Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm26262-201ENSMUST00000158024 127 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Col5a3Q9JLI2 Gm11333-201ENSMUST00000119479 148 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Col5a3Q9JLI2 Gm26499-201ENSMUST00000178544 79 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Col5a3Q9JLI2 Gm26096-201ENSMUST00000179084 79 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Col5a3Q9JLI2 Gm23308-201ENSMUST00000179475 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Col5a3Q9JLI2 Mir702-201ENSMUST00000102285 109 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Col5a3Q9JLI2 Mir543-201ENSMUST00000102286 76 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Col5a3Q9JLI2 Gm24400-201ENSMUST00000157865 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Col5a3Q9JLI2 Gm24705-201ENSMUST00000082808 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Col5a3Q9JLI2 Mir6339-201ENSMUST00000185120 117 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Col5a3Q9JLI2 Gm2077-201ENSMUST00000195017 319 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Col5a3Q9JLI2 Gm23613-201ENSMUST00000082596 87 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Col5a3Q9JLI2 Gm23240-201ENSMUST00000083009 121 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Col5a3Q9JLI2 Gm23607-201ENSMUST00000104550 126 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Col5a3Q9JLI2 Gm27798-201ENSMUST00000184989 71 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Col5a3Q9JLI2 Gm43943-201ENSMUST00000204201 113 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Col5a3Q9JLI2 Gm22458-201ENSMUST00000082576 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Col5a3Q9JLI2 Snord16a-201ENSMUST00000083895 99 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Col5a3Q9JLI2 Gm22566-201ENSMUST00000175541 85 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Col5a3Q9JLI2 Gm10563-201ENSMUST00000115821 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
Col5a3Q9JLI2 Gm26043-201ENSMUST00000116912 91 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Col5a3Q9JLI2 Gm25429-201ENSMUST00000157607 132 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Col5a3Q9JLI2 Gm22842-201ENSMUST00000157709 118 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Col5a3Q9JLI2 Gm23644-201ENSMUST00000157856 77 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Col5a3Q9JLI2 Gm24946-201ENSMUST00000158332 106 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Col5a3Q9JLI2 Mir7231-201ENSMUST00000196252 61 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Col5a3Q9JLI2 mt-Ts1-201ENSMUST00000082403 69 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Col5a3Q9JLI2 Gm26124-201ENSMUST00000083359 108 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Col5a3Q9JLI2 Gm24162-201ENSMUST00000093665 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Col5a3Q9JLI2 Gm24650-201ENSMUST00000157105 103 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Col5a3Q9JLI2 AC160962.3-201ENSMUST00000225914 112 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Col5a3Q9JLI2 Gm25854-201ENSMUST00000082792 72 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Col5a3Q9JLI2 Gm25987-201ENSMUST00000083234 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Col5a3Q9JLI2 Snord57-201ENSMUST00000083338 72 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Col5a3Q9JLI2 Mir876-201ENSMUST00000104659 81 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Col5a3Q9JLI2 Gm24492-201ENSMUST00000083798 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Col5a3Q9JLI2 Gm24003-201ENSMUST00000158455 100 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Col5a3Q9JLI2 Snord123-201ENSMUST00000158692 71 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Col5a3Q9JLI2 Gm25158-201ENSMUST00000177681 121 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Col5a3Q9JLI2 Gm26229-201ENSMUST00000179699 121 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Col5a3Q9JLI2 Gm23974-201ENSMUST00000083321 131 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Col5a3Q9JLI2 Gm25289-201ENSMUST00000122799 119 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Col5a3Q9JLI2 Gm23306-201ENSMUST00000179058 105 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Col5a3Q9JLI2 Mir7086-201ENSMUST00000183683 65 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Col5a3Q9JLI2 Mir29b-1-201ENSMUST00000083670 71 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Col5a3Q9JLI2 Gm24148-201ENSMUST00000082762 80 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Col5a3Q9JLI2 Gm23244-201ENSMUST00000083375 92 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Col5a3Q9JLI2 Mir1969-201ENSMUST00000157623 94 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Col5a3Q9JLI2 Gm21836-201ENSMUST00000178787 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
Col5a3Q9JLI2 Gm22828-201ENSMUST00000083768 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Col5a3Q9JLI2 Gm25740-201ENSMUST00000180247 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Col5a3Q9JLI2 AC122335.1-201ENSMUST00000217587 175 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Col5a3Q9JLI2 CT030170.1-201ENSMUST00000222183 148 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Col5a3Q9JLI2 Gm23909-201ENSMUST00000104598 131 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Col5a3Q9JLI2 Gm21961-201ENSMUST00000110100 114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
Col5a3Q9JLI2 Gm25542-201ENSMUST00000116889 94 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Col5a3Q9JLI2 Gm23590-201ENSMUST00000157661 104 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Col5a3Q9JLI2 Gm24554-201ENSMUST00000158654 73 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Col5a3Q9JLI2 Mirlet7a-2-201ENSMUST00000175029 96 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Col5a3Q9JLI2 Gm23570-201ENSMUST00000083029 104 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Col5a3Q9JLI2 Gm22729-201ENSMUST00000158088 129 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Col5a3Q9JLI2 Gm24051-201ENSMUST00000158622 75 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Col5a3Q9JLI2 Gm25380-201ENSMUST00000175463 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Col5a3Q9JLI2 Gm24641-201ENSMUST00000178055 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Col5a3Q9JLI2 Gm25484-201ENSMUST00000178217 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Col5a3Q9JLI2 Gm26138-201ENSMUST00000179236 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Col5a3Q9JLI2 Gm22821-201ENSMUST00000179288 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Col5a3Q9JLI2 Gm23298-201ENSMUST00000083181 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Col5a3Q9JLI2 Gm22057-201ENSMUST00000083387 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Col5a3Q9JLI2 Mir15b-201ENSMUST00000083646 64 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Col5a3Q9JLI2 Gm25516-201ENSMUST00000083857 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Col5a3Q9JLI2 Gm26104-201ENSMUST00000157250 108 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
Col5a3Q9JLI2 Gm26491-201ENSMUST00000179268 121 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
Col5a3Q9JLI2 Gm25815-201ENSMUST00000082755 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Col5a3Q9JLI2 Gm25644-201ENSMUST00000083209 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Col5a3Q9JLI2 Gm24988-201ENSMUST00000104460 121 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Col5a3Q9JLI2 Gm24605-201ENSMUST00000104772 96 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Col5a3Q9JLI2 Trgj1-201ENSMUST00000200495 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
Col5a3Q9JLI2 Gm24612-201ENSMUST00000083267 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Col5a3Q9JLI2 Gm25112-201ENSMUST00000122680 104 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Col5a3Q9JLI2 Gm25493-201ENSMUST00000157375 103 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Col5a3Q9JLI2 Mir7015-201ENSMUST00000199525 64 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Col5a3Q9JLI2 Gm26375-201ENSMUST00000101829 106 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Col5a3Q9JLI2 Gm22213-201ENSMUST00000157564 119 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Col5a3Q9JLI2 Gm22430-201ENSMUST00000158546 107 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Col5a3Q9JLI2 Gm17522-202ENSMUST00000186631 174 ntTSL 1 (best) BASIC-0.94□□□□□ -2.56
Col5a3Q9JLI2 Gm17412-202ENSMUST00000189566 174 ntTSL 1 (best) BASIC-0.94□□□□□ -2.56
Col5a3Q9JLI2 Gm22197-201ENSMUST00000116866 58 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Col5a3Q9JLI2 Mir181b-1-201ENSMUST00000083524 80 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Col5a3Q9JLI2 Traj34-201ENSMUST00000103707 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
Col5a3Q9JLI2 Gm24234-201ENSMUST00000104316 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Col5a3Q9JLI2 AC122210.2-201ENSMUST00000220216 115 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Col5a3Q9JLI2 Gm22354-201ENSMUST00000083919 70 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Col5a3Q9JLI2 Mir450b-201ENSMUST00000102095 82 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Col5a3Q9JLI2 Gm25061-201ENSMUST00000104665 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Col5a3Q9JLI2 Mir3064-201ENSMUST00000175532 67 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Col5a3Q9JLI2 Gm27987-201ENSMUST00000184023 93 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Col5a3Q9JLI2 Gm25087-201ENSMUST00000101992 78 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
Col5a3Q9JLI2 Gm24775-201ENSMUST00000157377 99 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
Col5a3Q9JLI2 Gm22381-201ENSMUST00000158186 107 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
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