Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm10663-201ENSMUST00000098716 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
Chmp3Q9CQ10 Gm24651-201ENSMUST00000157107 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Chmp3Q9CQ10 Gm25596-201ENSMUST00000178368 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Chmp3Q9CQ10 Mir7094-2-201ENSMUST00000184622 60 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Chmp3Q9CQ10 Mir7094-1-201ENSMUST00000199671 60 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Chmp3Q9CQ10 Gm22197-201ENSMUST00000116866 58 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Chmp3Q9CQ10 Mir1839-201ENSMUST00000175366 127 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Chmp3Q9CQ10 Gm44589-201ENSMUST00000207025 115 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Chmp3Q9CQ10 Gm22260-201ENSMUST00000178643 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Chmp3Q9CQ10 Mir295-201ENSMUST00000104694 69 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Chmp3Q9CQ10 Mir125b-1-201ENSMUST00000175613 77 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Chmp3Q9CQ10 Gm25338-201ENSMUST00000116849 120 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Chmp3Q9CQ10 Gm24887-201ENSMUST00000104386 108 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Chmp3Q9CQ10 Gm25023-201ENSMUST00000082977 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Chmp3Q9CQ10 Gm22056-201ENSMUST00000083386 81 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Chmp3Q9CQ10 Gm25431-201ENSMUST00000101978 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Chmp3Q9CQ10 Gm25388-201ENSMUST00000157339 151 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Chmp3Q9CQ10 Gm25995-201ENSMUST00000175396 142 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Chmp3Q9CQ10 Mir6957-201ENSMUST00000183708 64 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Chmp3Q9CQ10 n-R5s8-201ENSMUST00000104121 118 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Chmp3Q9CQ10 Gm26306-201ENSMUST00000157773 119 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Chmp3Q9CQ10 Traj38-201ENSMUST00000103704 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
Chmp3Q9CQ10 Gm25225-201ENSMUST00000158197 102 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Chmp3Q9CQ10 Gm19248-201ENSMUST00000209404 110 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Chmp3Q9CQ10 Gm25712-201ENSMUST00000158634 93 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Chmp3Q9CQ10 Snora16a-202ENSMUST00000196061 137 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Chmp3Q9CQ10 Gm44347-201ENSMUST00000199602 108 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Chmp3Q9CQ10 Snord16a-201ENSMUST00000083895 99 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Chmp3Q9CQ10 Mir466q-201ENSMUST00000175249 76 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Chmp3Q9CQ10 Mir378c-201ENSMUST00000184478 99 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Chmp3Q9CQ10 Gm22301-201ENSMUST00000082656 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Chmp3Q9CQ10 Gm23314-201ENSMUST00000157218 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Chmp3Q9CQ10 Gm23904-201ENSMUST00000157567 124 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Chmp3Q9CQ10 Mir677-202ENSMUST00000197076 78 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Chmp3Q9CQ10 Gm24372-201ENSMUST00000104400 110 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Chmp3Q9CQ10 Mir29b-1-201ENSMUST00000083670 71 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Chmp3Q9CQ10 Gm24587-201ENSMUST00000116697 89 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Chmp3Q9CQ10 Gm24531-201ENSMUST00000157945 100 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Chmp3Q9CQ10 Mir6904-201ENSMUST00000183443 67 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Chmp3Q9CQ10 Gm24003-201ENSMUST00000158455 100 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Chmp3Q9CQ10 Gm25772-201ENSMUST00000158574 56 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Chmp3Q9CQ10 Mir367-201ENSMUST00000083479 75 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Chmp3Q9CQ10 Gm22607-201ENSMUST00000158291 105 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Chmp3Q9CQ10 Gm45688-201ENSMUST00000210002 101 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Chmp3Q9CQ10 Mir466f-1-201ENSMUST00000104779 94 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Chmp3Q9CQ10 Gm26262-201ENSMUST00000158024 127 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Chmp3Q9CQ10 mt-Tl1-201ENSMUST00000082391 75 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Chmp3Q9CQ10 Gm22602-201ENSMUST00000157596 95 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Chmp3Q9CQ10 Gm24823-201ENSMUST00000175092 91 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Chmp3Q9CQ10 Gm26227-201ENSMUST00000082510 101 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Chmp3Q9CQ10 Gm24381-201ENSMUST00000122697 104 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Chmp3Q9CQ10 Gm24097-201ENSMUST00000178720 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Chmp3Q9CQ10 Gm22550-201ENSMUST00000179774 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Chmp3Q9CQ10 Gm22060-201ENSMUST00000082558 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Chmp3Q9CQ10 Mir5124b-201ENSMUST00000184251 85 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Chmp3Q9CQ10 Snord49b-201ENSMUST00000082503 72 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
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Chmp3Q9CQ10 Mir344h-1-201ENSMUST00000174922 60 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Chmp3Q9CQ10 Gm23811-201ENSMUST00000175155 84 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Chmp3Q9CQ10 Mir344h-2-201ENSMUST00000175612 60 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Chmp3Q9CQ10 Gm24714-201ENSMUST00000102382 101 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Chmp3Q9CQ10 Gm23308-201ENSMUST00000179475 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
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Chmp3Q9CQ10 Gm24296-201ENSMUST00000158297 106 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Chmp3Q9CQ10 Gm27735-201ENSMUST00000185085 76 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Chmp3Q9CQ10 Gm24673-201ENSMUST00000116948 124 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Chmp3Q9CQ10 Gm23108-201ENSMUST00000178295 124 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Chmp3Q9CQ10 Mir28c-201ENSMUST00000200096 75 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Chmp3Q9CQ10 mt-Ts1-201ENSMUST00000082403 69 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Chmp3Q9CQ10 Gm23690-201ENSMUST00000083036 94 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Chmp3Q9CQ10 AC122210.2-201ENSMUST00000220216 115 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
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Chmp3Q9CQ10 Gm25429-201ENSMUST00000157607 132 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
Chmp3Q9CQ10 Gm44311-201ENSMUST00000196448 69 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
Chmp3Q9CQ10 Gm22013-201ENSMUST00000158788 103 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
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Chmp3Q9CQ10 Mir183-201ENSMUST00000083685 70 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
Chmp3Q9CQ10 Gm23315-201ENSMUST00000158003 109 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
Chmp3Q9CQ10 Gm22813-202ENSMUST00000200346 124 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
Chmp3Q9CQ10 Gm25493-201ENSMUST00000157375 103 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
Chmp3Q9CQ10 Gm24051-201ENSMUST00000158622 75 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
Chmp3Q9CQ10 Gm24646-201ENSMUST00000157109 99 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
Chmp3Q9CQ10 Gm24775-201ENSMUST00000157377 99 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
Chmp3Q9CQ10 Gm24108-201ENSMUST00000175495 77 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
Chmp3Q9CQ10 CT030166.3-201ENSMUST00000223203 193 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
Chmp3Q9CQ10 Gm27884-201ENSMUST00000183865 76 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
Chmp3Q9CQ10 Mir192-201ENSMUST00000083589 89 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
Chmp3Q9CQ10 Snord123-201ENSMUST00000158692 71 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
Chmp3Q9CQ10 Mir103-1-201ENSMUST00000083619 86 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
Chmp3Q9CQ10 Gm22489-201ENSMUST00000116813 62 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
Chmp3Q9CQ10 Mir6961-201ENSMUST00000183874 67 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
Chmp3Q9CQ10 Gm24704-201ENSMUST00000093715 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
Chmp3Q9CQ10 Gm43943-201ENSMUST00000204201 113 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
Chmp3Q9CQ10 Gm26472-201ENSMUST00000116760 83 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
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