Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Mir382-201ENSMUST00000083494 76 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Hoxd11P23813 Mir7057-201ENSMUST00000184685 58 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Hoxd11P23813 Gm24256-201ENSMUST00000083696 84 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Hoxd11P23813 Mir677-202ENSMUST00000197076 78 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Hoxd11P23813 Gm22813-201ENSMUST00000199948 123 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Hoxd11P23813 Gm23812-201ENSMUST00000175156 84 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Hoxd11P23813 Gm23374-201ENSMUST00000175408 84 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Hoxd11P23813 Mir214-201ENSMUST00000083582 110 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Hoxd11P23813 Gm26152-201ENSMUST00000157427 101 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Hoxd11P23813 Gm23166-201ENSMUST00000157164 101 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Hoxd11P23813 Mir145b-201ENSMUST00000184434 75 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Hoxd11P23813 Gm22296-201ENSMUST00000083310 103 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Hoxd11P23813 n-R5s8-201ENSMUST00000104121 118 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Hoxd11P23813 Gm23308-201ENSMUST00000179475 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Hoxd11P23813 Snord123-201ENSMUST00000158692 71 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Hoxd11P23813 Gm26008-201ENSMUST00000158797 99 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Hoxd11P23813 Gm23248-201ENSMUST00000083367 108 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Hoxd11P23813 Mir493-201ENSMUST00000103837 83 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Hoxd11P23813 Gm26395-201ENSMUST00000104094 132 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Hoxd11P23813 Mir145a-201ENSMUST00000083658 70 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Hoxd11P23813 Mir3470a-201ENSMUST00000175223 77 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Hoxd11P23813 Gm23918-201ENSMUST00000175253 106 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Hoxd11P23813 Gm26124-201ENSMUST00000083359 108 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Hoxd11P23813 Gm17522-202ENSMUST00000186631 174 ntTSL 1 (best) BASIC0.09□□□□□ -2.4
Hoxd11P23813 Gm17412-202ENSMUST00000189566 174 ntTSL 1 (best) BASIC0.09□□□□□ -2.4
Hoxd11P23813 Gm45374-201ENSMUST00000211388 136 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Hoxd11P23813 Gm23428-201ENSMUST00000122488 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Hoxd11P23813 Snora16a-201ENSMUST00000083163 136 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Hoxd11P23813 Gm26043-201ENSMUST00000116912 91 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Hoxd11P23813 Mir7043-201ENSMUST00000184219 70 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Hoxd11P23813 Gm23314-201ENSMUST00000157218 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Hoxd11P23813 Gm27884-201ENSMUST00000183865 76 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Hoxd11P23813 Gm25703-201ENSMUST00000083123 151 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Hoxd11P23813 Gm25905-201ENSMUST00000158490 101 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Hoxd11P23813 Gm23974-201ENSMUST00000083321 131 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Hoxd11P23813 Gm27671-201ENSMUST00000183739 66 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Hoxd11P23813 Traj29-201ENSMUST00000103712 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
Hoxd11P23813 Gm22077-201ENSMUST00000157594 93 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Hoxd11P23813 Gm43943-201ENSMUST00000204201 113 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Hoxd11P23813 Gm23421-201ENSMUST00000158934 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Hoxd11P23813 Mir302c-201ENSMUST00000083548 68 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Hoxd11P23813 Gm25149-201ENSMUST00000157119 82 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Hoxd11P23813 n-R5s42-201ENSMUST00000082697 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Hoxd11P23813 Gm25338-201ENSMUST00000116849 120 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Hoxd11P23813 Gm22464-201ENSMUST00000175273 64 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Hoxd11P23813 Mir669m-1-201ENSMUST00000158945 98 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Hoxd11P23813 Gm24016-201ENSMUST00000157726 68 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Hoxd11P23813 Mir378c-201ENSMUST00000184478 99 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Hoxd11P23813 Gm24714-201ENSMUST00000102382 101 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Hoxd11P23813 Mir5124b-201ENSMUST00000184251 85 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Hoxd11P23813 Gm24887-201ENSMUST00000104386 108 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Hoxd11P23813 Mir103-1-201ENSMUST00000083619 86 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Hoxd11P23813 Gm24823-201ENSMUST00000175092 91 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Hoxd11P23813 Gm21830-201ENSMUST00000178898 135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
Hoxd11P23813 Gm26131-201ENSMUST00000082725 110 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Hoxd11P23813 Mir124a-1-201ENSMUST00000083663 85 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Hoxd11P23813 Mir379-201ENSMUST00000083564 66 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Hoxd11P23813 Gm27882-201ENSMUST00000184904 74 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Hoxd11P23813 Snord8-201ENSMUST00000175303 110 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Hoxd11P23813 Gm24108-201ENSMUST00000175495 77 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Hoxd11P23813 Mir543-201ENSMUST00000102286 76 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Hoxd11P23813 Mir7218-201ENSMUST00000200050 59 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Hoxd11P23813 Gm24631-201ENSMUST00000122765 81 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Hoxd11P23813 Gm26233-201ENSMUST00000175530 70 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Hoxd11P23813 Gm22566-201ENSMUST00000175541 85 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Hoxd11P23813 Gm44311-201ENSMUST00000196448 69 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Hoxd11P23813 n-R5s153-201ENSMUST00000083451 116 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Hoxd11P23813 Mir6961-201ENSMUST00000183874 67 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Hoxd11P23813 Mir183-201ENSMUST00000083685 70 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Hoxd11P23813 Gm24704-201ENSMUST00000093715 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Hoxd11P23813 Mir344h-1-201ENSMUST00000174922 60 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Hoxd11P23813 Mir344h-2-201ENSMUST00000175612 60 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Hoxd11P23813 Gm26122-201ENSMUST00000083362 82 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Hoxd11P23813 Mir297a-3-201ENSMUST00000103768 102 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Hoxd11P23813 Gm27944-201ENSMUST00000185155 103 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Hoxd11P23813 Mir148a-201ENSMUST00000083571 99 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Hoxd11P23813 n-R5s155-201ENSMUST00000122531 113 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Hoxd11P23813 Mir1906-1-201ENSMUST00000122586 80 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Hoxd11P23813 Mir1906-2-201ENSMUST00000122610 80 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Hoxd11P23813 Mir3101-201ENSMUST00000175607 88 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Hoxd11P23813 Gm22813-202ENSMUST00000200346 124 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Hoxd11P23813 Gm23707-201ENSMUST00000104366 125 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Hoxd11P23813 Mir7086-201ENSMUST00000183683 65 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Hoxd11P23813 Gm27935-201ENSMUST00000183894 79 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Hoxd11P23813 Gm22385-201ENSMUST00000158189 101 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Hoxd11P23813 Mirlet7b-201ENSMUST00000083630 85 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Hoxd11P23813 Gm23216-201ENSMUST00000179545 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Hoxd11P23813 Gm23831-201ENSMUST00000158895 85 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Hoxd11P23813 Gm23066-201ENSMUST00000158237 71 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Hoxd11P23813 Gm26125-201ENSMUST00000083357 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Hoxd11P23813 Gm24185-201ENSMUST00000122578 105 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Hoxd11P23813 Gm25039-201ENSMUST00000082933 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Hoxd11P23813 Gm22938-201ENSMUST00000103956 120 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Hoxd11P23813 Gm25626-201ENSMUST00000177631 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Hoxd11P23813 Mir7055-201ENSMUST00000197423 59 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Hoxd11P23813 Mir7670-201ENSMUST00000183689 69 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Hoxd11P23813 Gm23316-201ENSMUST00000157997 114 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
Hoxd11P23813 Mirlet7a-2-201ENSMUST00000175029 96 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
Hoxd11P23813 Mir122-201ENSMUST00000083468 66 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
Hoxd11P23813 Gm24806-201ENSMUST00000117036 90 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
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