Protein–RNA interactions for Protein: Q6H1V1

Best3, Bestrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best3Q6H1V1 Gm27645-201ENSMUST00000183348 77 ntBASIC-0,07□□□□□ -2,42
Best3Q6H1V1 Gm24918-201ENSMUST00000083022 130 ntBASIC-0,07□□□□□ -2,42
Best3Q6H1V1 Traj35-201ENSMUST00000103706 65 ntAPPRIS P1 BASIC-0,08□□□□□ -2,42
Best3Q6H1V1 n-R5s171-201ENSMUST00000104128 79 ntBASIC-0,08□□□□□ -2,42
Best3Q6H1V1 Gm45125-201ENSMUST00000206908 151 ntBASIC-0,08□□□□□ -2,42
Best3Q6H1V1 n-R5s42-201ENSMUST00000082697 104 ntBASIC-0,08□□□□□ -2,42
Best3Q6H1V1 Gm24843-201ENSMUST00000158682 76 ntBASIC-0,09□□□□□ -2,42
Best3Q6H1V1 Gm27977-201ENSMUST00000185159 111 ntBASIC-0,09□□□□□ -2,42
Best3Q6H1V1 Mir191-201ENSMUST00000196210 74 ntBASIC-0,09□□□□□ -2,42
Best3Q6H1V1 Gm24203-201ENSMUST00000082949 114 ntBASIC-0,09□□□□□ -2,42
Best3Q6H1V1 Gm24256-201ENSMUST00000083696 84 ntBASIC-0,09□□□□□ -2,42
Best3Q6H1V1 Gm23494-201ENSMUST00000116830 126 ntBASIC-0,1□□□□□ -2,43
Best3Q6H1V1 Gm24593-201ENSMUST00000122507 106 ntBASIC-0,1□□□□□ -2,43
Best3Q6H1V1 AL845349.1-201ENSMUST00000213794 78 ntBASIC-0,1□□□□□ -2,43
Best3Q6H1V1 Gm22679-201ENSMUST00000116975 100 ntBASIC-0,11□□□□□ -2,43
Best3Q6H1V1 Gm22813-201ENSMUST00000199948 123 ntBASIC-0,11□□□□□ -2,43
Best3Q6H1V1 AC122335.1-201ENSMUST00000217587 175 ntBASIC-0,11□□□□□ -2,43
Best3Q6H1V1 Gm23306-201ENSMUST00000179058 105 ntBASIC-0,13□□□□□ -2,43
Best3Q6H1V1 Gm23570-201ENSMUST00000083029 104 ntBASIC-0,14□□□□□ -2,43
Best3Q6H1V1 Gm22962-201ENSMUST00000157962 73 ntBASIC-0,15□□□□□ -2,43
Best3Q6H1V1 Gm25440-201ENSMUST00000158279 154 ntBASIC-0,15□□□□□ -2,43
Best3Q6H1V1 Mir142b-201ENSMUST00000083486 115 ntBASIC-0,15□□□□□ -2,43
Best3Q6H1V1 Gm26395-201ENSMUST00000104094 132 ntBASIC-0,16□□□□□ -2,44
Best3Q6H1V1 Gm24495-201ENSMUST00000178575 79 ntBASIC-0,17□□□□□ -2,44
Best3Q6H1V1 Gm22253-201ENSMUST00000179870 79 ntBASIC-0,17□□□□□ -2,44
Best3Q6H1V1 Gm23483-201ENSMUST00000104179 108 ntBASIC-0,18□□□□□ -2,44
Best3Q6H1V1 Gm23918-201ENSMUST00000175253 106 ntBASIC-0,18□□□□□ -2,44
Best3Q6H1V1 Gm11116-201ENSMUST00000113257 54 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0,19□□□□□ -2,44
Best3Q6H1V1 Gm24381-201ENSMUST00000122697 104 ntBASIC-0,19□□□□□ -2,44
Best3Q6H1V1 Gm23726-201ENSMUST00000178937 67 ntBASIC-0,19□□□□□ -2,44
Best3Q6H1V1 Gm24455-201ENSMUST00000083348 131 ntBASIC-0,19□□□□□ -2,44
Best3Q6H1V1 Mir672-201ENSMUST00000102331 100 ntBASIC-0,2□□□□□ -2,44
Best3Q6H1V1 Gm22942-201ENSMUST00000158563 124 ntBASIC-0,2□□□□□ -2,44
Best3Q6H1V1 Gm22324-201ENSMUST00000158903 114 ntBASIC-0,2□□□□□ -2,44
Best3Q6H1V1 Gm25032-201ENSMUST00000175411 84 ntBASIC-0,2□□□□□ -2,44
Best3Q6H1V1 Gm23056-201ENSMUST00000082803 111 ntBASIC-0,2□□□□□ -2,44
Best3Q6H1V1 Mir7038-201ENSMUST00000184833 71 ntBASIC-0,21□□□□□ -2,44
Best3Q6H1V1 Mir717-201ENSMUST00000102259 109 ntBASIC-0,22□□□□□ -2,44
Best3Q6H1V1 Gm11333-201ENSMUST00000119479 148 ntBASIC-0,22□□□□□ -2,44
Best3Q6H1V1 Gm25149-201ENSMUST00000157119 82 ntBASIC-0,22□□□□□ -2,44
Best3Q6H1V1 Mir3470a-201ENSMUST00000175223 77 ntBASIC-0,22□□□□□ -2,44
Best3Q6H1V1 Gm24508-201ENSMUST00000180104 107 ntBASIC-0,22□□□□□ -2,44
Best3Q6H1V1 Gm24201-201ENSMUST00000082946 125 ntBASIC-0,22□□□□□ -2,44
Best3Q6H1V1 Gm22757-201ENSMUST00000102279 96 ntBASIC-0,23□□□□□ -2,45
Best3Q6H1V1 Gm24887-201ENSMUST00000104386 108 ntBASIC-0,23□□□□□ -2,45
Best3Q6H1V1 Gm22165-201ENSMUST00000158414 103 ntBASIC-0,23□□□□□ -2,45
Best3Q6H1V1 Snord91a-201ENSMUST00000104305 93 ntBASIC-0,24□□□□□ -2,45
Best3Q6H1V1 Gm25510-201ENSMUST00000116986 123 ntBASIC-0,24□□□□□ -2,45
Best3Q6H1V1 Mir6904-201ENSMUST00000183443 67 ntBASIC-0,24□□□□□ -2,45
Best3Q6H1V1 Gm27263-201ENSMUST00000184760 76 ntBASIC-0,24□□□□□ -2,45
Best3Q6H1V1 Snord45b-201ENSMUST00000082797 71 ntBASIC-0,24□□□□□ -2,45
Best3Q6H1V1 Gm27749-201ENSMUST00000183651 125 ntBASIC-0,25□□□□□ -2,45
Best3Q6H1V1 Snord42b-201ENSMUST00000083742 69 ntBASIC-0,25□□□□□ -2,45
Best3Q6H1V1 Traj34-201ENSMUST00000103707 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0,26□□□□□ -2,45
Best3Q6H1V1 Gm25382-201ENSMUST00000157811 97 ntBASIC-0,27□□□□□ -2,45
Best3Q6H1V1 Gm23017-201ENSMUST00000177583 72 ntBASIC-0,27□□□□□ -2,45
Best3Q6H1V1 Mir214-201ENSMUST00000083582 110 ntBASIC-0,27□□□□□ -2,45
Best3Q6H1V1 Gm25249-201ENSMUST00000175471 78 ntBASIC-0,28□□□□□ -2,45
Best3Q6H1V1 Gm24377-201ENSMUST00000104398 131 ntBASIC-0,29□□□□□ -2,46
Best3Q6H1V1 Gm25338-201ENSMUST00000116849 120 ntBASIC-0,29□□□□□ -2,46
Best3Q6H1V1 Gm22087-201ENSMUST00000158339 88 ntBASIC-0,29□□□□□ -2,46
Best3Q6H1V1 Gm22298-201ENSMUST00000082662 133 ntBASIC-0,29□□□□□ -2,46
Best3Q6H1V1 Snora16a-201ENSMUST00000083163 136 ntBASIC-0,29□□□□□ -2,46
Best3Q6H1V1 Gm24400-201ENSMUST00000157865 107 ntBASIC-0,3□□□□□ -2,46
Best3Q6H1V1 Gm22157-201ENSMUST00000158410 104 ntBASIC-0,3□□□□□ -2,46
Best3Q6H1V1 Gm37832-201ENSMUST00000118935 189 ntBASIC-0,31□□□□□ -2,46
Best3Q6H1V1 Gm23590-201ENSMUST00000157661 104 ntBASIC-0,31□□□□□ -2,46
Best3Q6H1V1 Gm45688-201ENSMUST00000210002 101 ntBASIC-0,31□□□□□ -2,46
Best3Q6H1V1 Mir145a-201ENSMUST00000083658 70 ntBASIC-0,31□□□□□ -2,46
Best3Q6H1V1 Traj38-201ENSMUST00000103704 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0,32□□□□□ -2,46
Best3Q6H1V1 Gm22595-201ENSMUST00000104250 130 ntBASIC-0,32□□□□□ -2,46
Best3Q6H1V1 Mir378c-201ENSMUST00000184478 99 ntBASIC-0,32□□□□□ -2,46
Best3Q6H1V1 Gm11084-201ENSMUST00000112062 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0,33□□□□□ -2,46
Best3Q6H1V1 Gm25472-201ENSMUST00000175454 78 ntBASIC-0,33□□□□□ -2,46
Best3Q6H1V1 Gm21836-201ENSMUST00000178787 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0,34□□□□□ -2,46
Best3Q6H1V1 AC167019.1-201ENSMUST00000227913 106 ntBASIC-0,34□□□□□ -2,46
Best3Q6H1V1 Mir7094-2-201ENSMUST00000184622 60 ntBASIC-0,35□□□□□ -2,47
Best3Q6H1V1 Gm27784-201ENSMUST00000184926 113 ntBASIC-0,35□□□□□ -2,47
Best3Q6H1V1 Mir7094-1-201ENSMUST00000199671 60 ntBASIC-0,35□□□□□ -2,47
Best3Q6H1V1 Gm25802-201ENSMUST00000082639 77 ntBASIC-0,35□□□□□ -2,47
Best3Q6H1V1 Gm24336-201ENSMUST00000104203 146 ntBASIC-0,36□□□□□ -2,47
Best3Q6H1V1 Gm23955-201ENSMUST00000157214 100 ntBASIC-0,36□□□□□ -2,47
Best3Q6H1V1 Gm24946-201ENSMUST00000158332 106 ntBASIC-0,36□□□□□ -2,47
Best3Q6H1V1 Gm24823-201ENSMUST00000175092 91 ntBASIC-0,36□□□□□ -2,47
Best3Q6H1V1 Mir3064-201ENSMUST00000175532 67 ntBASIC-0,36□□□□□ -2,47
Best3Q6H1V1 Gm6607-201ENSMUST00000215035 328 ntBASIC-0,37□□□□□ -2,47
Best3Q6H1V1 Gm23376-201ENSMUST00000082938 160 ntBASIC-0,37□□□□□ -2,47
Best3Q6H1V1 Mir96-201ENSMUST00000083652 106 ntBASIC-0,37□□□□□ -2,47
Best3Q6H1V1 Gm11111-201ENSMUST00000112956 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0,38□□□□□ -2,47
Best3Q6H1V1 Gm23477-201ENSMUST00000158882 128 ntBASIC-0,38□□□□□ -2,47
Best3Q6H1V1 Mir344h-1-201ENSMUST00000174922 60 ntBASIC-0,38□□□□□ -2,47
Best3Q6H1V1 Gm24971-201ENSMUST00000175581 110 ntBASIC-0,38□□□□□ -2,47
Best3Q6H1V1 Mir344h-2-201ENSMUST00000175612 60 ntBASIC-0,38□□□□□ -2,47
Best3Q6H1V1 Gm27415-201ENSMUST00000183720 95 ntBASIC-0,38□□□□□ -2,47
Best3Q6H1V1 Gm25137-201ENSMUST00000083251 110 ntBASIC-0,38□□□□□ -2,47
Best3Q6H1V1 Mir18b-201ENSMUST00000103923 83 ntBASIC-0,39□□□□□ -2,47
Best3Q6H1V1 Gm23607-201ENSMUST00000104550 126 ntBASIC-0,39□□□□□ -2,47
Best3Q6H1V1 Mir466l-201ENSMUST00000104866 121 ntBASIC-0,39□□□□□ -2,47
Best3Q6H1V1 Gm25596-201ENSMUST00000178368 107 ntBASIC-0,39□□□□□ -2,47
Best3Q6H1V1 Mir183-201ENSMUST00000083685 70 ntBASIC-0,39□□□□□ -2,47
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