC-5,27□□□□□ -3,25
Sdc2P43407 Gm26306-201ENSMUST00000157773 119 ntBASIC-5,28□□□□□ -3,25
Sdc2P43407 n-R5s218-201ENSMUST00000122583 109 ntBASIC-5,31□□□□□ -3,26
Sdc2P43407 Gm24387-201ENSMUST00000104625 90 ntBASIC-5,32□□□□□ -3,26
Sdc2P43407 mt-Tl2-201ENSMUST00000082417 71 ntBASIC-5,32□□□□□ -3,26
Sdc2P43407 Gm25382-201ENSMUST00000157811 97 ntBASIC-5,34□□□□□ -3,26
Sdc2P43407 Gm23038-201ENSMUST00000083873 104 ntBASIC-5,34□□□□□ -3,26
Sdc2P43407 Gm26227-201ENSMUST00000082510 101 ntBASIC-5,36□□□□□ -3,27
Sdc2P43407 Gm24148-201ENSMUST00000082762 80 ntBASIC-5,36□□□□□ -3,27
Sdc2P43407 Gm20734-201ENSMUST00000216939 193 ntBASIC-5,42□□□□□ -3,28
Sdc2P43407 Gm27671-201ENSMUST00000183739 66 ntBASIC-5,44□□□□□ -3,28
Sdc2P43407 Gm22950-201ENSMUST00000082776 107 ntBASIC-5,45□□□□□ -3,28
Sdc2P43407 Gm22679-201ENSMUST00000116975 100 ntBASIC-5,46□□□□□ -3,28
Sdc2P43407 Gm24410-201ENSMUST00000083433 107 ntBASIC-5,46□□□□□ -3,28
Sdc2P43407 Gm22195-201ENSMUST00000116861 108 ntBASIC-5,47□□□□□ -3,29
Sdc2P43407 Gm25815-201ENSMUST00000082755 107 ntBASIC-5,49□□□□□ -3,29
Sdc2P43407 Mir7681-201ENSMUST00000184834 72 ntBASIC-5,5□□□□□ -3,29
Sdc2P43407 Gm23961-201ENSMUST00000104685 97 ntBASIC-5,52□□□□□ -3,29
Sdc2P43407 Traj42-201ENSMUST00000103700 64 ntAPPRIS P1 BASIC-5,54□□□□□ -3,3
Sdc2P43407 Mir297a-2-201ENSMUST00000103795 90 ntBASIC-5,61□□□□□ -3,31
Sdc2P43407 Gm10563-201ENSMUST00000115821 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-5,61□□□□□ -3,31
Sdc2P43407 Gm22301-201ENSMUST00000082656 107 ntBASIC-5,61□□□□□ -3,31
Sdc2P43407 Gm23210-201ENSMUST00000158668 98 ntBASIC-5,64□□□□□ -3,31
Sdc2P43407 Gm25022-201ENSMUST00000102205 83 ntBASIC-5,65□□□□□ -3,31
Sdc2P43407 Mir467a-6-201ENSMUST00000177790 83 ntBASIC-5,65□□□□□ -3,31
Sdc2P43407 Mir467a-3-201ENSMUST00000178082 83 ntBASIC-5,65□□□□□ -3,31
Sdc2P43407 Mir467a-7-201ENSMUST00000178635 83 ntBASIC-5,65□□□□□ -3,31
Sdc2P43407 Mir467a-10-201ENSMUST00000179320 83 ntBASIC-5,65□□□□□ -3,31
Sdc2P43407 Mir467a-5-201ENSMUST00000179352 83 ntBASIC-5,65□□□□□ -3,31
Sdc2P43407 Mir467a-2-201ENSMUST00000179447 83 ntBASIC-5,65□□□□□ -3,31
Sdc2P43407 Mir467a-9-201ENSMUST00000179752 83 ntBASIC-5,65□□□□□ -3,31
Sdc2P43407 Mir467a-4-201ENSMUST00000179923 83 ntBASIC-5,65□□□□□ -3,31
Sdc2P43407 Mir467a-8-201ENSMUST00000180070 83 ntBASIC-5,65□□□□□ -3,31
Sdc2P43407 Gm22127-201ENSMUST00000083239 106 ntBASIC-5,65□□□□□ -3,31
Sdc2P43407 Mir7116-201ENSMUST00000195956 70 ntBASIC-5,66□□□□□ -3,32
Sdc2P43407 Gm22550-201ENSMUST00000179774 107 ntBASIC-5,67□□□□□ -3,32
Sdc2P43407 Gm22060-201ENSMUST00000082558 107 ntBASIC-5,67□□□□□ -3,32
Sdc2P43407 Gm25521-201ENSMUST00000158393 108 ntBASIC-5,7□□□□□ -3,32
Sdc2P43407 Gm44303-201ENSMUST00000196348 83 ntBASIC-5,81□□□□□ -3,34
Sdc2P43407 Mir669m-2-201ENSMUST00000158355 98 ntBASIC-5,86□□□□□ -3,35
Sdc2P43407 Gm25524-201ENSMUST00000101821 107 ntBASIC-5,87□□□□□ -3,35
Sdc2P43407 Gm24194-201ENSMUST00000116805 90 ntBASIC-5,88□□□□□ -3,35
Sdc2P43407 Mir34c-201ENSMUST00000083653 77 ntBASIC-5,9□□□□□ -3,35
Sdc2P43407 Gm22381-201ENSMUST00000158186 107 ntBASIC-5,91□□□□□ -3,36
Sdc2P43407 Gm25254-201ENSMUST00000157239 104 ntBASIC-5,92□□□□□ -3,36
Sdc2P43407 Mir466l-201ENSMUST00000104866 121 ntBASIC-5,98□□□□□ -3,37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93,9 ms