Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm24895-201ENSMUST00000122742 74 ntBASIC1,18□□□□□ -2,22
Hoxd11P23813 Gm25772-201ENSMUST00000158574 56 ntBASIC1,18□□□□□ -2,22
Hoxd11P23813 Mir1969-201ENSMUST00000157623 94 ntBASIC1,17□□□□□ -2,22
Hoxd11P23813 Gm28001-201ENSMUST00000183561 117 ntBASIC1,17□□□□□ -2,22
Hoxd11P23813 Mirlet7d-201ENSMUST00000083519 103 ntBASIC1,17□□□□□ -2,22
Hoxd11P23813 Gm25137-201ENSMUST00000083251 110 ntBASIC1,16□□□□□ -2,22
Hoxd11P23813 Mir6381-201ENSMUST00000183426 87 ntBASIC1,15□□□□□ -2,23
Hoxd11P23813 Gm22783-201ENSMUST00000104089 107 ntBASIC1,13□□□□□ -2,23
Hoxd11P23813 Mir3109-201ENSMUST00000175301 88 ntBASIC1,12□□□□□ -2,23
Hoxd11P23813 Mir7077-201ENSMUST00000183991 57 ntBASIC1,11□□□□□ -2,23
Hoxd11P23813 AC167019.1-201ENSMUST00000227913 106 ntBASIC1,11□□□□□ -2,23
Hoxd11P23813 Gm44301-201ENSMUST00000200362 143 ntBASIC1,1□□□□□ -2,23
Hoxd11P23813 Gm24336-201ENSMUST00000104203 146 ntBASIC1,08□□□□□ -2,24
Hoxd11P23813 Mir1904-201ENSMUST00000122702 80 ntBASIC1,08□□□□□ -2,24
Hoxd11P23813 Gm24777-201ENSMUST00000157644 107 ntBASIC1,08□□□□□ -2,24
Hoxd11P23813 Gm44589-201ENSMUST00000207025 115 ntBASIC1,08□□□□□ -2,24
Hoxd11P23813 Gm24865-201ENSMUST00000103246 96 ntBASIC1,06□□□□□ -2,24
Hoxd11P23813 Gm44375-201ENSMUST00000196657 150 ntBASIC1,04□□□□□ -2,24
Hoxd11P23813 Gm22980-201ENSMUST00000082608 70 ntBASIC1,04□□□□□ -2,24
Hoxd11P23813 Gm23904-201ENSMUST00000157567 124 ntBASIC1,03□□□□□ -2,24
Hoxd11P23813 Gm26363-201ENSMUST00000158866 83 ntBASIC1,03□□□□□ -2,24
Hoxd11P23813 Mir3967-201ENSMUST00000198710 68 ntBASIC1,03□□□□□ -2,24
Hoxd11P23813 Mir29b-1-201ENSMUST00000083670 71 ntBASIC1,03□□□□□ -2,24
Hoxd11P23813 Gm22485-201ENSMUST00000157990 109 ntBASIC1,02□□□□□ -2,25
Hoxd11P23813 Gm22313-201ENSMUST00000158008 129 ntBASIC1,02□□□□□ -2,25
Hoxd11P23813 Gm44328-201ENSMUST00000199331 75 ntBASIC1,01□□□□□ -2,25
Hoxd11P23813 Gm24091-201ENSMUST00000082550 83 ntBASIC1□□□□□ -2,25
Hoxd11P23813 Gm23711-201ENSMUST00000083856 83 ntBASIC1□□□□□ -2,25
Hoxd11P23813 Gm23605-201ENSMUST00000157255 127 ntBASIC0,99□□□□□ -2,25
Hoxd11P23813 Gm24003-201ENSMUST00000158455 100 ntBASIC0,98□□□□□ -2,25
Hoxd11P23813 Gm25249-201ENSMUST00000175471 78 ntBASIC0,98□□□□□ -2,25
Hoxd11P23813 Mir3089-201ENSMUST00000175350 84 ntBASIC0,96□□□□□ -2,26
Hoxd11P23813 Gm25683-201ENSMUST00000083940 131 ntBASIC0,96□□□□□ -2,26
Hoxd11P23813 Mir6957-201ENSMUST00000183708 64 ntBASIC0,95□□□□□ -2,26
Hoxd11P23813 Snord16a-201ENSMUST00000083895 99 ntBASIC0,94□□□□□ -2,26
Hoxd11P23813 Mir539-201ENSMUST00000102109 74 ntBASIC0,92□□□□□ -2,26
Hoxd11P23813 Mir574-201ENSMUST00000103854 78 ntBASIC0,91□□□□□ -2,26
Hoxd11P23813 Mir191-201ENSMUST00000196210 74 ntBASIC0,91□□□□□ -2,26
Hoxd11P23813 Mir6915-201ENSMUST00000198839 69 ntBASIC0,91□□□□□ -2,26
Hoxd11P23813 Gm22573-201ENSMUST00000082982 102 ntBASIC0,91□□□□□ -2,26
Hoxd11P23813 Mir466b-2-201ENSMUST00000103778 82 ntBASIC0,9□□□□□ -2,27
Hoxd11P23813 Gm22962-201ENSMUST00000157962 73 ntBASIC0,9□□□□□ -2,27
Hoxd11P23813 Snord49b-201ENSMUST00000082503 72 ntBASIC0,9□□□□□ -2,27
Hoxd11P23813 Mir6380-201ENSMUST00000184334 81 ntBASIC0,89□□□□□ -2,27
Hoxd11P23813 Gm25596-201ENSMUST00000178368 107 ntBASIC0,86□□□□□ -2,27
Hoxd11P23813 Gm27475-201ENSMUST00000183420 61 ntBASIC0,86□□□□□ -2,27
Hoxd11P23813 Mir672-201ENSMUST00000102331 100 ntBASIC0,85□□□□□ -2,27
Hoxd11P23813 Gm25254-201ENSMUST00000157239 104 ntBASIC0,83□□□□□ -2,28
Hoxd11P23813 Gm27735-201ENSMUST00000185085 76 ntBASIC0,83□□□□□ -2,28
Hoxd11P23813 Gm26262-201ENSMUST00000158024 127 ntBASIC0,82□□□□□ -2,28
Hoxd11P23813 Gm25712-201ENSMUST00000158634 93 ntBASIC0,8□□□□□ -2,28
Hoxd11P23813 Gm25472-201ENSMUST00000175454 78 ntBASIC0,8□□□□□ -2,28
Hoxd11P23813 Mir8107-201ENSMUST00000184024 117 ntBASIC0,8□□□□□ -2,28
Hoxd11P23813 Gm23735-201ENSMUST00000082551 134 ntBASIC0,79□□□□□ -2,28
Hoxd11P23813 Mir216a-201ENSMUST00000083605 72 ntBASIC0,79□□□□□ -2,28
Hoxd11P23813 Gm25225-201ENSMUST00000158197 102 ntBASIC0,76□□□□□ -2,29
Hoxd11P23813 n-R5s171-201ENSMUST00000104128 79 ntBASIC0,75□□□□□ -2,29
Hoxd11P23813 Gm25429-201ENSMUST00000157607 132 ntBASIC0,73□□□□□ -2,29
Hoxd11P23813 Gm44828-201ENSMUST00000203745 106 ntBASIC0,73□□□□□ -2,29
Hoxd11P23813 Gm24833-201ENSMUST00000116775 120 ntBASIC0,71□□□□□ -2,3
Hoxd11P23813 Snord85-201ENSMUST00000083262 73 ntBASIC0,67□□□□□ -2,3
Hoxd11P23813 Mir710-201ENSMUST00000102088 110 ntBASIC0,66□□□□□ -2,3
Hoxd11P23813 Gm25493-201ENSMUST00000157375 103 ntBASIC0,66□□□□□ -2,3
Hoxd11P23813 Gm24903-201ENSMUST00000158131 126 ntBASIC0,66□□□□□ -2,3
Hoxd11P23813 Gm24775-201ENSMUST00000157377 99 ntBASIC0,64□□□□□ -2,31
Hoxd11P23813 Gm24455-201ENSMUST00000083348 131 ntBASIC0,64□□□□□ -2,31
Hoxd11P23813 Gm23199-201ENSMUST00000158812 107 ntBASIC0,6□□□□□ -2,31
Hoxd11P23813 Gm22013-201ENSMUST00000158788 103 ntBASIC0,59□□□□□ -2,31
Hoxd11P23813 n-R5s18-201ENSMUST00000122740 121 ntBASIC0,58□□□□□ -2,32
Hoxd11P23813 Gm26210-201ENSMUST00000158680 91 ntBASIC0,58□□□□□ -2,32
Hoxd11P23813 Gm19248-201ENSMUST00000209404 110 ntBASIC0,57□□□□□ -2,32
Hoxd11P23813 AL845349.1-201ENSMUST00000213794 78 ntBASIC0,57□□□□□ -2,32
Hoxd11P23813 Gm22759-201ENSMUST00000102276 96 ntBASIC0,56□□□□□ -2,32
Hoxd11P23813 Gm26116-201ENSMUST00000175600 77 ntBASIC0,56□□□□□ -2,32
Hoxd11P23813 Mir7094-2-201ENSMUST00000184622 60 ntBASIC0,55□□□□□ -2,32
Hoxd11P23813 Mir7094-1-201ENSMUST00000199671 60 ntBASIC0,55□□□□□ -2,32
Hoxd11P23813 Gm22324-201ENSMUST00000158903 114 ntBASIC0,54□□□□□ -2,32
Hoxd11P23813 Gm23690-201ENSMUST00000083036 94 ntBASIC0,54□□□□□ -2,32
Hoxd11P23813 Gm25032-201ENSMUST00000175411 84 ntBASIC0,53□□□□□ -2,32
Hoxd11P23813 Gm22327-201ENSMUST00000158899 108 ntBASIC0,51□□□□□ -2,33
Hoxd11P23813 Gm27366-201ENSMUST00000184967 108 ntBASIC0,5□□□□□ -2,33
Hoxd11P23813 Gm22234-201ENSMUST00000174906 65 ntBASIC0,48□□□□□ -2,33
Hoxd11P23813 Gm24197-201ENSMUST00000175085 109 ntBASIC0,48□□□□□ -2,33
Hoxd11P23813 Gm27610-201ENSMUST00000184026 74 ntBASIC0,48□□□□□ -2,33
Hoxd11P23813 Snora16a-202ENSMUST00000196061 137 ntBASIC0,45□□□□□ -2,34
Hoxd11P23813 Gm25952-201ENSMUST00000175329 74 ntBASIC0,44□□□□□ -2,34
Hoxd11P23813 Gm24587-201ENSMUST00000116697 89 ntBASIC0,43□□□□□ -2,34
Hoxd11P23813 Gm22446-201ENSMUST00000180108 104 ntBASIC0,43□□□□□ -2,34
Hoxd11P23813 Mir7038-201ENSMUST00000184833 71 ntBASIC0,43□□□□□ -2,34
Hoxd11P23813 Gm22942-201ENSMUST00000158563 124 ntBASIC0,42□□□□□ -2,34
Hoxd11P23813 Gm25867-201ENSMUST00000158254 103 ntBASIC0,4□□□□□ -2,35
Hoxd11P23813 Gm43432-201ENSMUST00000196352 121 ntBASIC0,4□□□□□ -2,35
Hoxd11P23813 Traj38-201ENSMUST00000103704 62 ntAPPRIS P1 BASIC0,39□□□□□ -2,35
Hoxd11P23813 mt-Ts1-201ENSMUST00000082403 69 ntBASIC0,39□□□□□ -2,35
Hoxd11P23813 Mir96-201ENSMUST00000083652 106 ntBASIC0,38□□□□□ -2,35
Hoxd11P23813 Gm22368-201ENSMUST00000102416 109 ntBASIC0,35□□□□□ -2,35
Hoxd11P23813 Gm25601-201ENSMUST00000158356 105 ntBASIC0,35□□□□□ -2,35
Hoxd11P23813 Gm24051-201ENSMUST00000158622 75 ntBASIC0,34□□□□□ -2,36
Hoxd11P23813 Mir6964-201ENSMUST00000200252 59 ntBASIC0,34□□□□□ -2,36
Hoxd11P23813 Gm22607-201ENSMUST00000158291 105 ntBASIC0,32□□□□□ -2,36
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