Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 1,324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Gm44470-201ENSMUST00000203913 142 ntBASIC-3,23□□□□□ -2,93
Ccdc171E9Q1U1 Traj43-201ENSMUST00000103699 57 ntAPPRIS P1 BASIC-3,24□□□□□ -2,93
Ccdc171E9Q1U1 Gm23434-201ENSMUST00000157179 100 ntBASIC-3,24□□□□□ -2,93
Ccdc171E9Q1U1 Gm22965-201ENSMUST00000157958 101 ntBASIC-3,24□□□□□ -2,93
Ccdc171E9Q1U1 Mir3064-201ENSMUST00000175532 67 ntBASIC-3,24□□□□□ -2,93
Ccdc171E9Q1U1 Gm25740-201ENSMUST00000180247 107 ntBASIC-3,24□□□□□ -2,93
Ccdc171E9Q1U1 n-R5s155-201ENSMUST00000122531 113 ntBASIC-3,25□□□□□ -2,93
Ccdc171E9Q1U1 Gm26253-201ENSMUST00000122493 103 ntBASIC-3,26□□□□□ -2,93
Ccdc171E9Q1U1 Gm23787-201ENSMUST00000122538 73 ntBASIC-3,26□□□□□ -2,93
Ccdc171E9Q1U1 Gm24723-201ENSMUST00000158233 132 ntBASIC-3,26□□□□□ -2,93
Ccdc171E9Q1U1 Mir124a-1-201ENSMUST00000083663 85 ntBASIC-3,28□□□□□ -2,93
Ccdc171E9Q1U1 Gm25678-201ENSMUST00000174984 73 ntBASIC-3,29□□□□□ -2,94
Ccdc171E9Q1U1 Gm27882-201ENSMUST00000184904 74 ntBASIC-3,29□□□□□ -2,94
Ccdc171E9Q1U1 Gm23790-201ENSMUST00000083013 107 ntBASIC-3,29□□□□□ -2,94
Ccdc171E9Q1U1 Gm22057-201ENSMUST00000083387 107 ntBASIC-3,29□□□□□ -2,94
Ccdc171E9Q1U1 AC238676.2-201ENSMUST00000220910 94 ntBASIC-3,3□□□□□ -2,94
Ccdc171E9Q1U1 Gm11111-201ENSMUST00000112956 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-3,32□□□□□ -2,94
Ccdc171E9Q1U1 Gm22071-201ENSMUST00000116857 83 ntBASIC-3,32□□□□□ -2,94
Ccdc171E9Q1U1 Gm24916-201ENSMUST00000157287 79 ntBASIC-3,32□□□□□ -2,94
Ccdc171E9Q1U1 Gm23864-201ENSMUST00000177607 107 ntBASIC-3,32□□□□□ -2,94
Ccdc171E9Q1U1 Vmn2r-ps50-201ENSMUST00000209317 120 ntBASIC-3,32□□□□□ -2,94
Ccdc171E9Q1U1 Gm24259-201ENSMUST00000083740 107 ntBASIC-3,32□□□□□ -2,94
Ccdc171E9Q1U1 Gm25565-201ENSMUST00000104605 105 ntBASIC-3,34□□□□□ -2,94
Ccdc171E9Q1U1 Gm23856-201ENSMUST00000158380 99 ntBASIC-3,34□□□□□ -2,94
Ccdc171E9Q1U1 Gm26052-201ENSMUST00000104646 84 ntBASIC-3,37□□□□□ -2,95
Ccdc171E9Q1U1 Gm22490-201ENSMUST00000157188 119 ntBASIC-3,38□□□□□ -2,95
Ccdc171E9Q1U1 Gm23369-201ENSMUST00000175406 105 ntBASIC-3,38□□□□□ -2,95
Ccdc171E9Q1U1 Gm25648-201ENSMUST00000177844 79 ntBASIC-3,38□□□□□ -2,95
Ccdc171E9Q1U1 Gm23922-201ENSMUST00000178792 79 ntBASIC-3,38□□□□□ -2,95
Ccdc171E9Q1U1 Gm24657-201ENSMUST00000180085 79 ntBASIC-3,38□□□□□ -2,95
Ccdc171E9Q1U1 Gm22996-201ENSMUST00000180236 79 ntBASIC-3,38□□□□□ -2,95
Ccdc171E9Q1U1 CT571266.1-201ENSMUST00000222859 153 ntBASIC-3,39□□□□□ -2,95
Ccdc171E9Q1U1 Gm24297-201ENSMUST00000158300 68 ntBASIC-3,4□□□□□ -2,95
Ccdc171E9Q1U1 Gm26257-201ENSMUST00000122500 107 ntBASIC-3,41□□□□□ -2,95
Ccdc171E9Q1U1 Gm23349-201ENSMUST00000158432 98 ntBASIC-3,42□□□□□ -2,96
Ccdc171E9Q1U1 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC-3,42□□□□□ -2,96
Ccdc171E9Q1U1 Gm25681-201ENSMUST00000083938 106 ntBASIC-3,42□□□□□ -2,96
Ccdc171E9Q1U1 Mir1906-1-201ENSMUST00000122586 80 ntBASIC-3,43□□□□□ -2,96
Ccdc171E9Q1U1 Mir1906-2-201ENSMUST00000122610 80 ntBASIC-3,43□□□□□ -2,96
Ccdc171E9Q1U1 Gm26225-201ENSMUST00000082508 135 ntBASIC-3,43□□□□□ -2,96
Ccdc171E9Q1U1 Gm24797-201ENSMUST00000178103 107 ntBASIC-3,44□□□□□ -2,96
Ccdc171E9Q1U1 Gm24996-201ENSMUST00000158390 99 ntBASIC-3,45□□□□□ -2,96
Ccdc171E9Q1U1 Gm24331-201ENSMUST00000175099 67 ntBASIC-3,45□□□□□ -2,96
Ccdc171E9Q1U1 Gm23801-201ENSMUST00000175561 67 ntBASIC-3,45□□□□□ -2,96
Ccdc171E9Q1U1 Gm24485-201ENSMUST00000178283 67 ntBASIC-3,45□□□□□ -2,96
Ccdc171E9Q1U1 n-R5s218-201ENSMUST00000122583 109 ntBASIC-3,46□□□□□ -2,96
Ccdc171E9Q1U1 Mir1912-201ENSMUST00000175298 87 ntBASIC-3,48□□□□□ -2,97
Ccdc171E9Q1U1 Gm22621-201ENSMUST00000179678 74 ntBASIC-3,48□□□□□ -2,97
Ccdc171E9Q1U1 Gm25289-201ENSMUST00000122799 119 ntBASIC-3,5□□□□□ -2,97
Ccdc171E9Q1U1 Gm25812-201ENSMUST00000082751 103 ntBASIC-3,5□□□□□ -2,97
Ccdc171E9Q1U1 Snord70-201ENSMUST00000104157 87 ntBASIC-3,51□□□□□ -2,97
Ccdc171E9Q1U1 Gm28724-201ENSMUST00000186149 625 ntBASIC-3,51□□□□□ -2,97
Ccdc171E9Q1U1 Mir664-201ENSMUST00000196796 69 ntBASIC-3,52□□□□□ -2,97
Ccdc171E9Q1U1 Gm25753-201ENSMUST00000116792 121 ntBASIC-3,53□□□□□ -2,97
Ccdc171E9Q1U1 Gm20305-201ENSMUST00000193226 177 ntBASIC-3,56□□□□□ -2,98
Ccdc171E9Q1U1 AC164561.1-201ENSMUST00000220414 115 ntBASIC-3,56□□□□□ -2,98
Ccdc171E9Q1U1 Mir466-201ENSMUST00000093591 73 ntBASIC-3,56□□□□□ -2,98
Ccdc171E9Q1U1 Gm25867-201ENSMUST00000158254 103 ntBASIC-3,57□□□□□ -2,98
Ccdc171E9Q1U1 Gm22255-201ENSMUST00000177933 79 ntBASIC-3,57□□□□□ -2,98
Ccdc171E9Q1U1 Gm23254-201ENSMUST00000097244 79 ntBASIC-3,57□□□□□ -2,98
Ccdc171E9Q1U1 Gm22879-201ENSMUST00000082895 74 ntBASIC-3,6□□□□□ -2,99
Ccdc171E9Q1U1 Gm23376-201ENSMUST00000082938 160 ntBASIC-3,6□□□□□ -2,99
Ccdc171E9Q1U1 Mir466b-2-201ENSMUST00000103778 82 ntBASIC-3,61□□□□□ -2,99
Ccdc171E9Q1U1 Gm25183-201ENSMUST00000157752 106 ntBASIC-3,64□□□□□ -2,99
Ccdc171E9Q1U1 Gm23044-201ENSMUST00000157891 100 ntBASIC-3,64□□□□□ -2,99
Ccdc171E9Q1U1 Gm23649-201ENSMUST00000179007 107 ntBASIC-3,64□□□□□ -2,99
Ccdc171E9Q1U1 Gm24674-201ENSMUST00000179194 104 ntBASIC-3,64□□□□□ -2,99
Ccdc171E9Q1U1 Gm22056-201ENSMUST00000083386 81 ntBASIC-3,64□□□□□ -2,99
Ccdc171E9Q1U1 Gm24651-201ENSMUST00000157107 107 ntBASIC-3,65□□□□□ -2,99
Ccdc171E9Q1U1 Gm27987-201ENSMUST00000184023 93 ntBASIC-3,65□□□□□ -2,99
Ccdc171E9Q1U1 Gm44859-201ENSMUST00000207831 94 ntBASIC-3,65□□□□□ -2,99
Ccdc171E9Q1U1 Gm26008-201ENSMUST00000158797 99 ntBASIC-3,67□□□□□ -3
Ccdc171E9Q1U1 Gm25071-201ENSMUST00000175232 70 ntBASIC-3,67□□□□□ -3
Ccdc171E9Q1U1 Mir1955-201ENSMUST00000158014 98 ntBASIC-3,68□□□□□ -3
Ccdc171E9Q1U1 Gm22095-201ENSMUST00000158984 150 ntBASIC-3,68□□□□□ -3
Ccdc171E9Q1U1 Mir125b-1-201ENSMUST00000175613 77 ntBASIC-3,68□□□□□ -3
Ccdc171E9Q1U1 Gm24926-201ENSMUST00000178053 79 ntBASIC-3,68□□□□□ -3
Ccdc171E9Q1U1 Gm22632-201ENSMUST00000178266 79 ntBASIC-3,68□□□□□ -3
Ccdc171E9Q1U1 Gm22260-201ENSMUST00000178643 107 ntBASIC-3,7□□□□□ -3
Ccdc171E9Q1U1 Gm22354-201ENSMUST00000083919 70 ntBASIC-3,7□□□□□ -3
Ccdc171E9Q1U1 Gm24378-201ENSMUST00000122699 106 ntBASIC-3,7□□□□□ -3
Ccdc171E9Q1U1 Gm22925-201ENSMUST00000174956 102 ntBASIC-3,7□□□□□ -3
Ccdc171E9Q1U1 Gm24835-201ENSMUST00000116777 111 ntBASIC-3,71□□□□□ -3
Ccdc171E9Q1U1 Mir3083-201ENSMUST00000175377 64 ntBASIC-3,71□□□□□ -3
Ccdc171E9Q1U1 Mir669l-201ENSMUST00000103771 98 ntBASIC-3,72□□□□□ -3,01
Ccdc171E9Q1U1 Gm26092-201ENSMUST00000179798 97 ntBASIC-3,72□□□□□ -3,01
Ccdc171E9Q1U1 Mir669a-1-201ENSMUST00000180238 97 ntBASIC-3,72□□□□□ -3,01
Ccdc171E9Q1U1 Snord58b-201ENSMUST00000082937 66 ntBASIC-3,72□□□□□ -3,01
Ccdc171E9Q1U1 Gm25920-201ENSMUST00000158307 99 ntBASIC-3,74□□□□□ -3,01
Ccdc171E9Q1U1 Mir1898-201ENSMUST00000122643 83 ntBASIC-3,76□□□□□ -3,01
Ccdc171E9Q1U1 AC161426.1-201ENSMUST00000214137 286 ntBASIC-3,76□□□□□ -3,01
Ccdc171E9Q1U1 Gm24495-201ENSMUST00000178575 79 ntBASIC-3,77□□□□□ -3,01
Ccdc171E9Q1U1 Gm22253-201ENSMUST00000179870 79 ntBASIC-3,77□□□□□ -3,01
Ccdc171E9Q1U1 mt-Atp8-201ENSMUST00000082407 204 ntAPPRIS P1 BASIC-3,77□□□□□ -3,01
Ccdc171E9Q1U1 Gm27450-201ENSMUST00000104632 90 ntBASIC-3,79□□□□□ -3,02
Ccdc171E9Q1U1 Gm10813-201ENSMUST00000099936 90 ntBASIC-3,8□□□□□ -3,02
Ccdc171E9Q1U1 Gm44322-201ENSMUST00000196830 115 ntBASIC-3,81□□□□□ -3,02
Ccdc171E9Q1U1 Gm25222-201ENSMUST00000158199 126 ntBASIC-3,82□□□□□ -3,02
Ccdc171E9Q1U1 Gm24226-201ENSMUST00000158826 97 ntBASIC-3,82□□□□□ -3,02
Ccdc171E9Q1U1 Gm24387-201ENSMUST00000104625 90 ntBASIC-3,89□□□□□ -3,03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107 ms