Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-6.61□□□□□ -3.47
Ccdc18Q640L5 Gm24842-201ENSMUST00000158681 54 ntBASIC-6.62□□□□□ -3.47
Ccdc18Q640L5 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC-6.63□□□□□ -3.47
Ccdc18Q640L5 Gm25834-201ENSMUST00000158916 101 ntBASIC-6.66□□□□□ -3.47
Ccdc18Q640L5 Gm25623-201ENSMUST00000157216 108 ntBASIC-6.66□□□□□ -3.48
Ccdc18Q640L5 Gm25798-201ENSMUST00000082641 107 ntBASIC-6.68□□□□□ -3.48
Ccdc18Q640L5 n-R5s214-201ENSMUST00000122494 121 ntBASIC-6.69□□□□□ -3.48
Ccdc18Q640L5 Gm22677-201ENSMUST00000116977 108 ntBASIC-6.71□□□□□ -3.48
Ccdc18Q640L5 Gm22925-201ENSMUST00000174956 102 ntBASIC-6.71□□□□□ -3.48
Ccdc18Q640L5 Gm22032-201ENSMUST00000116946 116 ntBASIC-6.72□□□□□ -3.48
Ccdc18Q640L5 Gm24737-201ENSMUST00000158861 100 ntBASIC-6.72□□□□□ -3.48
Ccdc18Q640L5 AC238676.2-201ENSMUST00000220910 94 ntBASIC-6.72□□□□□ -3.48
Ccdc18Q640L5 Gm24099-201ENSMUST00000083384 107 ntBASIC-6.73□□□□□ -3.49
Ccdc18Q640L5 Gm22973-201ENSMUST00000083298 191 ntBASIC-6.73□□□□□ -3.49
Ccdc18Q640L5 Gm23787-201ENSMUST00000122538 73 ntBASIC-6.76□□□□□ -3.49
Ccdc18Q640L5 Gm27975-201ENSMUST00000184400 101 ntBASIC-6.76□□□□□ -3.49
Ccdc18Q640L5 Gm24259-201ENSMUST00000083740 107 ntBASIC-6.76□□□□□ -3.49
Ccdc18Q640L5 Gm25425-201ENSMUST00000157611 96 ntBASIC-6.79□□□□□ -3.5
Ccdc18Q640L5 Gm24723-201ENSMUST00000158233 132 ntBASIC-6.8□□□□□ -3.5
Ccdc18Q640L5 Gm23581-201ENSMUST00000158531 63 ntBASIC-6.8□□□□□ -3.5
Ccdc18Q640L5 Gm23141-201ENSMUST00000178682 94 ntBASIC-6.8□□□□□ -3.5
Ccdc18Q640L5 mt-Ti-201ENSMUST00000082393 69 ntBASIC-6.8□□□□□ -3.5
Ccdc18Q640L5 Gm6020-201ENSMUST00000092094 66 ntAPPRIS P1 BASIC-6.8□□□□□ -3.5
Ccdc18Q640L5 Mir297-1-201ENSMUST00000103800 76 ntBASIC-6.82□□□□□ -3.5
Ccdc18Q640L5 Gm22605-201ENSMUST00000158289 108 ntBASIC-6.82□□□□□ -3.5
Ccdc18Q640L5 Gm22558-201ENSMUST00000157326 95 ntBASIC-6.83□□□□□ -3.5
Ccdc18Q640L5 Gm25390-201ENSMUST00000157341 103 ntBASIC-6.83□□□□□ -3.5
Ccdc18Q640L5 Gm22879-201ENSMUST00000082895 74 ntBASIC-6.87□□□□□ -3.51
Ccdc18Q640L5 Gm28489-201ENSMUST00000186655 316 ntBASIC-6.88□□□□□ -3.51
Ccdc18Q640L5 CT571266.1-201ENSMUST00000222859 153 ntBASIC-6.89□□□□□ -3.51
Ccdc18Q640L5 Gm25362-201ENSMUST00000158854 105 ntBASIC-6.9□□□□□ -3.51
Ccdc18Q640L5 Gm22070-201ENSMUST00000178475 107 ntBASIC-6.9□□□□□ -3.51
Ccdc18Q640L5 Gm24637-201ENSMUST00000158674 85 ntBASIC-6.91□□□□□ -3.52
Ccdc18Q640L5 Gm11333-201ENSMUST00000119479 148 ntBASIC-6.92□□□□□ -3.52
Ccdc18Q640L5 Gm22989-201ENSMUST00000158313 86 ntBASIC-6.92□□□□□ -3.52
Ccdc18Q640L5 Gm24996-201ENSMUST00000158390 99 ntBASIC-6.96□□□□□ -3.52
Ccdc18Q640L5 Gm27465-201ENSMUST00000184290 91 ntBASIC-6.96□□□□□ -3.52
Ccdc18Q640L5 Gm26306-201ENSMUST00000157773 119 ntBASIC-7□□□□□ -3.53
Ccdc18Q640L5 Svbp-204ENSMUST00000210595 150 ntTSL 5 BASIC-7□□□□□ -3.53
Ccdc18Q640L5 Mir125b-1-201ENSMUST00000175613 77 ntBASIC-7.01□□□□□ -3.53
Ccdc18Q640L5 Gm25648-201ENSMUST00000177844 79 ntBASIC-7.01□□□□□ -3.53
Ccdc18Q640L5 Gm24797-201ENSMUST00000178103 107 ntBASIC-7.02□□□□□ -3.53
Ccdc18Q640L5 Gm26204-201ENSMUST00000082906 107 ntBASIC-7.02□□□□□ -3.53
Ccdc18Q640L5 Gm22056-201ENSMUST00000083386 81 ntBASIC-7.02□□□□□ -3.53
Ccdc18Q640L5 Traj34-201ENSMUST00000103707 58 ntAPPRIS P1 BASIC-7.03□□□□□ -3.53
Ccdc18Q640L5 Gm14838-201ENSMUST00000118913 248 ntBASIC-7.03□□□□□ -3.53
Ccdc18Q640L5 Mir181a-1-201ENSMUST00000083631 87 ntBASIC-7.03□□□□□ -3.53
Ccdc18Q640L5 Gm45492-201ENSMUST00000211611 288 ntBASIC-7.08□□□□□ -3.54
Ccdc18Q640L5 Snord58b-201ENSMUST00000082937 66 ntBASIC-7.11□□□□□ -3.55
Ccdc18Q640L5 Gm22681-201ENSMUST00000083853 106 ntBASIC-7.11□□□□□ -3.55
Ccdc18Q640L5 Olfr1108-ps1-201ENSMUST00000216930 121 ntBASIC-7.11□□□□□ -3.55
Ccdc18Q640L5 Igkv13-78-1-201ENSMUST00000199298 200 ntBASIC-7.12□□□□□ -3.55
Ccdc18Q640L5 Gm26257-201ENSMUST00000122500 107 ntBASIC-7.13□□□□□ -3.55
Ccdc18Q640L5 Mir3064-201ENSMUST00000175532 67 ntBASIC-7.13□□□□□ -3.55
Ccdc18Q640L5 Gm24131-201ENSMUST00000158539 107 ntBASIC-7.14□□□□□ -3.55
Ccdc18Q640L5 Gm26052-201ENSMUST00000104646 84 ntBASIC-7.15□□□□□ -3.55
Ccdc18Q640L5 Gm28211-201ENSMUST00000190920 315 ntBASIC-7.15□□□□□ -3.55
Ccdc18Q640L5 Gm22101-201ENSMUST00000157928 103 ntBASIC-7.16□□□□□ -3.56
Ccdc18Q640L5 Gm38298-201ENSMUST00000193578 118 ntBASIC-7.19□□□□□ -3.56
Ccdc18Q640L5 Gm26441-201ENSMUST00000082590 104 ntBASIC-7.19□□□□□ -3.56
Ccdc18Q640L5 Gm23345-201ENSMUST00000083817 150 ntBASIC-7.22□□□□□ -3.56
Ccdc18Q640L5 Gm13339-201ENSMUST00000120651 510 ntBASIC-7.23□□□□□ -3.57
Ccdc18Q640L5 Gm22770-201ENSMUST00000158368 67 ntBASIC-7.23□□□□□ -3.57
Ccdc18Q640L5 Gm24651-201ENSMUST00000157107 107 ntBASIC-7.24□□□□□ -3.57
Ccdc18Q640L5 Mir466b-1-201ENSMUST00000177988 82 ntBASIC-7.24□□□□□ -3.57
Ccdc18Q640L5 Gm22260-201ENSMUST00000178643 107 ntBASIC-7.24□□□□□ -3.57
Ccdc18Q640L5 Gm24387-201ENSMUST00000104625 90 ntBASIC-7.27□□□□□ -3.57
Ccdc18Q640L5 Gm25542-201ENSMUST00000116889 94 ntBASIC-7.27□□□□□ -3.57
Ccdc18Q640L5 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC-7.27□□□□□ -3.57
Ccdc18Q640L5 Mir1955-201ENSMUST00000158014 98 ntBASIC-7.27□□□□□ -3.57
Ccdc18Q640L5 Gm11111-201ENSMUST00000112956 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-7.29□□□□□ -3.58
Ccdc18Q640L5 Gm23856-201ENSMUST00000158380 99 ntBASIC-7.29□□□□□ -3.58
Ccdc18Q640L5 Gm44373-201ENSMUST00000196112 169 ntBASIC-7.31□□□□□ -3.58
Ccdc18Q640L5 AL935138.1-201ENSMUST00000215309 196 ntBASIC-7.31□□□□□ -3.58
Ccdc18Q640L5 Gm22555-201ENSMUST00000157801 62 ntBASIC-7.34□□□□□ -3.58
Ccdc18Q640L5 Gm22775-201ENSMUST00000177630 120 ntBASIC-7.35□□□□□ -3.59
Ccdc18Q640L5 Gm23569-201ENSMUST00000180120 120 ntBASIC-7.35□□□□□ -3.59
Ccdc18Q640L5 Gm25039-201ENSMUST00000082933 107 ntBASIC-7.36□□□□□ -3.59
Ccdc18Q640L5 Gm23468-201ENSMUST00000157125 108 ntBASIC-7.36□□□□□ -3.59
Ccdc18Q640L5 Gm11042-201ENSMUST00000110441 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-7.37□□□□□ -3.59
Ccdc18Q640L5 Gm24225-201ENSMUST00000158825 98 ntBASIC-7.38□□□□□ -3.59
Ccdc18Q640L5 Gm25521-201ENSMUST00000158393 108 ntBASIC-7.39□□□□□ -3.59
Ccdc18Q640L5 Mir471-201ENSMUST00000093596 67 ntBASIC-7.4□□□□□ -3.59
Ccdc18Q640L5 Gm25678-201ENSMUST00000174984 73 ntBASIC-7.43□□□□□ -3.6
Ccdc18Q640L5 Gm25740-201ENSMUST00000180247 107 ntBASIC-7.43□□□□□ -3.6
Ccdc18Q640L5 Gm25254-201ENSMUST00000157239 104 ntBASIC-7.46□□□□□ -3.6
Ccdc18Q640L5 mt-Tt-201ENSMUST00000082422 67 ntBASIC-7.46□□□□□ -3.6
Ccdc18Q640L5 Gm23651-201ENSMUST00000116755 120 ntBASIC-7.47□□□□□ -3.61
Ccdc18Q640L5 Gm27317-201ENSMUST00000183533 95 ntBASIC-7.48□□□□□ -3.61
Ccdc18Q640L5 Gm25599-201ENSMUST00000157816 103 ntBASIC-7.49□□□□□ -3.61
Ccdc18Q640L5 Gm28438-201ENSMUST00000188299 345 ntBASIC-7.51□□□□□ -3.61
Ccdc18Q640L5 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC-7.51□□□□□ -3.61
Ccdc18Q640L5 Gm23369-201ENSMUST00000175406 105 ntBASIC-7.55□□□□□ -3.62
Ccdc18Q640L5 Gm24331-201ENSMUST00000175099 67 ntBASIC-7.55□□□□□ -3.62
Ccdc18Q640L5 Gm23801-201ENSMUST00000175561 67 ntBASIC-7.55□□□□□ -3.62
Ccdc18Q640L5 Gm24485-201ENSMUST00000178283 67 ntBASIC-7.55□□□□□ -3.62
Ccdc18Q640L5 Gm25482-201ENSMUST00000083225 107 ntBASIC-7.62□□□□□ -3.63
Ccdc18Q640L5 Mir466e-201ENSMUST00000198862 84 ntBASIC-7.63□□□□□ -3.63
Ccdc18Q640L5 Mir466c-1-201ENSMUST00000200654 84 ntBASIC-7.63□□□□□ -3.63
Ccdc18Q640L5 Mir7681-201ENSMUST00000184834 72 ntBASIC-7.67□□□□□ -3.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.3 ms