Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Gm24797-201ENSMUST00000178103 107 ntBASIC-3,41□□□□□ -2,96
ApobE9Q414 Gm25521-201ENSMUST00000158393 108 ntBASIC-3,41□□□□□ -2,96
ApobE9Q414 Gm24132-201ENSMUST00000104745 91 ntBASIC-3,42□□□□□ -2,96
ApobE9Q414 Gm24054-201ENSMUST00000158619 105 ntBASIC-3,43□□□□□ -2,96
ApobE9Q414 Svbp-204ENSMUST00000210595 150 ntTSL 5 BASIC-3,43□□□□□ -2,96
ApobE9Q414 Gm22578-201ENSMUST00000083730 107 ntBASIC-3,44□□□□□ -2,96
ApobE9Q414 Gm24387-201ENSMUST00000104625 90 ntBASIC-3,45□□□□□ -2,96
ApobE9Q414 Gm26441-201ENSMUST00000082590 104 ntBASIC-3,45□□□□□ -2,96
ApobE9Q414 Traj34-201ENSMUST00000103707 58 ntAPPRIS P1 BASIC-3,47□□□□□ -2,96
ApobE9Q414 Mir5624-201ENSMUST00000176635 61 ntBASIC-3,47□□□□□ -2,96
ApobE9Q414 Gm25834-201ENSMUST00000158916 101 ntBASIC-3,47□□□□□ -2,96
ApobE9Q414 Gm22260-201ENSMUST00000178643 107 ntBASIC-3,48□□□□□ -2,97
ApobE9Q414 Mir21b-201ENSMUST00000184317 108 ntBASIC-3,48□□□□□ -2,97
ApobE9Q414 Gm27521-201ENSMUST00000184022 64 ntBASIC-3,49□□□□□ -2,97
ApobE9Q414 Gm27747-201ENSMUST00000184707 85 ntBASIC-3,49□□□□□ -2,97
ApobE9Q414 Gm23841-201ENSMUST00000116951 114 ntBASIC-3,5□□□□□ -2,97
ApobE9Q414 Gm23111-201ENSMUST00000122652 105 ntBASIC-3,5□□□□□ -2,97
ApobE9Q414 Gm28438-201ENSMUST00000188299 345 ntBASIC-3,52□□□□□ -2,97
ApobE9Q414 Gm23047-201ENSMUST00000177661 94 ntBASIC-3,53□□□□□ -2,97
ApobE9Q414 Gm26257-201ENSMUST00000122500 107 ntBASIC-3,53□□□□□ -2,98
ApobE9Q414 Gm24438-201ENSMUST00000157893 115 ntBASIC-3,54□□□□□ -2,98
ApobE9Q414 Gm23406-201ENSMUST00000082537 122 ntBASIC-3,54□□□□□ -2,98
ApobE9Q414 Gm25970-201ENSMUST00000157165 86 ntBASIC-3,55□□□□□ -2,98
ApobE9Q414 Gm24651-201ENSMUST00000157107 107 ntBASIC-3,56□□□□□ -2,98
ApobE9Q414 Gm22989-201ENSMUST00000158313 86 ntBASIC-3,56□□□□□ -2,98
ApobE9Q414 Igkv13-78-1-201ENSMUST00000199298 200 ntBASIC-3,56□□□□□ -2,98
ApobE9Q414 Mir7681-201ENSMUST00000184834 72 ntBASIC-3,56□□□□□ -2,98
ApobE9Q414 Gm28011-201ENSMUST00000184097 175 ntBASIC-3,57□□□□□ -2,98
ApobE9Q414 Gm25654-201ENSMUST00000158467 88 ntBASIC-3,57□□□□□ -2,98
ApobE9Q414 Gm25542-201ENSMUST00000116889 94 ntBASIC-3,57□□□□□ -2,98
ApobE9Q414 mt-Tt-201ENSMUST00000082422 67 ntBASIC-3,57□□□□□ -2,98
ApobE9Q414 Zfp950-206ENSMUST00000178819 171 ntBASIC-3,58□□□□□ -2,98
ApobE9Q414 Gm17542-201ENSMUST00000169859 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-3,58□□□□□ -2,98
ApobE9Q414 Snord58b-201ENSMUST00000082937 66 ntBASIC-3,58□□□□□ -2,98
ApobE9Q414 Gm25678-201ENSMUST00000174984 73 ntBASIC-3,61□□□□□ -2,99
ApobE9Q414 Gm25599-201ENSMUST00000157816 103 ntBASIC-3,61□□□□□ -2,99
ApobE9Q414 Gm22681-201ENSMUST00000083853 106 ntBASIC-3,61□□□□□ -2,99
ApobE9Q414 Gm27579-201ENSMUST00000158113 63 ntBASIC-3,61□□□□□ -2,99
ApobE9Q414 Gm25254-201ENSMUST00000157239 104 ntBASIC-3,63□□□□□ -2,99
ApobE9Q414 Gm26393-201ENSMUST00000157625 129 ntBASIC-3,63□□□□□ -2,99
ApobE9Q414 Mir1955-201ENSMUST00000158014 98 ntBASIC-3,63□□□□□ -2,99
ApobE9Q414 Gm23856-201ENSMUST00000158380 99 ntBASIC-3,63□□□□□ -2,99
ApobE9Q414 Mir582-201ENSMUST00000103758 81 ntBASIC-3,64□□□□□ -2,99
ApobE9Q414 Mir1898-201ENSMUST00000122643 83 ntBASIC-3,64□□□□□ -2,99
ApobE9Q414 Gm23345-201ENSMUST00000083817 150 ntBASIC-3,64□□□□□ -2,99
ApobE9Q414 Gm22056-201ENSMUST00000083386 81 ntBASIC-3,65□□□□□ -2,99
ApobE9Q414 Gm27465-201ENSMUST00000184290 91 ntBASIC-3,65□□□□□ -2,99
ApobE9Q414 Gm24150-201ENSMUST00000082759 104 ntBASIC-3,65□□□□□ -2,99
ApobE9Q414 Mir3064-201ENSMUST00000175532 67 ntBASIC-3,66□□□□□ -3
ApobE9Q414 Mir875-201ENSMUST00000104698 78 ntBASIC-3,66□□□□□ -3
ApobE9Q414 Gm23651-201ENSMUST00000116755 120 ntBASIC-3,66□□□□□ -3
ApobE9Q414 Gm23369-201ENSMUST00000175406 105 ntBASIC-3,67□□□□□ -3
ApobE9Q414 Gm25740-201ENSMUST00000180247 107 ntBASIC-3,67□□□□□ -3
ApobE9Q414 Gm26204-201ENSMUST00000082906 107 ntBASIC-3,67□□□□□ -3
ApobE9Q414 Gm22199-201ENSMUST00000122660 126 ntBASIC-3,69□□□□□ -3
ApobE9Q414 Gm24331-201ENSMUST00000175099 67 ntBASIC-3,69□□□□□ -3
ApobE9Q414 Gm23801-201ENSMUST00000175561 67 ntBASIC-3,69□□□□□ -3
ApobE9Q414 Gm24485-201ENSMUST00000178283 67 ntBASIC-3,69□□□□□ -3
ApobE9Q414 Gm23141-201ENSMUST00000178682 94 ntBASIC-3,69□□□□□ -3
ApobE9Q414 mt-Tv-201ENSMUST00000082389 69 ntBASIC-3,69□□□□□ -3
ApobE9Q414 Gm11111-201ENSMUST00000112956 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-3,7□□□□□ -3
ApobE9Q414 Gm23468-201ENSMUST00000157125 108 ntBASIC-3,7□□□□□ -3
ApobE9Q414 Gm23649-201ENSMUST00000179007 107 ntBASIC-3,7□□□□□ -3
ApobE9Q414 Gm25753-201ENSMUST00000116792 121 ntBASIC-3,71□□□□□ -3
ApobE9Q414 Gm45859-201ENSMUST00000212794 214 ntBASIC-3,72□□□□□ -3
ApobE9Q414 Gm25183-201ENSMUST00000157752 106 ntBASIC-3,72□□□□□ -3,01
ApobE9Q414 Gm44303-201ENSMUST00000196348 83 ntBASIC-3,72□□□□□ -3,01
ApobE9Q414 Gm24378-201ENSMUST00000122699 106 ntBASIC-3,73□□□□□ -3,01
ApobE9Q414 Gm20305-201ENSMUST00000193226 177 ntBASIC-3,74□□□□□ -3,01
ApobE9Q414 Gm23349-201ENSMUST00000158432 98 ntBASIC-3,74□□□□□ -3,01
ApobE9Q414 Gm44392-201ENSMUST00000196758 115 ntBASIC-3,74□□□□□ -3,01
ApobE9Q414 Gm13339-201ENSMUST00000120651 510 ntBASIC-3,75□□□□□ -3,01
ApobE9Q414 Gm23258-201ENSMUST00000158319 106 ntBASIC-3,76□□□□□ -3,01
ApobE9Q414 Gm23581-201ENSMUST00000158531 63 ntBASIC-3,76□□□□□ -3,01
ApobE9Q414 Gm38280-201ENSMUST00000192610 158 ntBASIC-3,76□□□□□ -3,01
ApobE9Q414 Gm22770-201ENSMUST00000158368 67 ntBASIC-3,76□□□□□ -3,01
ApobE9Q414 Gm22951-201ENSMUST00000179471 107 ntBASIC-3,76□□□□□ -3,01
ApobE9Q414 Gm26437-201ENSMUST00000082595 105 ntBASIC-3,76□□□□□ -3,01
ApobE9Q414 Gm27987-201ENSMUST00000184023 93 ntBASIC-3,78□□□□□ -3,01
ApobE9Q414 Gm37404-201ENSMUST00000195726 359 ntBASIC-3,78□□□□□ -3,01
ApobE9Q414 Mir463-201ENSMUST00000093570 75 ntBASIC-3,79□□□□□ -3,02
ApobE9Q414 Mir706-201ENSMUST00000102262 84 ntBASIC-3,79□□□□□ -3,02
ApobE9Q414 Gm24241-201ENSMUST00000157787 145 ntBASIC-3,79□□□□□ -3,02
ApobE9Q414 Gm26052-201ENSMUST00000104646 84 ntBASIC-3,8□□□□□ -3,02
ApobE9Q414 Gm25362-201ENSMUST00000158854 105 ntBASIC-3,8□□□□□ -3,02
ApobE9Q414 AC157278.1-201ENSMUST00000221621 148 ntBASIC-3,81□□□□□ -3,02
ApobE9Q414 Gm24131-201ENSMUST00000158539 107 ntBASIC-3,82□□□□□ -3,02
ApobE9Q414 mt-Ti-201ENSMUST00000082393 69 ntBASIC-3,82□□□□□ -3,02
ApobE9Q414 Gm26225-201ENSMUST00000082508 135 ntBASIC-3,82□□□□□ -3,02
ApobE9Q414 Gm27450-201ENSMUST00000104632 90 ntBASIC-3,82□□□□□ -3,02
ApobE9Q414 Mir471-201ENSMUST00000093596 67 ntBASIC-3,82□□□□□ -3,02
ApobE9Q414 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-3,83□□□□□ -3,02
ApobE9Q414 Gm25390-201ENSMUST00000157341 103 ntBASIC-3,83□□□□□ -3,02
ApobE9Q414 Gm24495-201ENSMUST00000178575 79 ntBASIC-3,83□□□□□ -3,02
ApobE9Q414 Gm22253-201ENSMUST00000179870 79 ntBASIC-3,83□□□□□ -3,02
ApobE9Q414 Gm22775-201ENSMUST00000177630 120 ntBASIC-3,85□□□□□ -3,03
ApobE9Q414 Gm23569-201ENSMUST00000180120 120 ntBASIC-3,85□□□□□ -3,03
ApobE9Q414 Gm25289-201ENSMUST00000122799 119 ntBASIC-3,86□□□□□ -3,03
ApobE9Q414 Mir466b-1-201ENSMUST00000177988 82 ntBASIC-3,86□□□□□ -3,03
ApobE9Q414 Gm24225-201ENSMUST00000158825 98 ntBASIC-3,89□□□□□ -3,03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113,7 ms