Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Gm24705-201ENSMUST00000082808 107 ntBASIC-1,02□□□□□ -2,57
Samsn1P57725 Gm25542-201ENSMUST00000116889 94 ntBASIC-1,03□□□□□ -2,57
Samsn1P57725 Gm24554-201ENSMUST00000158654 73 ntBASIC-1,03□□□□□ -2,57
Samsn1P57725 9230110F11Rik-202ENSMUST00000212907 191 ntTSL 5 BASIC-1,03□□□□□ -2,57
Samsn1P57725 AC160962.3-201ENSMUST00000225914 112 ntBASIC-1,03□□□□□ -2,57
Samsn1P57725 Gm21961-201ENSMUST00000110100 114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1,04□□□□□ -2,58
Samsn1P57725 Gm11084-201ENSMUST00000112062 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1,04□□□□□ -2,58
Samsn1P57725 Gm25289-201ENSMUST00000122799 119 ntBASIC-1,04□□□□□ -2,58
Samsn1P57725 Gm24197-201ENSMUST00000175085 109 ntBASIC-1,04□□□□□ -2,58
Samsn1P57725 Trgj1-201ENSMUST00000200495 60 ntAPPRIS P1 BASIC-1,04□□□□□ -2,58
Samsn1P57725 Gm24091-201ENSMUST00000082550 83 ntBASIC-1,04□□□□□ -2,58
Samsn1P57725 Gm24459-201ENSMUST00000082730 86 ntBASIC-1,04□□□□□ -2,58
Samsn1P57725 Gm25652-201ENSMUST00000083780 103 ntBASIC-1,04□□□□□ -2,58
Samsn1P57725 Gm23711-201ENSMUST00000083856 83 ntBASIC-1,04□□□□□ -2,58
Samsn1P57725 Gm24650-201ENSMUST00000157105 103 ntBASIC-1,05□□□□□ -2,58
Samsn1P57725 Gm21836-201ENSMUST00000178787 63 ntAPPRIS P1 BASIC-1,05□□□□□ -2,58
Samsn1P57725 Mir7015-201ENSMUST00000199525 64 ntBASIC-1,05□□□□□ -2,58
Samsn1P57725 Gm43943-201ENSMUST00000204201 113 ntBASIC-1,05□□□□□ -2,58
Samsn1P57725 Gm24003-201ENSMUST00000158455 100 ntBASIC-1,06□□□□□ -2,58
Samsn1P57725 Mir3083-201ENSMUST00000175377 64 ntBASIC-1,06□□□□□ -2,58
Samsn1P57725 Mir7231-201ENSMUST00000196252 61 ntBASIC-1,06□□□□□ -2,58
Samsn1P57725 Gm25798-201ENSMUST00000082641 107 ntBASIC-1,06□□□□□ -2,58
Samsn1P57725 Snord57-201ENSMUST00000083338 72 ntBASIC-1,06□□□□□ -2,58
Samsn1P57725 Mir29b-1-201ENSMUST00000083670 71 ntBASIC-1,06□□□□□ -2,58
Samsn1P57725 Gm11333-201ENSMUST00000119479 148 ntBASIC-1,07□□□□□ -2,58
Samsn1P57725 Gm22213-201ENSMUST00000157564 119 ntBASIC-1,07□□□□□ -2,58
Samsn1P57725 Gm23369-201ENSMUST00000175406 105 ntBASIC-1,07□□□□□ -2,58
Samsn1P57725 CT030170.1-201ENSMUST00000222183 148 ntBASIC-1,07□□□□□ -2,58
Samsn1P57725 Gm24605-201ENSMUST00000104772 96 ntBASIC-1,08□□□□□ -2,58
Samsn1P57725 Gm25862-201ENSMUST00000158250 129 ntBASIC-1,08□□□□□ -2,58
Samsn1P57725 Snord123-201ENSMUST00000158692 71 ntBASIC-1,08□□□□□ -2,58
Samsn1P57725 Gm22354-201ENSMUST00000083919 70 ntBASIC-1,08□□□□□ -2,58
Samsn1P57725 Mir543-201ENSMUST00000102286 76 ntBASIC-1,09□□□□□ -2,58
Samsn1P57725 Gm24234-201ENSMUST00000104316 107 ntBASIC-1,09□□□□□ -2,58
Samsn1P57725 Gm22197-201ENSMUST00000116866 58 ntBASIC-1,09□□□□□ -2,58
Samsn1P57725 Gm25740-201ENSMUST00000180247 107 ntBASIC-1,09□□□□□ -2,58
Samsn1P57725 Mir7086-201ENSMUST00000183683 65 ntBASIC-1,09□□□□□ -2,58
Samsn1P57725 Gm25854-201ENSMUST00000082792 72 ntBASIC-1,09□□□□□ -2,58
Samsn1P57725 Gm25429-201ENSMUST00000157607 132 ntBASIC-1,1□□□□□ -2,59
Samsn1P57725 Gm24051-201ENSMUST00000158622 75 ntBASIC-1,1□□□□□ -2,59
Samsn1P57725 AC122335.1-201ENSMUST00000217587 175 ntBASIC-1,1□□□□□ -2,59
Samsn1P57725 Gm25644-201ENSMUST00000083209 107 ntBASIC-1,1□□□□□ -2,59
Samsn1P57725 Gm23974-201ENSMUST00000083321 131 ntBASIC-1,1□□□□□ -2,59
Samsn1P57725 Gm22828-201ENSMUST00000083768 107 ntBASIC-1,1□□□□□ -2,59
Samsn1P57725 Gm24988-201ENSMUST00000104460 121 ntBASIC-1,11□□□□□ -2,59
Samsn1P57725 Gm25061-201ENSMUST00000104665 107 ntBASIC-1,11□□□□□ -2,59
Samsn1P57725 Gm23244-201ENSMUST00000083375 92 ntBASIC-1,11□□□□□ -2,59
Samsn1P57725 AC161271.1-201ENSMUST00000226914 150 ntBASIC-1,12□□□□□ -2,59
Samsn1P57725 Gm24203-201ENSMUST00000082949 114 ntBASIC-1,12□□□□□ -2,59
Samsn1P57725 Mir15b-201ENSMUST00000083646 64 ntBASIC-1,12□□□□□ -2,59
Samsn1P57725 Gm25601-201ENSMUST00000158356 105 ntBASIC-1,13□□□□□ -2,59
Samsn1P57725 Gm26104-201ENSMUST00000157250 108 ntBASIC-1,16□□□□□ -2,6
Samsn1P57725 Gm23590-201ENSMUST00000157661 104 ntBASIC-1,16□□□□□ -2,6
Samsn1P57725 Gm23644-201ENSMUST00000157856 77 ntBASIC-1,16□□□□□ -2,6
Samsn1P57725 Gm22729-201ENSMUST00000158088 129 ntBASIC-1,16□□□□□ -2,6
Samsn1P57725 Gm25087-201ENSMUST00000101992 78 ntBASIC-1,17□□□□□ -2,6
Samsn1P57725 Gm25380-201ENSMUST00000175463 107 ntBASIC-1,17□□□□□ -2,6
Samsn1P57725 Gm24641-201ENSMUST00000178055 107 ntBASIC-1,17□□□□□ -2,6
Samsn1P57725 Gm25484-201ENSMUST00000178217 107 ntBASIC-1,17□□□□□ -2,6
Samsn1P57725 Gm26138-201ENSMUST00000179236 107 ntBASIC-1,17□□□□□ -2,6
Samsn1P57725 Gm22821-201ENSMUST00000179288 107 ntBASIC-1,17□□□□□ -2,6
Samsn1P57725 Gm24148-201ENSMUST00000082762 80 ntBASIC-1,17□□□□□ -2,6
Samsn1P57725 Gm23298-201ENSMUST00000083181 107 ntBASIC-1,17□□□□□ -2,6
Samsn1P57725 Gm25987-201ENSMUST00000083234 107 ntBASIC-1,17□□□□□ -2,6
Samsn1P57725 Gm22057-201ENSMUST00000083387 107 ntBASIC-1,17□□□□□ -2,6
Samsn1P57725 Gm25516-201ENSMUST00000083857 107 ntBASIC-1,17□□□□□ -2,6
Samsn1P57725 Gm26467-201ENSMUST00000097257 78 ntBASIC-1,17□□□□□ -2,6
Samsn1P57725 Traj34-201ENSMUST00000103707 58 ntAPPRIS P1 BASIC-1,18□□□□□ -2,6
Samsn1P57725 Gm22430-201ENSMUST00000158546 107 ntBASIC-1,18□□□□□ -2,6
Samsn1P57725 Mir451b-201ENSMUST00000196157 72 ntBASIC-1,18□□□□□ -2,6
Samsn1P57725 Mir450b-201ENSMUST00000102095 82 ntBASIC-1,19□□□□□ -2,6
Samsn1P57725 Mir876-201ENSMUST00000104659 81 ntBASIC-1,19□□□□□ -2,6
Samsn1P57725 Mir3064-201ENSMUST00000175532 67 ntBASIC-1,19□□□□□ -2,6
Samsn1P57725 Gm24674-201ENSMUST00000179194 104 ntBASIC-1,19□□□□□ -2,6
Samsn1P57725 Gm23570-201ENSMUST00000083029 104 ntBASIC-1,19□□□□□ -2,6
Samsn1P57725 Gm26125-201ENSMUST00000083357 107 ntBASIC-1,19□□□□□ -2,6
Samsn1P57725 Gm26124-201ENSMUST00000083359 108 ntBASIC-1,19□□□□□ -2,6
Samsn1P57725 Gm23316-201ENSMUST00000157997 114 ntBASIC-1,2□□□□□ -2,6
Samsn1P57725 Gm27935-201ENSMUST00000183894 79 ntBASIC-1,2□□□□□ -2,6
Samsn1P57725 Gm22454-201ENSMUST00000082583 107 ntBASIC-1,2□□□□□ -2,6
Samsn1P57725 Gm22429-201ENSMUST00000158553 130 ntBASIC-1,21□□□□□ -2,6
Samsn1P57725 Gm25626-201ENSMUST00000177631 107 ntBASIC-1,21□□□□□ -2,6
Samsn1P57725 Gm17522-202ENSMUST00000186631 174 ntTSL 1 (best) BASIC-1,21□□□□□ -2,6
Samsn1P57725 Gm17412-202ENSMUST00000189566 174 ntTSL 1 (best) BASIC-1,21□□□□□ -2,6
Samsn1P57725 Mir494-201ENSMUST00000093632 85 ntBASIC-1,21□□□□□ -2,6
Samsn1P57725 Mir297-1-201ENSMUST00000103800 76 ntBASIC-1,22□□□□□ -2,6
Samsn1P57725 Gm22845-201ENSMUST00000157712 104 ntBASIC-1,22□□□□□ -2,6
Samsn1P57725 Gm23477-201ENSMUST00000158882 128 ntBASIC-1,22□□□□□ -2,6
Samsn1P57725 Gm25815-201ENSMUST00000082755 107 ntBASIC-1,22□□□□□ -2,6
Samsn1P57725 Mir181b-1-201ENSMUST00000083524 80 ntBASIC-1,22□□□□□ -2,6
Samsn1P57725 Gm11111-201ENSMUST00000112956 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1,23□□□□□ -2,61
Samsn1P57725 Gm26491-201ENSMUST00000179268 121 ntBASIC-1,25□□□□□ -2,61
Samsn1P57725 Gm22805-201ENSMUST00000082739 107 ntBASIC-1,25□□□□□ -2,61
Samsn1P57725 Gm24612-201ENSMUST00000083267 107 ntBASIC-1,25□□□□□ -2,61
Samsn1P57725 Gm23573-201ENSMUST00000104408 107 ntBASIC-1,26□□□□□ -2,61
Samsn1P57725 Gm25112-201ENSMUST00000122680 104 ntBASIC-1,26□□□□□ -2,61
Samsn1P57725 Gm25326-201ENSMUST00000101903 107 ntBASIC-1,27□□□□□ -2,61
Samsn1P57725 Gm25493-201ENSMUST00000157375 103 ntBASIC-1,27□□□□□ -2,61
Samsn1P57725 Gm22381-201ENSMUST00000158186 107 ntBASIC-1,27□□□□□ -2,61
Samsn1P57725 Gm23856-201ENSMUST00000158380 99 ntBASIC-1,27□□□□□ -2,61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93,9 ms