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Protein–RNA interactions for Protein: O35054
Cldn4, Claudin-4, mouse
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (Experimental data)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
Cldn4
O35054
Gm19248-201
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BASIC
-0.7
□□□□□ -2.52
Cldn4
O35054
Gm27450-201
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90 nt
BASIC
-0.71
□□□□□ -2.52
Cldn4
O35054
Gm25652-201
ENSMUST00000083780
103 nt
BASIC
-0.71
□□□□□ -2.52
Cldn4
O35054
Gm24797-201
ENSMUST00000178103
107 nt
BASIC
-0.72
□□□□□ -2.52
Cldn4
O35054
Mir5124b-201
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85 nt
BASIC
-0.72
□□□□□ -2.52
Cldn4
O35054
Mir677-202
ENSMUST00000197076
78 nt
BASIC
-0.72
□□□□□ -2.52
Cldn4
O35054
Gm22965-201
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BASIC
-0.73
□□□□□ -2.53
Cldn4
O35054
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BASIC
-0.73
□□□□□ -2.53
Cldn4
O35054
Gm26139-201
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BASIC
-0.74
□□□□□ -2.53
Cldn4
O35054
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BASIC
-0.75
□□□□□ -2.53
Cldn4
O35054
Gm24259-201
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107 nt
BASIC
-0.75
□□□□□ -2.53
Cldn4
O35054
Gm22067-201
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BASIC
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□□□□□ -2.53
Cldn4
O35054
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BASIC
-0.76
□□□□□ -2.53
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.53
Cldn4
O35054
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BASIC
-0.77
□□□□□ -2.53
Cldn4
O35054
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BASIC
-0.77
□□□□□ -2.53
Cldn4
O35054
Gm23909-201
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BASIC
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□□□□□ -2.53
Cldn4
O35054
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BASIC
-0.78
□□□□□ -2.53
Cldn4
O35054
Gm22357-201
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BASIC
-0.78
□□□□□ -2.53
Cldn4
O35054
Gm23237-201
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BASIC
-0.79
□□□□□ -2.54
Cldn4
O35054
Gm22039-201
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132 nt
BASIC
-0.79
□□□□□ -2.54
Cldn4
O35054
Gm23826-201
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119 nt
BASIC
-0.79
□□□□□ -2.54
Cldn4
O35054
Mir3101-201
ENSMUST00000175607
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BASIC
-0.79
□□□□□ -2.54
Cldn4
O35054
Gm23308-201
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BASIC
-0.79
□□□□□ -2.54
Cldn4
O35054
Gm22069-201
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107 nt
BASIC
-0.79
□□□□□ -2.54
Cldn4
O35054
AC161271.1-201
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150 nt
BASIC
-0.79
□□□□□ -2.54
Cldn4
O35054
Gm24714-201
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101 nt
BASIC
-0.8
□□□□□ -2.54
Cldn4
O35054
Gm25862-201
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129 nt
BASIC
-0.8
□□□□□ -2.54
Cldn4
O35054
Gm22943-201
ENSMUST00000158564
76 nt
BASIC
-0.8
□□□□□ -2.54
Cldn4
O35054
Mir6964-201
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59 nt
BASIC
-0.8
□□□□□ -2.54
Cldn4
O35054
Gm25431-201
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BASIC
-0.81
□□□□□ -2.54
Cldn4
O35054
Gm25465-201
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105 nt
BASIC
-0.81
□□□□□ -2.54
Cldn4
O35054
Gm22013-201
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103 nt
BASIC
-0.81
□□□□□ -2.54
Cldn4
O35054
Gm25354-201
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BASIC
-0.82
□□□□□ -2.54
Cldn4
O35054
Gm22540-201
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BASIC
-0.83
□□□□□ -2.54
Cldn4
O35054
Gm24723-201
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132 nt
BASIC
-0.83
□□□□□ -2.54
Cldn4
O35054
Gm23904-201
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124 nt
BASIC
-0.84
□□□□□ -2.54
Cldn4
O35054
Gm25712-201
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93 nt
BASIC
-0.84
□□□□□ -2.54
Cldn4
O35054
Mir7057-201
ENSMUST00000184685
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BASIC
-0.86
□□□□□ -2.55
Cldn4
O35054
Gm21830-201
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TSL 5
BASIC
-0.87
□□□□□ -2.55
Cldn4
O35054
Gm22813-202
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124 nt
BASIC
-0.87
□□□□□ -2.55
Cldn4
O35054
Gm26131-201
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110 nt
BASIC
-0.87
□□□□□ -2.55
Cldn4
O35054
Snord16a-201
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99 nt
BASIC
-0.87
□□□□□ -2.55
Cldn4
O35054
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BASIC
-0.88
□□□□□ -2.55
Cldn4
O35054
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BASIC
-0.88
□□□□□ -2.55
Cldn4
O35054
Mir302c-201
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BASIC
-0.88
□□□□□ -2.55
Cldn4
O35054
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BASIC
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Cldn4
O35054
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BASIC
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Cldn4
O35054
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BASIC
-0.92
□□□□□ -2.56
Cldn4
O35054
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BASIC
-0.92
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Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.56
Cldn4
O35054
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BASIC
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Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.56
Cldn4
O35054
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BASIC
-0.96
□□□□□ -2.56
Cldn4
O35054
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BASIC
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Cldn4
O35054
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BASIC
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Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.56
Cldn4
O35054
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Cldn4
O35054
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BASIC
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Cldn4
O35054
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BASIC
-0.99
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Cldn4
O35054
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BASIC
-1
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Cldn4
O35054
Snord8-201
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BASIC
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□□□□□ -2.57
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.57
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.57
Cldn4
O35054
Gm23992-201
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BASIC
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□□□□□ -2.57
Cldn4
O35054
Mir6961-201
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BASIC
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Cldn4
O35054
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BASIC
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Cldn4
O35054
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BASIC
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Cldn4
O35054
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□□□□□ -2.58
Cldn4
O35054
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BASIC
-1.04
□□□□□ -2.58
Cldn4
O35054
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APPRIS P1
TSL 5
BASIC
-1.06
□□□□□ -2.58
Cldn4
O35054
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BASIC
-1.07
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Cldn4
O35054
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BASIC
-1.08
□□□□□ -2.58
Cldn4
O35054
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BASIC
-1.08
□□□□□ -2.58
Cldn4
O35054
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BASIC
-1.08
□□□□□ -2.58
Cldn4
O35054
Gm25995-201
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142 nt
BASIC
-1.08
□□□□□ -2.58
Cldn4
O35054
Gm43943-201
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BASIC
-1.08
□□□□□ -2.58
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.58
Cldn4
O35054
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BASIC
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Cldn4
O35054
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BASIC
-1.09
□□□□□ -2.58
Cldn4
O35054
Gm24051-201
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BASIC
-1.1
□□□□□ -2.59
Cldn4
O35054
Gm26052-201
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BASIC
-1.11
□□□□□ -2.59
Cldn4
O35054
Gm24710-201
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BASIC
-1.11
□□□□□ -2.59
Cldn4
O35054
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BASIC
-1.11
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Cldn4
O35054
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101 nt
BASIC
-1.11
□□□□□ -2.59
Cldn4
O35054
Gm23974-201
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131 nt
BASIC
-1.11
□□□□□ -2.59
Cldn4
O35054
Mir297b-201
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BASIC
-1.12
□□□□□ -2.59
Cldn4
O35054
Gm23335-201
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BASIC
-1.12
□□□□□ -2.59
Cldn4
O35054
Mir7055-201
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BASIC
-1.12
□□□□□ -2.59
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.59
Cldn4
O35054
Gm24775-201
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BASIC
-1.14
□□□□□ -2.59
Cldn4
O35054
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76 nt
BASIC
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□□□□□ -2.59
Cldn4
O35054
Gm27944-201
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103 nt
BASIC
-1.14
□□□□□ -2.59
Cldn4
O35054
Gm24459-201
ENSMUST00000082730
86 nt
BASIC
-1.14
□□□□□ -2.59
Cldn4
O35054
Gm23787-201
ENSMUST00000122538
73 nt
BASIC
-1.15
□□□□□ -2.59
Cldn4
O35054
Gm24097-201
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107 nt
BASIC
-1.15
□□□□□ -2.59
Cldn4
O35054
Gm44347-201
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108 nt
BASIC
-1.16
□□□□□ -2.6
Cldn4
O35054
Snord123-201
ENSMUST00000158692
71 nt
BASIC
-1.17
□□□□□ -2.6
Cldn4
O35054
Mir669a-3-201
ENSMUST00000102074
109 nt
BASIC
-1.18
□□□□□ -2.6
Cldn4
O35054
Mir1955-201
ENSMUST00000158014
98 nt
BASIC
-1.19
□□□□□ -2.6
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