Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Mir670-201ENSMUST00000102380 100 ntBASIC1,81□□□□□ -2,12
Hoxd11P23813 Gm24646-201ENSMUST00000157109 99 ntBASIC1,81□□□□□ -2,12
Hoxd11P23813 Gm24770-201ENSMUST00000158505 92 ntBASIC1,8□□□□□ -2,12
Hoxd11P23813 Snord91a-201ENSMUST00000104305 93 ntBASIC1,79□□□□□ -2,12
Hoxd11P23813 Gm23994-201ENSMUST00000158059 88 ntBASIC1,79□□□□□ -2,12
Hoxd11P23813 Gm24165-201ENSMUST00000082718 128 ntBASIC1,78□□□□□ -2,12
Hoxd11P23813 Gm23969-201ENSMUST00000083324 74 ntBASIC1,78□□□□□ -2,12
Hoxd11P23813 Gm24502-201ENSMUST00000158453 105 ntBASIC1,77□□□□□ -2,13
Hoxd11P23813 Mir28c-201ENSMUST00000200096 75 ntBASIC1,77□□□□□ -2,13
Hoxd11P23813 Gm25108-201ENSMUST00000122473 78 ntBASIC1,76□□□□□ -2,13
Hoxd11P23813 Gm23278-201ENSMUST00000157911 143 ntBASIC1,76□□□□□ -2,13
Hoxd11P23813 Mir695-201ENSMUST00000102261 109 ntBASIC1,74□□□□□ -2,13
Hoxd11P23813 Gm13577-201ENSMUST00000121365 205 ntBASIC1,74□□□□□ -2,13
Hoxd11P23813 Gm27711-201ENSMUST00000183802 118 ntBASIC1,74□□□□□ -2,13
Hoxd11P23813 AL772271.1-201ENSMUST00000196848 65 ntBASIC1,73□□□□□ -2,13
Hoxd11P23813 Gm23321-201ENSMUST00000104465 126 ntBASIC1,72□□□□□ -2,13
Hoxd11P23813 Gm23893-201ENSMUST00000158106 134 ntBASIC1,72□□□□□ -2,13
Hoxd11P23813 Gm25378-201ENSMUST00000104333 129 ntBASIC1,71□□□□□ -2,14
Hoxd11P23813 Gm22197-201ENSMUST00000116866 58 ntBASIC1,71□□□□□ -2,14
Hoxd11P23813 Gm24783-201ENSMUST00000157639 100 ntBASIC1,71□□□□□ -2,14
Hoxd11P23813 Gm20386-201ENSMUST00000174010 132 ntBASIC1,71□□□□□ -2,14
Hoxd11P23813 Gm27289-201ENSMUST00000183341 82 ntBASIC1,7□□□□□ -2,14
Hoxd11P23813 Gm23558-201ENSMUST00000157823 80 ntBASIC1,69□□□□□ -2,14
Hoxd11P23813 Gm22838-201ENSMUST00000158437 99 ntBASIC1,69□□□□□ -2,14
Hoxd11P23813 Mir18b-201ENSMUST00000103923 83 ntBASIC1,68□□□□□ -2,14
Hoxd11P23813 Gm24971-201ENSMUST00000175581 110 ntBASIC1,67□□□□□ -2,14
Hoxd11P23813 Gm25143-201ENSMUST00000082696 109 ntBASIC1,66□□□□□ -2,14
Hoxd11P23813 Gm25248-201ENSMUST00000175473 98 ntBASIC1,65□□□□□ -2,15
Hoxd11P23813 Mir7063-201ENSMUST00000184158 91 ntBASIC1,64□□□□□ -2,15
Hoxd11P23813 Mir367-201ENSMUST00000083479 75 ntBASIC1,64□□□□□ -2,15
Hoxd11P23813 Snord33-201ENSMUST00000083694 84 ntBASIC1,64□□□□□ -2,15
Hoxd11P23813 Gm10974-201ENSMUST00000107486 126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1,63□□□□□ -2,15
Hoxd11P23813 Gm25885-201ENSMUST00000157779 109 ntBASIC1,62□□□□□ -2,15
Hoxd11P23813 A730009L09Rik-202ENSMUST00000210306 201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1,62□□□□□ -2,15
Hoxd11P23813 Gm26472-201ENSMUST00000116760 83 ntBASIC1,61□□□□□ -2,15
Hoxd11P23813 Snord13-201ENSMUST00000157627 104 ntBASIC1,61□□□□□ -2,15
Hoxd11P23813 Mir6950-201ENSMUST00000184438 73 ntBASIC1,61□□□□□ -2,15
Hoxd11P23813 Gm22088-201ENSMUST00000158341 117 ntBASIC1,6□□□□□ -2,15
Hoxd11P23813 Gm38113-201ENSMUST00000193704 201 ntBASIC1,6□□□□□ -2,15
Hoxd11P23813 Gm22559-201ENSMUST00000157329 134 ntBASIC1,59□□□□□ -2,15
Hoxd11P23813 Gm24793-201ENSMUST00000104289 132 ntBASIC1,58□□□□□ -2,16
Hoxd11P23813 Gm26303-201ENSMUST00000116845 119 ntBASIC1,58□□□□□ -2,16
Hoxd11P23813 Gm25510-201ENSMUST00000116986 123 ntBASIC1,58□□□□□ -2,16
Hoxd11P23813 Gm42773-201ENSMUST00000196962 148 ntBASIC1,58□□□□□ -2,16
Hoxd11P23813 Gm44483-201ENSMUST00000197203 97 ntBASIC1,58□□□□□ -2,16
Hoxd11P23813 Mir362-201ENSMUST00000093592 65 ntBASIC1,58□□□□□ -2,16
Hoxd11P23813 Mir7651-201ENSMUST00000184154 64 ntBASIC1,56□□□□□ -2,16
Hoxd11P23813 Gm23531-201ENSMUST00000104567 68 ntBASIC1,55□□□□□ -2,16
Hoxd11P23813 Gm24296-201ENSMUST00000158297 106 ntBASIC1,54□□□□□ -2,16
Hoxd11P23813 Mir6365-201ENSMUST00000183990 101 ntBASIC1,54□□□□□ -2,16
Hoxd11P23813 Gm23821-201ENSMUST00000158738 106 ntBASIC1,53□□□□□ -2,16
Hoxd11P23813 mt-Tm-201ENSMUST00000082395 69 ntBASIC1,51□□□□□ -2,17
Hoxd11P23813 Gm22305-201ENSMUST00000082690 108 ntBASIC1,49□□□□□ -2,17
Hoxd11P23813 Mir27b-201ENSMUST00000083541 73 ntBASIC1,49□□□□□ -2,17
Hoxd11P23813 Mir1912-201ENSMUST00000175298 87 ntBASIC1,48□□□□□ -2,17
Hoxd11P23813 AC124196.2-201ENSMUST00000224835 145 ntBASIC1,48□□□□□ -2,17
Hoxd11P23813 Gm6358-201ENSMUST00000089101 156 ntAPPRIS ALT2 BASIC1,46□□□□□ -2,18
Hoxd11P23813 Mir664-201ENSMUST00000196796 69 ntBASIC1,45□□□□□ -2,18
Hoxd11P23813 Mir327-201ENSMUST00000199328 69 ntBASIC1,45□□□□□ -2,18
Hoxd11P23813 Gm24047-201ENSMUST00000102405 104 ntBASIC1,44□□□□□ -2,18
Hoxd11P23813 Gm23159-201ENSMUST00000175088 77 ntBASIC1,44□□□□□ -2,18
Hoxd11P23813 Gm24673-201ENSMUST00000116948 124 ntBASIC1,42□□□□□ -2,18
Hoxd11P23813 Gm24174-201ENSMUST00000158933 111 ntBASIC1,42□□□□□ -2,18
Hoxd11P23813 Gm23108-201ENSMUST00000178295 124 ntBASIC1,42□□□□□ -2,18
Hoxd11P23813 Gm23442-201ENSMUST00000082919 134 ntBASIC1,42□□□□□ -2,18
Hoxd11P23813 Gm22689-201ENSMUST00000102452 110 ntBASIC1,41□□□□□ -2,18
Hoxd11P23813 Gm24843-201ENSMUST00000158682 76 ntBASIC1,41□□□□□ -2,18
Hoxd11P23813 Mir219a-2-201ENSMUST00000083551 97 ntBASIC1,41□□□□□ -2,18
Hoxd11P23813 Gm26236-201ENSMUST00000175536 137 ntBASIC1,4□□□□□ -2,19
Hoxd11P23813 Gm24020-201ENSMUST00000180156 108 ntBASIC1,4□□□□□ -2,19
Hoxd11P23813 Gm45688-201ENSMUST00000210002 101 ntBASIC1,4□□□□□ -2,19
Hoxd11P23813 Gm45541-201ENSMUST00000210443 54 ntBASIC1,4□□□□□ -2,19
Hoxd11P23813 Gm23556-201ENSMUST00000157821 92 ntBASIC1,39□□□□□ -2,19
Hoxd11P23813 Snord42b-201ENSMUST00000083742 69 ntBASIC1,39□□□□□ -2,19
Hoxd11P23813 Mir6351-201ENSMUST00000183826 99 ntBASIC1,38□□□□□ -2,19
Hoxd11P23813 Gm22757-201ENSMUST00000102279 96 ntBASIC1,36□□□□□ -2,19
Hoxd11P23813 Mir344-2-201ENSMUST00000175446 80 ntBASIC1,36□□□□□ -2,19
Hoxd11P23813 Mir196a-2-201ENSMUST00000083554 85 ntBASIC1,35□□□□□ -2,19
Hoxd11P23813 Mir22-201ENSMUST00000083595 95 ntBASIC1,35□□□□□ -2,19
Hoxd11P23813 Gm22489-201ENSMUST00000116813 62 ntBASIC1,33□□□□□ -2,2
Hoxd11P23813 Gm24323-201ENSMUST00000175342 77 ntBASIC1,33□□□□□ -2,2
Hoxd11P23813 Mir211-201ENSMUST00000083651 106 ntBASIC1,33□□□□□ -2,2
Hoxd11P23813 Gm23749-201ENSMUST00000104223 131 ntBASIC1,32□□□□□ -2,2
Hoxd11P23813 Gm23221-201ENSMUST00000158118 93 ntBASIC1,29□□□□□ -2,2
Hoxd11P23813 Gm25521-201ENSMUST00000158393 108 ntBASIC1,29□□□□□ -2,2
Hoxd11P23813 Mir136-201ENSMUST00000199494 62 ntBASIC1,29□□□□□ -2,2
Hoxd11P23813 Gm23543-201ENSMUST00000158207 106 ntBASIC1,27□□□□□ -2,21
Hoxd11P23813 Gm26285-201ENSMUST00000177923 107 ntBASIC1,26□□□□□ -2,21
Hoxd11P23813 Gm23622-201ENSMUST00000082460 107 ntBASIC1,26□□□□□ -2,21
Hoxd11P23813 Mir1839-201ENSMUST00000175366 127 ntBASIC1,25□□□□□ -2,21
Hoxd11P23813 Mir7091-201ENSMUST00000184075 79 ntBASIC1,25□□□□□ -2,21
Hoxd11P23813 Traj35-201ENSMUST00000103706 65 ntAPPRIS P1 BASIC1,23□□□□□ -2,21
Hoxd11P23813 Gm24431-201ENSMUST00000104073 66 ntBASIC1,22□□□□□ -2,21
Hoxd11P23813 Scarna8-201ENSMUST00000158333 131 ntBASIC1,22□□□□□ -2,21
Hoxd11P23813 mt-Tl1-201ENSMUST00000082391 75 ntBASIC1,22□□□□□ -2,21
Hoxd11P23813 Gm24963-201ENSMUST00000157916 144 ntBASIC1,21□□□□□ -2,22
Hoxd11P23813 Mir192-201ENSMUST00000083589 89 ntBASIC1,21□□□□□ -2,22
Hoxd11P23813 Gm11116-201ENSMUST00000113257 54 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1,2□□□□□ -2,22
Hoxd11P23813 AC122210.2-201ENSMUST00000220216 115 ntBASIC1,2□□□□□ -2,22
Hoxd11P23813 Gm23335-201ENSMUST00000117021 90 ntBASIC1,19□□□□□ -2,22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109,3 ms