Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-6.61□□□□□ -3.47
Ccdc18Q640L5 Gm24842-201ENSMUST00000158681 54 ntBASIC-6.62□□□□□ -3.47
Ccdc18Q640L5 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC-6.63□□□□□ -3.47
Ccdc18Q640L5 Gm25834-201ENSMUST00000158916 101 ntBASIC-6.66□□□□□ -3.47
Ccdc18Q640L5 Gm25623-201ENSMUST00000157216 108 ntBASIC-6.66□□□□□ -3.48
Ccdc18Q640L5 Gm25798-201ENSMUST00000082641 107 ntBASIC-6.68□□□□□ -3.48
Ccdc18Q640L5 n-R5s214-201ENSMUST00000122494 121 ntBASIC-6.69□□□□□ -3.48
Ccdc18Q640L5 Gm22677-201ENSMUST00000116977 108 ntBASIC-6.71□□□□□ -3.48
Ccdc18Q640L5 Gm22925-201ENSMUST00000174956 102 ntBASIC-6.71□□□□□ -3.48
Ccdc18Q640L5 Gm22032-201ENSMUST00000116946 116 ntBASIC-6.72□□□□□ -3.48
Ccdc18Q640L5 Gm24737-201ENSMUST00000158861 100 ntBASIC-6.72□□□□□ -3.48
Ccdc18Q640L5 AC238676.2-201ENSMUST00000220910 94 ntBASIC-6.72□□□□□ -3.48
Ccdc18Q640L5 Gm24099-201ENSMUST00000083384 107 ntBASIC-6.73□□□□□ -3.49
Ccdc18Q640L5 Gm22973-201ENSMUST00000083298 191 ntBASIC-6.73□□□□□ -3.49
Ccdc18Q640L5 Gm23787-201ENSMUST00000122538 73 ntBASIC-6.76□□□□□ -3.49
Ccdc18Q640L5 Gm27975-201ENSMUST00000184400 101 ntBASIC-6.76□□□□□ -3.49
Ccdc18Q640L5 Gm24259-201ENSMUST00000083740 107 ntBASIC-6.76□□□□□ -3.49
Ccdc18Q640L5 Gm25425-201ENSMUST00000157611 96 ntBASIC-6.79□□□□□ -3.5
Ccdc18Q640L5 Gm24723-201ENSMUST00000158233 132 ntBASIC-6.8□□□□□ -3.5
Ccdc18Q640L5 Gm23581-201ENSMUST00000158531 63 ntBASIC-6.8□□□□□ -3.5
Ccdc18Q640L5 Gm23141-201ENSMUST00000178682 94 ntBASIC-6.8□□□□□ -3.5
Ccdc18Q640L5 mt-Ti-201ENSMUST00000082393 69 ntBASIC-6.8□□□□□ -3.5
Ccdc18Q640L5 Gm6020-201ENSMUST00000092094 66 ntAPPRIS P1 BASIC-6.8□□□□□ -3.5
Ccdc18Q640L5 Mir297-1-201ENSMUST00000103800 76 ntBASIC-6.82□□□□□ -3.5
Ccdc18Q640L5 Gm22605-201ENSMUST00000158289 108 ntBASIC-6.82□□□□□ -3.5
Ccdc18Q640L5 Gm22558-201ENSMUST00000157326 95 ntBASIC-6.83□□□□□ -3.5
Ccdc18Q640L5 Gm25390-201ENSMUST00000157341 103 ntBASIC-6.83□□□□□ -3.5
Ccdc18Q640L5 Gm22879-201ENSMUST00000082895 74 ntBASIC-6.87□□□□□ -3.51
Ccdc18Q640L5 Gm28489-201ENSMUST00000186655 316 ntBASIC-6.88□□□□□ -3.51
Ccdc18Q640L5 CT571266.1-201ENSMUST00000222859 153 ntBASIC-6.89□□□□□ -3.51
Ccdc18Q640L5 Gm25362-201ENSMUST00000158854 105 ntBASIC-6.9□□□□□ -3.51
Ccdc18Q640L5 Gm22070-201ENSMUST00000178475 107 ntBASIC-6.9□□□□□ -3.51
Ccdc18Q640L5 Gm24637-201ENSMUST00000158674 85 ntBASIC-6.91□□□□□ -3.52
Ccdc18Q640L5 Gm11333-201ENSMUST00000119479 148 ntBASIC-6.92□□□□□ -3.52
Ccdc18Q640L5 Gm22989-201ENSMUST00000158313 86 ntBASIC-6.92□□□□□ -3.52
Ccdc18Q640L5 Gm24996-201ENSMUST00000158390 99 ntBASIC-6.96□□□□□ -3.52
Ccdc18Q640L5 Gm27465-201ENSMUST00000184290 91 ntBASIC-6.96□□□□□ -3.52
Ccdc18Q640L5 Gm26306-201ENSMUST00000157773 119 ntBASIC-7□□□□□ -3.53
Ccdc18Q640L5 Svbp-204ENSMUST00000210595 150 ntTSL 5 BASIC-7□□□□□ -3.53
Ccdc18Q640L5 Mir125b-1-201ENSMUST00000175613 77 ntBASIC-7.01□□□□□ -3.53
Ccdc18Q640L5 Gm25648-201ENSMUST00000177844 79 ntBASIC-7.01□□□□□ -3.53
Ccdc18Q640L5 Gm24797-201ENSMUST00000178103 107 ntBASIC-7.02□□□□□ -3.53
Ccdc18Q640L5 Gm26204-201ENSMUST00000082906 107 ntBASIC-7.02□□□□□ -3.53
Ccdc18Q640L5 Gm22056-201ENSMUST00000083386 81 ntBASIC-7.02□□□□□ -3.53
Ccdc18Q640L5 Traj34-201ENSMUST00000103707 58 ntAPPRIS P1 BASIC-7.03□□□□□ -3.53
Ccdc18Q640L5 Gm14838-201ENSMUST00000118913 248 ntBASIC-7.03□□□□□ -3.53
Ccdc18Q640L5 Mir181a-1-201ENSMUST00000083631 87 ntBASIC-7.03□□□□□ -3.53
Ccdc18Q640L5 Gm45492-201ENSMUST00000211611 288 ntBASIC-7.08□□□□□ -3.54
Ccdc18Q640L5 Snord58b-201ENSMUST00000082937 66 ntBASIC-7.11□□□□□ -3.55
Ccdc18Q640L5 Gm22681-201ENSMUST00000083853 106 ntBASIC-7.11□□□□□ -3.55
Ccdc18Q640L5 Olfr1108-ps1-201ENSMUST00000216930 121 ntBASIC-7.11□□□□□ -3.55
Ccdc18Q640L5 Igkv13-78-1-201ENSMUST00000199298 200 ntBASIC-7.12□□□□□ -3.55
Ccdc18Q640L5 Gm26257-201ENSMUST00000122500 107 ntBASIC-7.13□□□□□ -3.55
Ccdc18Q640L5 Mir3064-201ENSMUST00000175532 67 ntBASIC-7.13□□□□□ -3.55
Ccdc18Q640L5 Gm24131-201ENSMUST00000158539 107 ntBASIC-7.14□□□□□ -3.55
Ccdc18Q640L5 Gm26052-201ENSMUST00000104646 84 ntBASIC-7.15□□□□□ -3.55
Ccdc18Q640L5 Gm28211-201ENSMUST00000190920 315 ntBASIC-7.15□□□□□ -3.55
Ccdc18Q640L5 Gm22101-201ENSMUST00000157928 103 ntBASIC-7.16□□□□□ -3.56
Ccdc18Q640L5 Gm38298-201ENSMUST00000193578 118 ntBASIC-7.19□□□□□ -3.56
Ccdc18Q640L5 Gm26441-201ENSMUST00000082590 104 ntBASIC-7.19□□□□□ -3.56
Ccdc18Q640L5 Gm23345-201ENSMUST00000083817 150 ntBASIC-7.22□□□□□ -3.56
Ccdc18Q640L5 Gm13339-201ENSMUST00000120651 510 ntBASIC-7.23□□□□□ -3.57
Ccdc18Q640L5 Gm22770-201ENSMUST00000158368 67 ntBASIC-7.23□□□□□ -3.57
Ccdc18Q640L5 Gm24651-201ENSMUST00000157107 107 ntBASIC-7.24□□□□□ -3.57
Ccdc18Q640L5 Mir466b-1-201ENSMUST00000177988 82 ntBASIC-7.24□□□□□ -3.57
Ccdc18Q640L5 Gm22260-201ENSMUST00000178643 107 ntBASIC-7.24□□□□□ -3.57
Ccdc18Q640L5 Gm24387-201ENSMUST00000104625 90 ntBASIC-7.27□□□□□ -3.57
Ccdc18Q640L5 Gm25542-201ENSMUST00000116889 94 ntBASIC-7.27□□□□□ -3.57
Ccdc18Q640L5 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC-7.27□□□□□ -3.57
Ccdc18Q640L5 Mir1955-201ENSMUST00000158014 98 ntBASIC-7.27□□□□□ -3.57
Ccdc18Q640L5 Gm11111-201ENSMUST00000112956 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-7.29□□□□□ -3.58
Ccdc18Q640L5 Gm23856-201ENSMUST00000158380 99 ntBASIC-7.29□□□□□ -3.58
Ccdc18Q640L5 Gm44373-201ENSMUST00000196112 169 ntBASIC-7.31□□□□□ -3.58
Ccdc18Q640L5 AL935138.1-201ENSMUST00000215309 196 ntBASIC-7.31□□□□□ -3.58
Ccdc18Q640L5 Gm22555-201ENSMUST00000157801 62 ntBASIC-7.34□□□□□ -3.58
Ccdc18Q640L5 Gm22775-201ENSMUST00000177630 120 ntBASIC-7.35□□□□□ -3.59
Ccdc18Q640L5 Gm23569-201ENSMUST00000180120 120 ntBASIC-7.35□□□□□ -3.59
Ccdc18Q640L5 Gm25039-201ENSMUST00000082933 107 ntBASIC-7.36□□□□□ -3.59
Ccdc18Q640L5 Gm23468-201ENSMUST00000157125 108 ntBASIC-7.36□□□□□ -3.59
Ccdc18Q640L5 Gm11042-201ENSMUST00000110441 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-7.37□□□□□ -3.59
Ccdc18Q640L5 Gm24225-201ENSMUST00000158825 98 ntBASIC-7.38□□□□□ -3.59
Ccdc18Q640L5 Gm25521-201ENSMUST00000158393 108 ntBASIC-7.39□□□□□ -3.59
Ccdc18Q640L5 Mir471-201ENSMUST00000093596 67 ntBASIC-7.4□□□□□ -3.59
Ccdc18Q640L5 Gm25678-201ENSMUST00000174984 73 ntBASIC-7.43□□□□□ -3.6
Ccdc18Q640L5 Gm25740-201ENSMUST00000180247 107 ntBASIC-7.43□□□□□ -3.6
Ccdc18Q640L5 Gm25254-201ENSMUST00000157239 104 ntBASIC-7.46□□□□□ -3.6
Ccdc18Q640L5 mt-Tt-201ENSMUST00000082422 67 ntBASIC-7.46□□□□□ -3.6
Ccdc18Q640L5 Gm23651-201ENSMUST00000116755 120 ntBASIC-7.47□□□□□ -3.61
Ccdc18Q640L5 Gm27317-201ENSMUST00000183533 95 ntBASIC-7.48□□□□□ -3.61
Ccdc18Q640L5 Gm25599-201ENSMUST00000157816 103 ntBASIC-7.49□□□□□ -3.61
Ccdc18Q640L5 Gm28438-201ENSMUST00000188299 345 ntBASIC-7.51□□□□□ -3.61
Ccdc18Q640L5 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC-7.51□□□□□ -3.61
Ccdc18Q640L5 Gm23369-201ENSMUST00000175406 105 ntBASIC-7.55□□□□□ -3.62
Ccdc18Q640L5 Gm24331-201ENSMUST00000175099 67 ntBASIC-7.55□□□□□ -3.62
Ccdc18Q640L5 Gm23801-201ENSMUST00000175561 67 ntBASIC-7.55□□□□□ -3.62
Ccdc18Q640L5 Gm24485-201ENSMUST00000178283 67 ntBASIC-7.55□□□□□ -3.62
Ccdc18Q640L5 Gm25482-201ENSMUST00000083225 107 ntBASIC-7.62□□□□□ -3.63
Ccdc18Q640L5 Mir466e-201ENSMUST00000198862 84 ntBASIC-7.63□□□□□ -3.63
Ccdc18Q640L5 Mir466c-1-201ENSMUST00000200654 84 ntBASIC-7.63□□□□□ -3.63
Ccdc18Q640L5 Mir7681-201ENSMUST00000184834 72 ntBASIC-7.67□□□□□ -3.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 313.6 ms