Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm24895-201ENSMUST00000122742 74 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Hoxd11P23813 Gm25772-201ENSMUST00000158574 56 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Hoxd11P23813 Mir1969-201ENSMUST00000157623 94 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Hoxd11P23813 Gm28001-201ENSMUST00000183561 117 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Hoxd11P23813 Mirlet7d-201ENSMUST00000083519 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Hoxd11P23813 Gm25137-201ENSMUST00000083251 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Hoxd11P23813 Mir6381-201ENSMUST00000183426 87 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Hoxd11P23813 Gm22783-201ENSMUST00000104089 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Hoxd11P23813 Mir3109-201ENSMUST00000175301 88 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Hoxd11P23813 Mir7077-201ENSMUST00000183991 57 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Hoxd11P23813 AC167019.1-201ENSMUST00000227913 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Hoxd11P23813 Gm44301-201ENSMUST00000200362 143 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Hoxd11P23813 Gm24336-201ENSMUST00000104203 146 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Hoxd11P23813 Mir1904-201ENSMUST00000122702 80 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Hoxd11P23813 Gm24777-201ENSMUST00000157644 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Hoxd11P23813 Gm44589-201ENSMUST00000207025 115 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Hoxd11P23813 Gm24865-201ENSMUST00000103246 96 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Hoxd11P23813 Gm44375-201ENSMUST00000196657 150 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Hoxd11P23813 Gm22980-201ENSMUST00000082608 70 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Hoxd11P23813 Gm23904-201ENSMUST00000157567 124 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Hoxd11P23813 Gm26363-201ENSMUST00000158866 83 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Hoxd11P23813 Mir3967-201ENSMUST00000198710 68 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Hoxd11P23813 Mir29b-1-201ENSMUST00000083670 71 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Hoxd11P23813 Gm22485-201ENSMUST00000157990 109 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Hoxd11P23813 Gm22313-201ENSMUST00000158008 129 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Hoxd11P23813 Gm44328-201ENSMUST00000199331 75 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Hoxd11P23813 Gm24091-201ENSMUST00000082550 83 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Hoxd11P23813 Gm23711-201ENSMUST00000083856 83 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Hoxd11P23813 Gm23605-201ENSMUST00000157255 127 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Hoxd11P23813 Gm24003-201ENSMUST00000158455 100 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Hoxd11P23813 Gm25249-201ENSMUST00000175471 78 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Hoxd11P23813 Mir3089-201ENSMUST00000175350 84 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Hoxd11P23813 Gm25683-201ENSMUST00000083940 131 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Hoxd11P23813 Mir6957-201ENSMUST00000183708 64 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Hoxd11P23813 Snord16a-201ENSMUST00000083895 99 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Hoxd11P23813 Mir539-201ENSMUST00000102109 74 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Hoxd11P23813 Mir574-201ENSMUST00000103854 78 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Hoxd11P23813 Mir191-201ENSMUST00000196210 74 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Hoxd11P23813 Mir6915-201ENSMUST00000198839 69 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Hoxd11P23813 Gm22573-201ENSMUST00000082982 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Hoxd11P23813 Mir466b-2-201ENSMUST00000103778 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Hoxd11P23813 Gm22962-201ENSMUST00000157962 73 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Hoxd11P23813 Snord49b-201ENSMUST00000082503 72 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Hoxd11P23813 Mir6380-201ENSMUST00000184334 81 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Hoxd11P23813 Gm25596-201ENSMUST00000178368 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Hoxd11P23813 Gm27475-201ENSMUST00000183420 61 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Hoxd11P23813 Mir672-201ENSMUST00000102331 100 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Hoxd11P23813 Gm25254-201ENSMUST00000157239 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Hoxd11P23813 Gm27735-201ENSMUST00000185085 76 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Hoxd11P23813 Gm26262-201ENSMUST00000158024 127 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Hoxd11P23813 Gm25712-201ENSMUST00000158634 93 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Hoxd11P23813 Gm25472-201ENSMUST00000175454 78 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Hoxd11P23813 Mir8107-201ENSMUST00000184024 117 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Hoxd11P23813 Gm23735-201ENSMUST00000082551 134 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Hoxd11P23813 Mir216a-201ENSMUST00000083605 72 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Hoxd11P23813 Gm25225-201ENSMUST00000158197 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Hoxd11P23813 n-R5s171-201ENSMUST00000104128 79 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Hoxd11P23813 Gm25429-201ENSMUST00000157607 132 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Hoxd11P23813 Gm44828-201ENSMUST00000203745 106 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Hoxd11P23813 Gm24833-201ENSMUST00000116775 120 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Hoxd11P23813 Snord85-201ENSMUST00000083262 73 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Hoxd11P23813 Mir710-201ENSMUST00000102088 110 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Hoxd11P23813 Gm25493-201ENSMUST00000157375 103 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Hoxd11P23813 Gm24903-201ENSMUST00000158131 126 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Hoxd11P23813 Gm24775-201ENSMUST00000157377 99 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Hoxd11P23813 Gm24455-201ENSMUST00000083348 131 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Hoxd11P23813 Gm23199-201ENSMUST00000158812 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Hoxd11P23813 Gm22013-201ENSMUST00000158788 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Hoxd11P23813 n-R5s18-201ENSMUST00000122740 121 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Hoxd11P23813 Gm26210-201ENSMUST00000158680 91 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Hoxd11P23813 Gm19248-201ENSMUST00000209404 110 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Hoxd11P23813 AL845349.1-201ENSMUST00000213794 78 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Hoxd11P23813 Gm22759-201ENSMUST00000102276 96 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Hoxd11P23813 Gm26116-201ENSMUST00000175600 77 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Hoxd11P23813 Mir7094-2-201ENSMUST00000184622 60 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Hoxd11P23813 Mir7094-1-201ENSMUST00000199671 60 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Hoxd11P23813 Gm22324-201ENSMUST00000158903 114 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Hoxd11P23813 Gm23690-201ENSMUST00000083036 94 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Hoxd11P23813 Gm25032-201ENSMUST00000175411 84 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Hoxd11P23813 Gm22327-201ENSMUST00000158899 108 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Hoxd11P23813 Gm27366-201ENSMUST00000184967 108 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Hoxd11P23813 Gm22234-201ENSMUST00000174906 65 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Hoxd11P23813 Gm24197-201ENSMUST00000175085 109 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Hoxd11P23813 Gm27610-201ENSMUST00000184026 74 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Hoxd11P23813 Snora16a-202ENSMUST00000196061 137 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Hoxd11P23813 Gm25952-201ENSMUST00000175329 74 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Hoxd11P23813 Gm24587-201ENSMUST00000116697 89 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Hoxd11P23813 Gm22446-201ENSMUST00000180108 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Hoxd11P23813 Mir7038-201ENSMUST00000184833 71 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Hoxd11P23813 Gm22942-201ENSMUST00000158563 124 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Hoxd11P23813 Gm25867-201ENSMUST00000158254 103 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Hoxd11P23813 Gm43432-201ENSMUST00000196352 121 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Hoxd11P23813 Traj38-201ENSMUST00000103704 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.39□□□□□ -2.35
Hoxd11P23813 mt-Ts1-201ENSMUST00000082403 69 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Hoxd11P23813 Mir96-201ENSMUST00000083652 106 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Hoxd11P23813 Gm22368-201ENSMUST00000102416 109 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Hoxd11P23813 Gm25601-201ENSMUST00000158356 105 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Hoxd11P23813 Gm24051-201ENSMUST00000158622 75 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Hoxd11P23813 Mir6964-201ENSMUST00000200252 59 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Hoxd11P23813 Gm22607-201ENSMUST00000158291 105 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms