Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5Y6

Ighv1-85, Immunoglobulin heavy variable 1-85 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm25516-201ENSMUST00000083857 107 ntBASIC-3,59□□□□□ -2,98
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm24378-201ENSMUST00000122699 106 ntBASIC-3,6□□□□□ -2,99
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm25183-201ENSMUST00000157752 106 ntBASIC-3,6□□□□□ -2,99
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm22095-201ENSMUST00000158984 150 ntBASIC-3,6□□□□□ -2,99
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm24495-201ENSMUST00000178575 79 ntBASIC-3,6□□□□□ -2,99
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm22253-201ENSMUST00000179870 79 ntBASIC-3,6□□□□□ -2,99
Ighv1-85A0A075B5Y6 Mir124a-1-201ENSMUST00000083663 85 ntBASIC-3,6□□□□□ -2,99
Ighv1-85A0A075B5Y6 Mir664-201ENSMUST00000196796 69 ntBASIC-3,62□□□□□ -2,99
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm22213-201ENSMUST00000157564 119 ntBASIC-3,63□□□□□ -2,99
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm25681-201ENSMUST00000083938 106 ntBASIC-3,63□□□□□ -2,99
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm22195-201ENSMUST00000116861 108 ntBASIC-3,65□□□□□ -2,99
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm23644-201ENSMUST00000157856 77 ntBASIC-3,66□□□□□ -3
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm23350-201ENSMUST00000158429 103 ntBASIC-3,67□□□□□ -3
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm24234-201ENSMUST00000104316 107 ntBASIC-3,68□□□□□ -3
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm24167-201ENSMUST00000177733 124 ntBASIC-3,68□□□□□ -3
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm24028-201ENSMUST00000178991 124 ntBASIC-3,68□□□□□ -3
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm23578-201ENSMUST00000103943 104 ntBASIC-3,69□□□□□ -3
Ighv1-85A0A075B5Y6 Mir1955-201ENSMUST00000158014 98 ntBASIC-3,69□□□□□ -3
Ighv1-85A0A075B5Y6 Mir1950-201ENSMUST00000158526 74 ntBASIC-3,69□□□□□ -3
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm22056-201ENSMUST00000083386 81 ntBASIC-3,69□□□□□ -3
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm24651-201ENSMUST00000157107 107 ntBASIC-3,73□□□□□ -3,01
Ighv1-85A0A075B5Y6 Mir125b-1-201ENSMUST00000175613 77 ntBASIC-3,73□□□□□ -3,01
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm23966-201ENSMUST00000179823 107 ntBASIC-3,73□□□□□ -3,01
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm27450-201ENSMUST00000104632 90 ntBASIC-3,74□□□□□ -3,01
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm25867-201ENSMUST00000158254 103 ntBASIC-3,74□□□□□ -3,01
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm22925-201ENSMUST00000174956 102 ntBASIC-3,77□□□□□ -3,01
Ighv1-85A0A075B5Y6 n-R5s155-201ENSMUST00000122531 113 ntBASIC-3,78□□□□□ -3,01
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm22260-201ENSMUST00000178643 107 ntBASIC-3,79□□□□□ -3,02
Ighv1-85A0A075B5Y6 AC157278.1-201ENSMUST00000221621 148 ntBASIC-3,79□□□□□ -3,02
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm26139-201ENSMUST00000180098 107 ntBASIC-3,81□□□□□ -3,02
Ighv1-85A0A075B5Y6 Mir7116-201ENSMUST00000195956 70 ntBASIC-3,81□□□□□ -3,02
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm26008-201ENSMUST00000158797 99 ntBASIC-3,82□□□□□ -3,02
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm24226-201ENSMUST00000158826 97 ntBASIC-3,84□□□□□ -3,02
Ighv1-85A0A075B5Y6 Mir466b-2-201ENSMUST00000103778 82 ntBASIC-3,87□□□□□ -3,03
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm26485-201ENSMUST00000158019 64 ntBASIC-3,87□□□□□ -3,03
Ighv1-85A0A075B5Y6 Mir1187-201ENSMUST00000116936 122 ntBASIC-3,91□□□□□ -3,04
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm24605-201ENSMUST00000104772 96 ntBASIC-3,94□□□□□ -3,04
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm11966-201ENSMUST00000119907 87 ntBASIC-3,94□□□□□ -3,04
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm22039-201ENSMUST00000157278 132 ntBASIC-3,94□□□□□ -3,04
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm24710-201ENSMUST00000175235 101 ntBASIC-3,94□□□□□ -3,04
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm24135-201ENSMUST00000179085 101 ntBASIC-3,94□□□□□ -3,04
Ighv1-85A0A075B5Y6 n-R5s218-201ENSMUST00000122583 109 ntBASIC-3,95□□□□□ -3,04
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm25222-201ENSMUST00000158199 126 ntBASIC-3,95□□□□□ -3,04
Ighv1-85A0A075B5Y6 Snord58b-201ENSMUST00000082937 66 ntBASIC-3,95□□□□□ -3,04
Ighv1-85A0A075B5Y6 Mir297a-2-201ENSMUST00000103795 90 ntBASIC-3,96□□□□□ -3,04
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm25465-201ENSMUST00000157716 105 ntBASIC-3,96□□□□□ -3,04
Ighv1-85A0A075B5Y6 Mir450b-201ENSMUST00000102095 82 ntBASIC-4□□□□□ -3,05
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC-4,04□□□□□ -3,06
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm22845-201ENSMUST00000157712 104 ntBASIC-4,05□□□□□ -3,06
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm44353-201ENSMUST00000200618 138 ntBASIC-4,06□□□□□ -3,06
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm23678-201ENSMUST00000083157 107 ntBASIC-4,06□□□□□ -3,06
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm25987-201ENSMUST00000083234 107 ntBASIC-4,08□□□□□ -3,06
Ighv1-85A0A075B5Y6 Mir669a-3-201ENSMUST00000102074 109 ntBASIC-4,09□□□□□ -3,06
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm23785-201ENSMUST00000116741 96 ntBASIC-4,09□□□□□ -3,06
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm22251-201ENSMUST00000083216 107 ntBASIC-4,09□□□□□ -3,06
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm20734-201ENSMUST00000216939 193 ntBASIC-4,1□□□□□ -3,07
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm26306-201ENSMUST00000157773 119 ntBASIC-4,11□□□□□ -3,07
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm24148-201ENSMUST00000082762 80 ntBASIC-4,11□□□□□ -3,07
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm24387-201ENSMUST00000104625 90 ntBASIC-4,13□□□□□ -3,07
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm23652-201ENSMUST00000116752 107 ntBASIC-4,13□□□□□ -3,07
Ighv1-85A0A075B5Y6 Snord50a-201ENSMUST00000178154 72 ntBASIC-4,17□□□□□ -3,08
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm24463-201ENSMUST00000178417 72 ntBASIC-4,17□□□□□ -3,08
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm27671-201ENSMUST00000183739 66 ntBASIC-4,17□□□□□ -3,08
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm22474-201ENSMUST00000179407 107 ntBASIC-4,21□□□□□ -3,08
Ighv1-85A0A075B5Y6 AL929417.1-201ENSMUST00000214901 124 ntBASIC-4,21□□□□□ -3,08
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm26227-201ENSMUST00000082510 101 ntBASIC-4,22□□□□□ -3,08
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm23293-201ENSMUST00000082552 104 ntBASIC-4,23□□□□□ -3,09
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm25815-201ENSMUST00000082755 107 ntBASIC-4,23□□□□□ -3,09
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm23038-201ENSMUST00000083873 104 ntBASIC-4,23□□□□□ -3,09
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm10563-201ENSMUST00000115821 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-4,26□□□□□ -3,09
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm23210-201ENSMUST00000158668 98 ntBASIC-4,26□□□□□ -3,09
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm22078-201ENSMUST00000157593 103 ntBASIC-4,27□□□□□ -3,09
Ighv1-85A0A075B5Y6 Mir7681-201ENSMUST00000184834 72 ntBASIC-4,3□□□□□ -3,1
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm24410-201ENSMUST00000083433 107 ntBASIC-4,33□□□□□ -3,1
Ighv1-85A0A075B5Y6 mt-Tl2-201ENSMUST00000082417 71 ntBASIC-4,35□□□□□ -3,11
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm23961-201ENSMUST00000104685 97 ntBASIC-4,39□□□□□ -3,11
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm25382-201ENSMUST00000157811 97 ntBASIC-4,4□□□□□ -3,11
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm22950-201ENSMUST00000082776 107 ntBASIC-4,4□□□□□ -3,11
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm22381-201ENSMUST00000158186 107 ntBASIC-4,41□□□□□ -3,12
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm22679-201ENSMUST00000116975 100 ntBASIC-4,43□□□□□ -3,12
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm25521-201ENSMUST00000158393 108 ntBASIC-4,44□□□□□ -3,12
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm22301-201ENSMUST00000082656 107 ntBASIC-4,46□□□□□ -3,12
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm22550-201ENSMUST00000179774 107 ntBASIC-4,48□□□□□ -3,13
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm22060-201ENSMUST00000082558 107 ntBASIC-4,48□□□□□ -3,13
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm25022-201ENSMUST00000102205 83 ntBASIC-4,5□□□□□ -3,13
Ighv1-85A0A075B5Y6 Mir467a-6-201ENSMUST00000177790 83 ntBASIC-4,5□□□□□ -3,13
Ighv1-85A0A075B5Y6 Mir467a-3-201ENSMUST00000178082 83 ntBASIC-4,5□□□□□ -3,13
Ighv1-85A0A075B5Y6 Mir467a-7-201ENSMUST00000178635 83 ntBASIC-4,5□□□□□ -3,13
Ighv1-85A0A075B5Y6 Mir467a-10-201ENSMUST00000179320 83 ntBASIC-4,5□□□□□ -3,13
Ighv1-85A0A075B5Y6 Mir467a-5-201ENSMUST00000179352 83 ntBASIC-4,5□□□□□ -3,13
Ighv1-85A0A075B5Y6 Mir467a-2-201ENSMUST00000179447 83 ntBASIC-4,5□□□□□ -3,13
Ighv1-85A0A075B5Y6 Mir467a-9-201ENSMUST00000179752 83 ntBASIC-4,5□□□□□ -3,13
Ighv1-85A0A075B5Y6 Mir467a-4-201ENSMUST00000179923 83 ntBASIC-4,5□□□□□ -3,13
Ighv1-85A0A075B5Y6 Mir467a-8-201ENSMUST00000180070 83 ntBASIC-4,5□□□□□ -3,13
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm22127-201ENSMUST00000083239 106 ntBASIC-4,51□□□□□ -3,13
Ighv1-85A0A075B5Y6 Traj42-201ENSMUST00000103700 64 ntAPPRIS P1 BASIC-4,53□□□□□ -3,13
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm44303-201ENSMUST00000196348 83 ntBASIC-4,55□□□□□ -3,14
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm25254-201ENSMUST00000157239 104 ntBASIC-4,57□□□□□ -3,14
Ighv1-85A0A075B5Y6 Gm24482-201ENSMUST00000117005 93 ntBASIC-4,59□□□□□ -3,14
Ighv1-85A0A075B5Y6 Mir669m-2-201ENSMUST00000158355 98 ntBASIC-4,61□□□□□ -3,15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101,8 ms