Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AL359634.1-201ENST00000429807 1179 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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TRAF1Q13077 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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TRAF1Q13077 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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TRAF1Q13077 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
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TRAF1Q13077 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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